Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LINC02554:9
Sequence Length
5051 nt
GC Content
0.5013
CAGGAGACAAACCUCGGAAGGGCUGCCCCUCAGAGACAUCAAGUGGAAUAUGAAUACUGAUUUCUAACCCCACUUCCAACUCCUGAGUGCUUUACGCUGGGCUACAAGGUUCUCAAUGUCUCAGUGCCUCAGCGUUCUGAUUUAUCUUAUGGAAGCCUGCCUCAUCUAUUCAUAUAUUGCAUUCUUAAACACAGAAUAACAACAACAGCAAUGACAACAAUGCUAAUAGCGCUCCAACAGAGCUUGCUGUGUGCCCAGCCCUGUUCGAAGUGCUCCCCAACUUUGGCCCCUAGGAUGCUCAGGACGGCCCUCUGAGCAGGCACUGAUGUCGUCCCCCUCACAUGCAGAGAAACCAAGACAUGAGCGUGGUCAGGUCGUUCGUGCAGAGCCACCGGGCUGGGGAUGGGCAGAGCUGGAGUGUGUGGGCACAGGAUCGGGGUUUGUCACCACUGUGCUGCACUGCCUCUGCACCCCAACUAGGCCUCACGCUGAUGGAGACAUCGCAGUGCAUGGGAGAACAUUCACUGCGUGGUGCUGAGGACGCAGCAGGCACUCGGUACAACCUGUUCCUUGCGUGGCCCGCUAGCUUUGGGUCCCAAAAUAAUCUGCCUCCUGAAUCUGCAACUUUCUCCCCACCUGCUGGGCAUUCUCUUAAUUCAACCGAAGCCUCUCCCUGUCCCCAUUAGGACGGCCACUCCCAACAGGAGUUCCCGGCCUGUGAAGGCCAACCGGUCGGGGCUCAGCACCCCAUUAUCAUUCUGCCACUUUCCAAAGGAAAUUAUAAGCACUUUGUGUCAACCCUCAUCUGUCCCGGCAGCCGCACCGCAGGAAAGCGAUUGAGGUCAGAGAAGGCAGACAGCCUACCCAUCACACCCGCCGCGGCCAUUCCUCAUGUAGUGACAUGCAAUCUCCCGCCAAGGGUCACCUCUGGGGAAGCGAUUCCUUCAAGCCUAGAACAAGUGCCGAAUUGCAGCUUUGCCGAAUGAUCAUGUGGAACACAUUGAAAAUAGCCGCCUCAGUAAUAAAUGCUUAACCAAAGCAGCCCCUUCCUCCGGCAUAACCAGGAGCAUAUUUACUGUAAAUAUGUUAACCAAUUCAUGCUGCAGCACAUGGCCGAGGAGUCAGCUUCCCAGGCAGCAAAGAGCAAACCCCCGCUGGGCUGAGAAGGAGCAAGCCGCAAAGGAGAGGAUUGUGUCCGCCAGGAAAAGGAAGAGGCAGGAAAAGGCACCUGGGACAGAGGAGCCUCCUGCAGGCCCCACAGCCCCACCCGACAGAGGAGUGGCGAGAAGGGGACUUGGCAUUCUGCAUCUUGCCGUCACCUCUGUGCCCCACGGAAUCUGUGAGUUAAGACUGGCUCCAAGAGAAGUGGCGUUUGUGUUUCUCCUUCAUUUCCUGCUCACAUGGUGAAGUCCGUAGUGUGACAGCUCUGAACUCCACAGGAUGAAUCAGGGUCAGGGGAGAGGACAGGAGGAAAGAAGGAGCGAGAGAAAGGGGAGAGAGAGAGAGGAGACGGGAGAGUGAUGGCGAGAGACAGAAAUAUGAAUGAGAAACGGGAAAAAAAUCGAGAAGAUGAUGAGAAGCCUGAAAGACAGAGAAAGCAAUCUAAGAUGAGAAAAAGAGCACUGAGAAAGAAAACAUUCUGGAGGAGAGAGAAGGAGGGGCAGAGAGGGGAACAAGGAGGGGGUGGAGAGAGGGAGAUUGAGAGGGCAUGAGUUGUCUCUGGAAGGCUGGGUUUUGUUUCCACUGGGAAGAAAAAAUGUUCUUUGUUAUCAAAAGCCUUGAGUGACACCAGCAGCUCCUCCCCACCCCUCUCUAACACACUAGCACCUAGGCUGGUGUACACAUACACAUGCAUACUCAAGUGUGCACACACACACACUAACAUGCACAUAUUUGUACACACACAAACAUAUGCAUGCACACACAUAUGCACAUUCAUGUGCACGCAUGCAUACUCGUGCACAUACACACUAACAUGCACACAUACUCAAGGUACACAUAUAUUCACAUGCACCACACAUACACACAUGCAUGUGCAUGCACAUACAAGCACACACACGCAUAUGCGCACACCUACUCAAGGCACACACAUACACGCACACAUUCACACAUUCAUACAUGCACACUCAUGUGUACACACACAUGCAUAGGCACACACACAUACAUUCACACACACGUAUGUGCACACACAUACUCACAUGCACACAUUCACAUGCACACACUCGUGCACAUACACUCACGUGCCCUCAUACAUGCACAUAUAUGCACACAUGCAUGCACACAUACAUCACAUCCAGGCACACAGCCAUCUAGAGGCACACAUACACUCUUACAGCACACAGUCAAUUCCCUCCCCCUACCCCUGAACCUAAUUCAGUCCCAGAACAGAGAGAGCAAUACAAGGUCUGAGCCAAAGGAAACAGACCAAAGCCAGACUGGGUCUGGGUGUGGGGGAGGAGGAGGAAAGGGGUCGGGAGGAGGCAGCCCAGGUCAGGGGCCCAGAGUGGACCAGCAAUGCAAUUGGAAUGGGAAAGAACCGUAGAGCCCCCUGAGAGGCUGCAGCCCCUCAGGCCUGGCCCUCAGGCCUGGGCCUCCCUUCAUCCCAGUUUCAGGCUGCAUUCUUAAUCGGGCCACGGCCCCGGCUACCUAGAGAGACAGUCACACACUGGCUUCAAGACCAGAGAAACCCCAGCAAAGGGCAGCCAGCUUCUGGGCAAAGAGUGAAGCCACCGGCUCCCUCCGGCUUGCAGCUUCUCCUUUCUGAAGUGGGUGGGCAGUUUCCGGCCAACCUUUUGCCUCCUUCUCUCCAGCCGCCCCUGCUAACUCCCAGUAAUUUGCCAAAAUUAACAGAUUUAUGGCAGCAUGUUGGUUUGGAUCAACUUUUCGUAUGUACUUUGCAAGAGAAAAACAUUUUCUUCUCCCCCGACUUACUGUUUGCCCAUUAAUACGCUCCACAUUCACUGGUGCUUAAUGACUGUUCAAAUUUUCUCUGUUCAUAGAGAAUGUUGUUGUUGUGAUUAAGGGUGCCAGGGUGCUUGCAAGUACAAACACACCAAAGCCAUGAAAAGGGCAAUUAAUUCUUUAAAAAAAUGCAAGAGAGUGGGAGAGAUUGGAUGCUCUGUUUACAGAAAAGCAAGAAAGAAAACAGAUAUUUCUAAGAAGUGUCCUUCCAGGACAGCAACGUCUCCUGUAAAAAUGUCUCCUGGAAAAAAUGUUGAAAUACAAAUGUUCAUGGAAACUGCUGUCCAGCAGACAUUUGGUUAUUCAACAACCAUGUGUCAACUACUCAUUAUGGGCCUGGUUCUGGGGUAAUUCAUAAAGGAAGCCACAGGGUGUGGGCGAAGUGGACAUCUGGGCCAGGACUGAAAUCCCAGCUCAAGAUAAGUCAUCCCUUGCCUCUGAGCCUCAGUUUACCCAUCUGAAAAUUAGGAGGUGGAAAUCCCAAGGGUGGCUAUCAAAAUUCAAGAGGACAUGUGUAUCAAGGGCUUAGCUUGCUGCUAGCACAUAGUAAGUGUACAAGAACUGCCUGGUUCAUUAUUCGUUCACUCUCCUGAACAAAUCAGUGGCCGUUUUAAUGGCUUUGGUGUGUUUGGACUUGCAAGCACCCUGGCACCCUUAAUCACAGCAACAGCACUCUCUAGCACCAGAGUACGUUCUCUGGGCCAUGGGCCAUGCCAUGGGGCUGGAUUUUGAAGUUACAACUUCAAGAAAGGCAAGUUUCUGCCCAUGUAUGGCUGAUGAUCCAACGGUGGGAGACAGAAACUACUAAACAUCUGCAAUGGCAACGUGUCCAACAGUGAUAAAUGCCUGAAGGGAAAUAAAACAAAGUAAGAUACAAAGCAGGGCCAAAGUAGAUAAGGCCCUGCUGAGCUGUGUUGGAUGAUGUCAUCAGGGGCCUGGGGAGGCCAGCAAGGUGACUUGUGCAGACACCCGAGUCGGGUGUCGAUAUCUUCCUCCAUACCUUUUAUCUUUCCUAAAAAUAUGGUUGGGAAGCCCUGGUCCAUCUGCAAAGGACAGGGGCAAGUUGGCCUAUGCGCUAGCAAUUGCUACAUAUUGUGAGAGCUCUUAAACCAAAGGUCAGGACACACCCAGUGAAUGUUUCCCUUCCAGAUAAGAAAAAUAUUCUGAGCACCUGCUAUGCGCCAAGCGUUGUGCUAUGUAGUGGGGGCACAACUGCAGGGAAACCAGACAUGGUCCCUCCCUGCCUCCUGGCAUUUAGAGCCAAGACAGAGGGUCAGAUUAUAAAUGAACACAGGCACCAUGAUUAUUUCAUCUCAAACUCUGGUUGGUGCUAUGGGAAAGGAGCAGUGAUCUUUGAGACCUGAGAGGGGGUCCUGAUGGAGCAGACACCAGCAGAAGGAUCCUUCCGGGAAGUGACGUUGAAGCUAAGCUUGAAAAGAAAGAAGCCAGUGGACAUCUUCUGGUGAGACCCAGAGCACCCCACCUGCAAGGGGCCUGAUCUCCCUUGAACCAAGAGCCCUGCCACUCGCCCCAGCUGCCUAAAGGCUGACAGGAGAAGAGGGAGUCAGAAUGGUGCUCCAAACAGAGCUCACUGGAAUCUCAGCUCAGCCAUUUACUUGCUCUGUCAACUUGGGCUCUCGCUGCAGGUACCUGAGACUGUUUUCUCGCCUGUAAAAUUGGAAGGUGUUAUGGGUUGAAUUGCUUCCCCCAAAAAUAUGUUGAGGUCUUAACCCCUUGAAAUGUGACCUGAGUUGGAAAUGGGAUCUUUGCAGAUGUCAUUAGUGAAGACGAAGUCACACUGGAGUAGGCUGGGCCCUAAAUCAAAUGGCUGUUAGUUUUAUAAGAAGAGGGAAAUUUGGACACAGACACACACAAAGAGGAACAACCAGCGUGUGAAGACAGAGGCAGAGAUUGGAAUGAGGCAGCCACAAGCCAAUGAACCGCUGCAGCUCCCAGAGGCCAGAAGAGGCAAGGGAAUAUCCUCCCCUAGAGGCUGCAGAGGGAGCACAGCCCUGCCAGUGCCUUGAUUCGAGACUUCGAGACUUCCAGCCUCCAGAACUGGGAAAGAAUAAAUAUCUGCUGUUUUAAGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1724.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1816.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 1258.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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