Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC02482:25
Sequence Length
2610 nt
GC Content
0.5410
UACAAUCCCUGAGCUAGACACAAAGGUUCUCCAAGGCCCCAGCAGAGUCGAUUGGUAUAUUCACAAACCCUGAGCUAGACACACGGUGCUGAUUGGUGUAUUUACAAUCCCUGAGCUAGACAUAAAGGUUCUCCACAUCCCCACCAGACUCAGGAGCCCAGCUGGCUUCACCAAGUGGAUCCCACACCAGGGCUGCAGGUGGAGCUGCCUGCGAGAACGGCACCGUGCGCCCACACUCCUCAGCCCUUGGGUGGUGAUGGGACUGGGCGCCGUGGAGCAGGGGGUGGUGCUCGUCGAGGAGGCUCGGGCAGCACAGGAGCCCAUGGAGGGGGUGGGAGGCUCAGGCAUGGCGGGCUGCAGGUCCCGAGCCCUGCCCCUCGGAAAGGCAGCUAAGGCCCGGUGAGAAAUCGAGCACAGCGCCGGUGGGCUGGCACUGCUGAGGGACCCAGUACACCCUCCGCAGCCGCUGGCCCGGGUGCUAAGCCCCUCAUUGCCGGGGGCUGGCAGGGCCAGCCGGCUGCUCCGAGUGCGGGGCCCACCAAGCCCACGCCCACCCUGAACUCCAGCUGGCCCGCAAGCGCCGUGUGCAGCCCCGGUGCCCGCUCGCGCCUCUCCCUCCACACCUCCCUGCAAGCUGAGAGAGCCGGCUCUGGCCUUGGCCAGCCCAGAAAGGGGCCUCCACAGUGCAGCAGUGGGCUGAAGGGCUCCUCAAGUGCUGCCAAAGUGGGAGCCCAGGCAGAGGAGGCACCGAGAGUGAGCGAGGGCUGUGAGGACUGCCAGCACACUGUCACCUCUCACCAACAUUCUAAAUCAUAAACACCCAGGCCGGGCGUGUGGCUCACGCCUAUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGUGAGAGGAUCGCUUGAGCUCAGGAGUUCCAUACCAGCCUGGGCAACAAGGGAAAAAACCCUACCAAAAAAAACACAAGAAAUUAGCUGGGCGUGGUGGCGCGUGCCGAUAGUCCCAGCUACUUGAGAGGCUGAGCCGGGAAGAUUGCUUGAGCCCAGCAGGUCGAGACCGAGGUGAGCUCUGAACGCCUGAUUGCGCCACUGCACCCCAGCCCAGUGACAGGGCGAGACCCUGUCUCAAAAUAAAUAAAUAAAAAUAAUAAACAACCGAAUUCAGUGGUCCCGUUAGAAUAUUCCAGGCUCCGAGAAGCCAGGUGCUCACAGCGUCGGGAUUUGCCCCCAGCCAGGGCCUCCGCUCCCUCUUGCCUCGGGCAGAUGCUCCUGGAACACAGAGCUGCGGCCUCGGUGCUGAUGCUGAGUGCUGUGACCCAGCCUCCCCCUACUUUUUUCCUAAGGGUAUAAGCUUCACUCUGCCUGGGGCUUUGGCUGUAAGUUGGAGUCUGGCUUUACCCACUGUGGGCACCCAAGGCCAAGGUGGGUCUGAUUCACCACUGUUUCCUCAGCCCUGCCAGGCUCUGAAUAUGCCUUUAGGAAUCAUUCUGGAAGAUUUCUUUCUUCACUGGACUAUAUAAGUGCCUCUGCGAGAAAACAGGCCCUAGGGGCAGGUACUUAGUCAGUUUAGUCAUCUGUUUCCUCAGCUUGAAAUGGGCUUGGCAUACAGCAGGAGCCCAGUAAAUGUUGCUUUAAUGCUCAUUUCCCAAGAGAUCUUUAUUAAGCACCCACUGCAUGUCAUUGUGUCUAGGCUUAUUCACUGUGUACCUCUAGCAGAAAGUUAAGGGGACCCUCCAUGCUUGAUGGCCAGAGGUCACUCUCAGCUCCUACAGGUCACUCUCCGGUCCUUAAACGUGGCCCUCUCCAUCUUCAAAGCCAGUAAGAGCAUGUCGGAUCCUUCUUAUCCUUCCAGCCUCUCUGUCAUCCCCUUCUGCUCCCAGCUGGAGAAAACUCUGCUUUUAAGGGGCUUGCCAUGGUCCAAAUAUGUGAGUCCCCCCAAAAUUCAUAUGUUGCAAAGCAAUCCCCAAUGUGAUGAUAUUAGGAGGUGGGGUCUUUGGGAGGUGAUGUGGUCAUGAAGGCUCAGCUUUCAUGAAUGAGAUUAGCACCCUCAUAAAACAACUCCACAGGGCCGCCUUACCCCUUCUGCUGUGGGAGGUUAUAGCAAAAAGAUGGGCUUCUAUGAACCAGAAGUGGGCCCUCACCAGGCACCAAACCUGCUGGCACCGUGAUCUUGUACUGCUCAGCCUUCAGAACUCAGAAAAUACAUUUCUGUUGUUUAGAAGACACCCAGUUUCUGGUAUUUUGUUAGAGCAGCGUGAACGGACUAAAAUAGUGCUUAUGUGGUUGUGUAACAGCAUCGAUUCCAUGUUAAAGAACAAUUUUGCUUGCUCAAUUAUAAUUAUUGCUUUGCUUAAGUUUUAGACUAUGCUAAAAACAGCCUCAGGACCUUCAGCACUGAUCAACAAUCCUGGGCAUGGGCUGACCGACAGUUUUCACCCAGAGAGUGAAGAUCAUGGAGGAGCCAUCUUAAAUUCUGCCCAGCGCAGGCUCCCAGGAAUCCUAAUGUCACGAUCUCACUGCAGCCAAUGUGACAAACACAGCAGUAAUUAAGUCUAGAGAGCUAAACACACCUCAAAAAGAAUUGUCUCUUGGUAUGAGUGGAAUGGAAUAAAAUACAUGGAAACCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-971.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1013.22
Frequency: 0.0000
Diversity: 661.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........(((((((((.(((.......((((((((((((((((((((((.(((((...(((...(((((..(......((((((((((((((.........)))))...(((((.........)))))(((.((((.(((((.......((((((.....)))))).....((((...)))).(.(((((((.((((((.((.((((((.......)))..).)))))))).))...))))))).)))))).)))))))...))))))))))..))))).)))))))).)))).(((((((.(((.....(((((((....(((((((((((.((((((.(((.(((.((((...((((((((((((((((..((((((...((((((....((((((((......(.((..((((((..(((((((((.((((.(((((..........))))).))))..)))))))))))))))..))).....))))))))(((((((...))))))))))))))))))).))))))).......(((((.((.......(((((((((((......((((((..(((((((((((((((.(.(((((((...((((........(((((((((..(((.....))).((((((.((.(((((.(((......((((((((...((((.((....)).))))..)))))))).....)))))))).)).))))))...)))).)))))....))))))))))).).)))).).)).))))..)))).......(((((((((........................(((((((((((.....)))))))....((((((....))))))))))..)))))))))..))))))))))..))))))).......)).)))))....((((......)))).....................((((((((..((.((((....)))).))..))))))))(((((...((((.((((((.......)))).)).))))...)))))..((..((((((.........(((((.(.(((((((.......((((.......))))(((((...)))))...................................))))))).).)))))......((.((((......)))).)).))))))..))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))((((...))))...)))))))...(((((.(((.((((.(((....))).))))))).))))).))))))))))((((............))))..........)))))).)))))))))))).......)))..))))))))).(((((((.(((.(......).))).))))))).............((((((.....((((..((((.........)))).))))..........(((((......)))))((((((((...((((((((((((........)))((((...)))))))))))))...))))))))..((((((((((((........(((((((.((.....))..)))))))..(((((..((......)).))))).(((((((((((((.....(((.....))).(((.....(.((((((((((...(((((....(((((((.(..(((.(((((((........(((((((((..((.((((((....((..((...((....))....))..)).....))))))))..)))))....))))(((..((.((..(..((((.......))))..)..))))..)))...)))))))..)))..).)))))))......((((......((((.((((....((...(((((((((((.........)))))))))))))...)))).))))...(((((((((((((((((.(((((....(((.(((..(((((((((((((((...))))))))))(((((.........))))).........)))))..))).))).))))).))((((((((....))))))))..(((((((.(((((.....((((.((((((((.......))).)))...)).))))..((((((((((.((((.(((...((((.((((.((((((.....))))))..)))).))))....((((...))))..........((((((.((((..(.((((...)))).)...((((((((.(((..((((..(((....((((....))))))).))))))).))))))))....)))).))))))...((((((......))))))...(((.(((((...(((....))).......)))))))).((((.(((..........))))))))))))))))))))))))))))))))))))...(((((...(((....)))..))))).))))))))))).....)))).))))....((((.....)))))))))...)))))))))).).....)))........)))))....))))))))..)))).))))))))...........))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,{{.,(((((((((.(((.......((((((((((((((((((((((.(((((...({(...(((({.,({.....((((((((((((((.........))))),,,(((((.........}}}}},{{.{{{{.{{{{{,,.,,,,||((((.....))))}}.,...((({..,||}}.{{(((((((.((((((.((,(({{{{......,)))..),)}}})))}.}},.,))))))}.}))))).))))))}.,,)))))))))),,))))).)))))))).)))),(((((((.(((...,.(((((((....((((((((({((((((((.(((.(((.((({..,((((((((((((((((..((((({..(((.(((...((.((((.....)))).)).,})))))((((((((((....(({{.(((.(((.{{{{.,.|||.((((((((((((((...((((,{((((({.......))))))))))))))))))}}))))))...}})))).))))))..,.}))))}.)))))))..(((((((,{{{(((...{{{{{|,,((((((((((((({{,({(((((((..(((((,,,,,...{((((((({..(((.....))).((((((.((.(((({,(((......((((((((...((((.((....)).))))..))))))))...}.)))))))).)).))))))..,)))).)))))....)))))}))))).)}))}}.).)).))))..)))).,.....(((((((((........................(((((((((((.....)))))))....((((({....})))))))))..)))))))))..})))})}))),,))))))).......((((((|.....((((......)))).......................((((((.{((((((((({.|,|{{{..{{{{,(({.{{,.,..}|||||}|{||},..|}}}|||({{{.||,|.|||},,,,}}.,|,||.}}}}....,}}|||..})))})))})).,}}}))).,.|.(((((((.....))))))).}.......................,,,.{{{{.......))))...}}}.......}))))))))))))..),}))).))},......,}))))))))))))))))).)))))))))))))))))((((...))))...)))))))...{{{{{.{{{.((((,(({,...,}}.))))))),))))).)))))))))){{{(.,,,,,.....,)))),,........})))))}}))))))))))).......)))..))))))))}.(((((((.(((.(......).))).))))))).,{,.......,,(,,,,,.}}|.{{{{..{||{,,.......))}}.}}}),,,||,,,,.(((((......)))))((((((((...((((((((((((........)))((((...)))))))))))))...)))))))),,.(((,{,{,.|||,.,,...{((((((.((.....))..))))))),,,..,||||{......((((((...((((((((({{({.....(((.....))).,{{....{{.((((((((((.,.((((({,..(((((((,(,.{({,(((((({.,,..,,,(((((((((..(((((((((....((..((...{(,...,,....))..)).....)))))))))})))))....,})}{{{..{||||,}|..((((.......)}}}..|,.|||||,}}|.,,||}}}}}..}}}..,.))}))))......{{{{......((((.((((..,,{{...(((((((((((.........))))))))))))),..)))).))))...{{|||{||{{{{||||||(((({...,(((.(((,,{((((((((((((((...))))))))))(((((.........))))).........))})),,))).))),)))}},}}||||{{({,,,,}}}}}}},..((((({{{(((((.....((((.{{((((((.......))).)))...)}.))))..((((((((((.{(((.(((.,.((((.((((.((((((.....))))))..)))).))))....((((...))))......,,,,((((((,({{{..(.((((...)))).)..,{(((((((.(({..{(((..{{{,...{{{{....}}}}}}}.))))))).))))))}}....,})}}}})},,..{((((((......)))))},}.(((.(((((...{{{....})}.......)))))))).{(((.(({......},,.}}})))))))))))))))))))))))))))))))))...,{(({{..{{,,,}}))},,}}}},.})))}}}||||,....}}}}.}}})....||||,,...))))))))).,.)))))))))).},....,,}........,}))}...})))))))).))))))))))})}}........,,.))).....
Back