Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
MALAT1:29
Sequence Length
353 nt
GC Content
0.4363
AGAAGAAUUUGGAAGGCCUUAAAUAUAGUAGCUUAGUUUGAAAAAUGUGAAGGACUUUCGUAACGGAAGUAAUUCAAGAUCAAGAGUAAUUACCAACUUAAUGUUUUUGCAUUGGACUUUGAGUUAAGAUUAUUUUUUAAAUCCUGAGGACUAGCAUUAAUUGACAGCUGACCCAGGAGCCAGUGCGAUUUGGUGAAGGAAGCUAGGAAGAAGGAAGGAGCGCUAACGAUUUGGUGGUGAAGCUAGGAAAAAGGAUUCCAGGAAGGAGCGAGUGCAAUUUGGUGAUGAAGGUAGCAGGCGGCUUGGCUUGGCAACCACACGGAGGAGGCGAGCAGGCGUUGUGCGUAGAGGAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-85.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -90.28
Frequency: 0.0004
Diversity: 51.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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