Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

MALAT1:21

Sequence Length

480 nt

GC Content

0.3583

GGUAGGCAUUGAGGCAGCCAGCGCAGGGGCUUCUGCUGAGGGGGCAGGCGGAGCUUGAGGAAACCGCAGAUAAGUUUUUUUCUCUUUGAAAGAUAGAGAUUAAUACAACUACUUAAAAAAUAUAGUCAAUAGGUUACUAAGAUAUUGCUUAGCGUUAAGUUUUUAACGUAAUUUUAAUAGCUUAAGAUUUUAAGAGAAAAUAUGAAGACUUAGAAGAGUAGCAUGAGGAAGGAAAAGAUAAAAGGUUUCUAAAACAUGACGGAGGUUGAGAUGAAGCUUCUUCAUGGAGUAAAAAAUGUAUUUAAAAGAAAAUUGAGAGAAAGGACUACAGAGCCCCGAAUUAAUACCAAUAGAAGGGCAAUGCUUUUAGAUUAAAAUGAAGGUGACUUAAACAGCUUAAAGUUUAGUUUAAAAGUUGUAGGUUUCUCUUUUUCAGGCUUAUACUCAUGAAUCUUGUCUGAAGCUUUUGAGGGCAGACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-105.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -116.52

Frequency: 0.0000

Diversity: 133.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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