Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
MAPT-AS1:5
Sequence Length
432 nt
GC Content
0.5139
AAAGCUGUGUGGUCCCCAGCCGAGGGCGCUGCUGUGGGGCACAGGGUCCCUCUAGAAUGAUGCCCCCCAACCCUGGGAGACCAGGGGAGAGGUCAUAUGGACCCUGCUCUCUGCCCAGACCCUAGUGGGUUUAGACCAGGAGUCAGAACAAGGACGGGCCUGUGAUGUGUCUGUCUAUGACGAGGAGGACAAUGUCCUAAGGAAUGGAGAGGAAGAAAGUGAAGGGAACCAGGUCCCUGGAUUCCAUGUGGAACAGUAGCCCAGGAUGUGCACUAUGGACUGUUACAAGAGAGAGACAUGAUCUUCCUUAAGGCAUUGAUUUGUCAUGAGUCUCUUUGUUAUAGCCACUUAACGUUACCUUAAUACACCCACUUCAUGGAUAAGUAAAACUGAGGCUUGGAGAAGCCCACAUUGACACAGCAAAGAAGGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-142.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -152
Frequency: 0.0000
Diversity: 135.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((((.....))).((((..(((..((((((..((((((((.......((((....((.(..((((((....))))))..).))))))..))))))))..)))))).))).)))).((((((((...(((((..((((....(((.....)))(((((((...((.(((((((((((((.((....(((........)))((((((((..(((...((((((((....)))).))))...((..(((((...(((............))))))))..)).........)))..))))))))..((((......))))....))))))))))))))).))....)))))))..........(((.....)))..........))))..)))))..))))))))....)))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((.(((((((((,{.,...,},)))).))))).((((((((.,.....,,{{,{,{{{.{..((((((....))))))..).))})))..)))))))){((,{{(,,{((((((....)))))}.}..}}))})||,...,,.{({{{{{||},,,,{|,|}}|||||{{|,,,,{{(((((...})))|{{{{{{{|,,(((.......,,,.,{(((.{{{,.}}}))}}.}|||.,{,{|.,,{{{..,,||||,|||.},},.{((.((((.(({{{(((((..((((((,..,.{{,,....,,)}...))))))..))))))))).)))))))}}}..)))).)))},..,,..||,,.,}}))),,..,,....,|{.(((((....))))))},....)))))))...........
Back