Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

MALAT1:32

Sequence Length

1031 nt

GC Content

0.3637

GGAAGUGGCUUAAUGAUCCUGAAGGGAUUUCUUCUGAUGGUAGCUUUUGUAUUAUCAAACUUUUUUCAGAUAACAUCUUCUGAGUCAUAACCAGCCUGGCAGUAUGAUGGCCUAGAUGCAGAGAAAACAGCUCCUUGGUGAAUUGAUAAGUAAAGGCAGAAAAGAUUAUAUGUCAUACCUCCAUUGGGGAAUAAGCAUAACCCUGAGAUUCUUACUACUGAUGAGAACAUUAUCUGCAUAUGCCAAAAAAUUUUAAGCAAAUGAAAGCUACCAAUUUAAAGUUACGGAAUCUACCAUUUUAAAGUUAAUUGCUUGUCAAGCUAUAACCACAAAAAUAAUGAAUUGAUGAGAAAUACAAUGAAGAGGCAAUGUCCAUCUCAAAAUACUGCUUUUACAAAAGCAGAAUAAAAGCGAAAAGAAAUGAAAAUGUUACACUACAUUAAUCCUGGAAUAAAAGAAGCCGAAAUAAAUGAGAGAUGAGUUGGGAUCAAGUGGAUUGAGGAGGCUGUGCUGUGUGCCAAUGUUUCGUUUGCCUCAGACAGGUAUCUCUUCGUUAUCAGAAGAGUUGCUUCAUUUCAUCUGGGAGCAGAAAACAGCAGGCAGCUGUUAACAGAUAAGUUUAACUUGCAUCUGCAGUAUUGCAUGUUAGGGAUAAGUGCUUAUUUUUAAGAGCUGUGGAGUUCUUAAAUAUCAACCAUGGCACUUUCUCCUGACCCCUUCCCUAGGGGAUUUCAGGAUUGAGAAAUUUUUCCAUCGAGCCUUUUUAAAAUUGUAGGACUUGUUCCUGUGGGCUUCAGUGAUGGGAUAGUACACUUCACUCAGAGGCAUUUGCAUCUUUAAAUAAUUUCUUAAAAGCCUCUAAAGUGAUCAGUGCCUUGAUGCCAACUAAGGAAAUUUGUUUAGCAUUGAAUCUCUGAAGGCUCUAUGAAAGGAAUAGCAUGAUGUGCUGUUAGAAUCAGAUGUUACUGCUAAAAUUUACAUGUUGUGAUGUAAAUUGUGUAGAAAACCAUUAAAUCAUUCAAAAUAAUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-260.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -280.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 281.92

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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