Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LINC02482:7

Sequence Length

892 nt

GC Content

0.5348

GCCCGCUGUAGCGCCACAGCUCUUUGGGCGUUGAUUCUAGGGUCAGGGCCCUCACUCACACUGCUGGAAGGUUAAAGUCGACUUCACGCUAGUUUAAGGAAAUAUCUGACGCUGAUAACCAUGUCCCAAGCACUGCUCUAAGUUCCCAAUGUGUCCGGAAUUGGUGGGUUCUUGGUCUCACUGACUUCAAGAAUGAAGCCACGGACCCUCGCGGCUGGAGUGCAGUGACAUGAUCUCAGCUCAUUGCAGCCUCAACCUCCCAGGCACAAGCGAUCCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUACAGACGGUGACUCAAUCUGCCCAGGCUGGAGUGCGGUGACCUGAACACAGCUCACUGAAGCCUUGACUUCCCGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGGAGCUGGGACCACAGUAGAGACGGAGUUUCACCACGUUGGCCAGGAUGGUCUUGAUCUGCUGACCUCGUGAUCCGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCUACCGCGGUGGGCCCAUGCUGACUGUUUUAUCCAUUCUUUCUGGGUUGCUGUGUAACGUGUGUCAGGCCUUGUAUGAAAUGUGCCUCAGAGGUUGCCCCCUCCAGGGGCUUUGCAGUUUCUGAAGCCUUCUUCAUGCUGGUGCAGGUGCUGGGGCUCAGCACUUCCUUCAGGGGCUGAACAACCCCAAGUUUUAGCAGACUCACCUUGGAAUUUCUUUGGCCAUAUAUUUCCUUCAAAACCUUCGGAUGACUUUGGGAGACUGAGGCAGGAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGUCUGAGACCAGCCUGGGCAACGUAGGGAAACCGUAUCUCUCUAAAAAAUAAAAAUAAAAAAAUUAGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-341.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -355.54

Frequency: 0.0000

Diversity: 173.27

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((...((.((((((((.(((.(((((...(((.((((((....((.((...(((((..((((...........))))..)).)))...))))....)))))).)))...((((..(((...((((.................))))..)))..))))((((((.((((.(((((.......))..))).)))).))))))....(((.((((((((((((..((....))..))))))))((((.........))))..........)))).)))))))).))).))).))))))).)))))(((((..(((.((.((((((((((((.((.((((((.(((....))).))))))..))(((((((.((.((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.((((......)))).(((((...))))).......(((((((((...((((((((((((((...((((....(((((((.(((..(((((......))))).....(((....))).))).))))))).))))(((((........(((.......)))(((((...)))))....)))))((((.(((((((....((.(((((((((((((((....))))....))))))))))).))....))))))).)).))((((((((.....))))))))......((((........)))).....)))))))).)))....)))...)).)))))))......(((............)))...))))))))).)))))))))))))))))))))))))).)))))).))).))))))))))))..)).)))..)))))....................................

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((,,(,{{{....,,))}}..}))))(((((((.(((.((((((....((.((...(((((,{{{(({{{......}})))}.})}.)))...))))....)))))).)))....,..{(((((,,((.,{((((..{{{{{{......,,..)))}})||,((((((.((((.((({(.......})..))).)))).)))))).}{.(((((((({(((({((..{(,,,.}},,}}}}}))}{{||.........||||,..,|,},,,,),}))))}))))}....)))))))))))))}..,(((((..(((.,,.((((((((((((.{{.((((((.(((....))).))))))..}}(((((({{((.((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.((((......)))).{{(((,..||}}}.,..,},{((((((((...((((((((((((((...,{((,,.,(((((((.(((..{((((......}))))..,,,(((.,,.}}|,|}}.})))))).}}}}{{(({{{|...,{{|{.,|....})))||}|,},).}}}),,.))))}((({.(((((((..,.((.(((((((((((((((....))))....))))))))))).))....))))))).)).|,((((((((,...,)))))))).,....((((........))))..,..)))))))).)))....)))...))}}}))))}......{({............))}...))))))))).)))))))))))))))))))))))))).)))))).))).))))))))))))..,}.)))..)))))..........................}))))))...