Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
LY6E-DT:25
Sequence Length
6908 nt
GC Content
0.5427
ACCCCGGCUCCUUGGGAUAGAUGGGGAAGCUGAGGCCCAGAAGGGGGCUGAGACCACCUCCCAGUUUCCCCAGUGAGGUGGCGCCUGAGCCACGGCCAGGCCCGGCCUCCUUCCACCCGGCCCUGCUGUGCGCGCGGCGGGUGCUGACCUGGCGAGGCCGGACAGGGGACCAGGUCGGGGUGACCGUCACUGACACCUGGACAGUCCUCGUUGUGUUCGGGGUGGGAAGCCCACGGAAGACAUCAACACAGGAGACUCCCAAGACUGCUGGGGCCAAAUGUGGCAGGUGGACGUCUCCCCGCCACCGAGCAAGCCAUCAGUUCUGCAGCGGACACCAGCCGAGUGUCCUCCAACACCAUUCCGGUACCUGCAGAUAGCGUCAGAUCCAGACACCUACACACACACACACACACACACACACACACACAUAUGCACACACAUGAGCUGCGAGGGCCAGCCUCUGGAACUUCUUACCGACUGGCCCGACGUUGAGGUUCCCACUGUUAGAGGAACGCUUGCUCACCAGGCCUCUGGUUUAAUGAAACAUGACCAGAGUGACUCCAUCUUGAAGUGAGUAGGAGGCACUCACAAGGCACCUAUAAGGUUAAUGCUUAUGGUCUAAAAAUAGCCAUGUCUCAAGCUGGACACCAAUUAUAAUUACAGAAUAUUUGUGGCCAUAUGGGGCAUCUCCCAGCAAGCCCGCAGACUGUCCAGAUAACCCAAGAGUGCAGGCCACUUUACUCAGAGAUAAUUUCAAUGAGCAGCCUGAGGUUGGAGGAUGAACGGGCACUGAUGGCACCCACAGCCCCUAUCCUUAGUGGGUGCAUCUGCCCAUUCCAGGUGUAAUUGUAGCUCCUUACAGUUUCUUGUAAGCAGAGGCACUAACAGAGGACAGGCCCUCCUCCUCCUGCUUUCUGAGCACGCCCCACUCUGGAACGGAGCCAUUUCAAAUAAACCUGCUUCUCUCACUGUGCUCUGUGGCUCACCCCAAAUUACUUCCUGCACAACAUCCAAGAACCUGCUCUUGGGGUCUGGAUCAGGACCCUCUUUCCCAGCAAUACUGCAGCCCCUCCCGGUUUUGCGUUCAAUUGAUUUGCAAGAGUGGCUCAGGGAACUCAGGGAAACACAUUUGCAGUUAAUUAUAAAUGGAUACACGCGAGAGGCACAGGGCGCCGUCUCCCGGAAGGGGUGGGGAGCUUCCAUGCCGCCCACGUGGCCCCUCCAGGAAACCUCUAUGUGCUCAGCAUUCCUGCCCCCAGGGCAUGGGACUGAUCCUCUCUGAAUGAGCCUCUUUGGGCCCAUGAUCAGAAAGGAGAGGGAGUACUGGAGACCUGCCUUGGGGCAGGUGAAAGGGGAGCAGGAGAUGUCACAGAGAUUCCAUUUCUACCCACAACUGUAACAAGGGCCAUGGAGUCCUGACCGGGCCGAAUGCCAACUCUCCCCCCACACAUCUACCUCCUUCUUACGUAGCAGCACUCCUUCUCACACAGCACUCCCUCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCCCCCUCACACAGGACUCCCUCCCCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACACGGCACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACAUGGGACUCCUUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCACACAGCACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACAUGGGACUCCUUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACGGCACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACACAGCACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCCCCUCACACGGCACUCCCUCCUCCUCACACGGCACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCACAUGGGACUCCCUCCUCCUCACACGGCACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCCCCUCACACGGCACUCCCUCCCCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCACACAGCACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACAUGGGACUCCUUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACACGGCACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCACAUGGGACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACACAGCACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCACAUGGCACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACACAGCACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACGGCACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACACAGCACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACACAGCACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACGGGACUCCCUCCUCCUCACACAGGACUCCCUCCUCCUCCUCACACGGCACUCCCUCCUCCUCACACGGCACUCCCUCCUCCUCCCACACCAGAGCAGAGAGAUCAUAAGACUGGGACGGGCCUGCUGUCAUGCGGAGGCUUUUGUUUUUUUAAUUUUUAAAAUUUUAAACCAGGCAACCUCCGAACCAGAAUAGGUUCAGGGAGACUUCCAUGACUAAGAGGCCUUUGGCCCUAGUUGUGGAAGACUUUUGUCCUGGUAGCGUCUCAGAUGACGGGAGGAGGCUGCUGGGGCCUGUGGGGAGAAGUCCCACGGGUGAGAGUGAGCAGUGGGCCUCCAGCGAGAGGGCAGAGCCUUGAGCACUUUCCCCUGGCAGGACUGGGUUAGGCGCCUGUGGAGUUUGGGGCACGUUUGCUGCAGGCUGCCUCCCGGCUCUGUCUCGGGUCUGGACUCAGGCGUGCCUGCUGUCAGGAGGGACCUGGUUGAAGGCCUGGCCCAGCAGGCGGUGUCUGGAGCCAGAAAGCCAGAUGCUGCUGCCCCAUGAAGAAUGAGCCGGUGGCCUUACUGCUGGGGCUGGCAGAUGAGGCCACCGAUGAGCUCUGCCCUGUUUUCUGGGUUCAAGAGGGAAGGAGCCACAGCUGCCCUGUGUGCUCCUAGGACGGGUCAGCCACCUGAGAUCUGCCCGUGGCCACAGGCCUCAUCCUGCCCUGACCUUUCUCUGGCCACGAUUCAGGGGUCCUGUGGGGGAGCGCCUCUGAUUCUUGGCCUCCCCCAUCCAGCCCCUGCUGCCGCUGCCUGUGUCUCUUGGAAGGCAGGGACUGUGGGGCUGGCCAGGAGGCCUGACGGGGAGUGCAGAUGGCAGGACAGGGCAGGCUGGGGCGGGACGGGGCAGGCUGGGCUGGGACCUGCCUGCUGGCUCUGGUGGGAGGUAGGCUGUCUCCCAGCCUUGGCUCAGUGCGGGGAGAGCAGGCUGACUCUCUGGCUGGGCUGCCGUGAGGUGAGCUCGCUGCCUGACCUCCCUGUGUCCAGGCUUCACAUUCCAACGUGCAGCUGCCAGUACUCUGCUCUCAGGCUUGGUUCCCGCCUCUCCCAGGGCACAGUCCAAAGUGCUCCCGGGGAUUUCAGCAUCUGCUCCCACCACUGGGGCCUUAGGCUCUUCCUGUAACUUCCACUGCCACCUUGACCCUGGCUCAACCCUGAAACCGAAGUUGGCUCCAGGCCUCCCUGAGUUGCUGCUUGUCCCUCCUCUUGGGACAUCUUCCCCAACCUCAGGGGAGGCCCCUCCCACAGAGUGACUGAGACAGGUCUCAACCAGUUCAGAGGUUCACUUUGCCAAGGUUGAAGCCAUGCCCGGGAAAAAGAGGCAGAAAACACAGUAGGGUGUGCAGCCCACUCCUUUUCCAAAGAGGGUUUUGGGGCUUCAAUAGUUAAAGAAAGAAGUGGCCGCAGGGGAAGGAGGAAAGGAAAAAAGGGAGGGUCAUAUUCUUGUGAGGCUGUGAUCAGUGUCCACUGCUCUCCAGGUUGCAGGUGAAAGUGGGGGCCAGAGGAACAGUUGAUUUGUGUGUGUGUGUGUGUGUUUUUUUUGAGAUGGAGCCCCACUCUGUUAUCUAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCAAUCUCAACUCACCGCAACCUCUGCCUCCCGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGCACUACCACCACGCCUGGCUAAUUUCUGUAUUUUUGUAGAGAUGGGGGUUUUGCCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCGAAUUCCUGACCUCAGGUGAUCCACCCGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCGGGAUUACAGGCGUGAGCCACGAGCCACCGUGCCUGGCUGAUUUGUUGUUCGUUUACAUUUUCAGGUGAGGGAGGCCACCUGGGGAGACACGUGGCCUUCUAUCUUGUAGCUGUCUGUUUAAGAACAAAAGGAAAGGCAGGGGUUUUUUUUGUUUUUGUUUUUGUUUUUUGCAUGACUCAGUUUCUAAGCUUAACUUUUUCCUUUGGCAUAGUGAGUCUGGGGACCCAAGAUCUUAUUUUCCUUUCUGUCACCCCCGCUUGGUUUUGGAUUCCGUGACAGCUGGACCCGGCUUCUGCGUGGGAAGAGUGUAUCACAGCCAUUGGGAACUUUCUUCACCCAUCAAAGCCUCAGGGCUGAAGCAUCCUGAACAAGAACUCAGGAGAGUGAAAGAAACAGUUACC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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2476.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2599.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 1899.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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