Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

MALAT1:30

Sequence Length

1519 nt

GC Content

0.3693

GGCAAAUAUUGGCAAUUAGUUGGCAGUGGCCUGUUACGGUUGGGAUUGGUGGGGUGGGUUUAGGUAAUUGUUUAGUUUAUGAUUGCAGAUAAACUCAUGCCAGAGAACUUAAAGUCUUAGAAUGGAAAAAGUAAAGAAAUAUCAACUUCCAAGUUGGCAAGUAACUCCCAAUGAUUUAGUUUUUUUCCCCCCAGUUUGAAUUGGGAAGCUGGGGGAAGUUAAAUAUGAGCCACUGGGUGUACCAGUGCAUUAAUUUGGGCAAGGAAAGUGUCAUAAUUUGAUACUGUAUCUGUUUUCCUUCAAAGUAUAGAGCUUUUGGGGAAGGAAAGUAUUGAACUGGGGGUUGGUCUGGCCUACUGGGCUGACAUUAACUACAAUUAUGGGAAAUGCAAAAGUUGUUUGGAUAUGGUAGUGUGUGGUUCUCUUUUGGAAUUUUUUUCAGGUGAUUUAAUAAUAAUUUAAAACUACUAUAGAAACUGCAGAGCAAAGGAAGUGGCUUAAUGAUCCUGAAGGGAUUUCUUCUGAUGGUAGCUUUUGUAUUAUCAAACUUUUUUCAGAUAACAUCUUCUGAGUCAUAACCAGCCUGGCAGUAUGAUGGCCUAGAUGCAGAGAAAACAGCUCCUUGGUGAAUUGAUAAGUAAAGGCAGAAAAGAUUAUAUGUCAUACCUCCAUUGGGGAAUAAGCAUAACCCUGAGAUUCUUACUACUGAUGAGAACAUUAUCUGCAUAUGCCAAAAAAUUUUAAGCAAAUGAAAGCUACCAAUUUAAAGUUACGGAAUCUACCAUUUUAAAGUUAAUUGCUUGUCAAGCUAUAACCACAAAAAUAAUGAAUUGAUGAGAAAUACAAUGAAGAGGCAAUGUCCAUCUCAAAAUACUGCUUUUACAAAAGCAGAAUAAAAGCGAAAAGAAAUGAAAAUGUUACACUACAUUAAUCCUGGAAUAAAAGAAGCCGAAAUAAAUGAGAGAUGAGUUGGGAUCAAGUGGAUUGAGGAGGCUGUGCUGUGUGCCAAUGUUUCGUUUGCCUCAGACAGGUAUCUCUUCGUUAUCAGAAGAGUUGCUUCAUUUCAUCUGGGAGCAGAAAACAGCAGGCAGCUGUUAACAGAUAAGUUUAACUUGCAUCUGCAGUAUUGCAUGUUAGGGAUAAGUGCUUAUUUUUAAGAGCUGUGGAGUUCUUAAAUAUCAACCAUGGCACUUUCUCCUGACCCCUUCCCUAGGGGAUUUCAGGAUUGAGAAAUUUUUCCAUCGAGCCUUUUUAAAAUUGUAGGACUUGUUCCUGUGGGCUUCAGUGAUGGGAUAGUACACUUCACUCAGAGGCAUUUGCAUCUUUAAAUAAUUUCUUAAAAGCCUCUAAAGUGAUCAGUGCCUUGAUGCCAACUAAGGAAAUUUGUUUAGCAUUGAAUCUCUGAAGGCUCUAUGAAAGGAAUAGCAUGAUGUGCUGUUAGAAUCAGAUGUUACUGCUAAAAUUUACAUGUUGUGAUGUAAAUUGUGUAGAAAACCAUUAAAUCAUUCAAAAUAAUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-401.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -430.87

Frequency: 0.0000

Diversity: 438.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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