Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

LY6E-DT:39

Sequence Length

875 nt

GC Content

0.4446

CAUAGUGAGUCUGGGGACCCAAGAUCUUAUUUUCCUUUCUGUCACCCCCGCUUGGUUUUGGAUUCCGUGACAGCUGGACCCGGCUUCUGCGUGGACAUAAUUGGAGACACUGGUUAUUUUACCAAAGCUUUGACCGGAAGGAUGUACUUUUGGAUACAAACAGACUGCUUUAAGGAGUCAAAGCUGACUUAUGAAGUUGGCCUCAUCCCUUGUCUACACAGUCACUGUACAGAGUUCCUUGCCUGUAGUAUGUAAAGAAUGUCACUUUCUGACAGGCUCAGGAGCCCCAAAUUAUCCUGGGACCUUGAGGAGAGGACAUUGCCCAAUUUAUAUAGGUAUUUUCAGGCACCAAUAAAUCAUGGCUGGGCUCAAGGCUUUAAAAAAAGUCAAAUCUGGGAUUCGUUAUAGAAUAAAGUUCCAGCAAAGCCAAUUUUAAGACAGGCCUAUAUGGCAAAUAAUUAUUCGUGCUGACAUUAUGCAAACACUCAGGCCAAGUAUAAGAUGAAAAAUUAUUUUAAAUAAAUUUGUCCUACUAUGAUUUGUCUUCAGUAAAAACAGGUACUGGGCUGGGCAUGGUGGCUCACAGCUGUAAUCCCAGCACACUGGGAGGCCAAGGCAGGCAGAUCGCUUGAGGUCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGGUGAAACACCAUCUCUACCAAAAAAUAUAAAAAUUAGCCAGGUGUGGUGGCAUGUGUCUGUAAUCCUAGCUACCCAGGAGGCUGAGGCAUGAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGUGGAGCUUGCCUGAGUCCUGGUAAGGCACAGACAGAAAGGGUUGUCAGCCAUUUUUUUCUGAGGUUAUAAGAUCUGCAACUUCCCCAGUUAUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-274.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -290.78

Frequency: 0.0000

Diversity: 255.42

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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