Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
MIR1-1HG-AS1:37
Sequence Length
4885 nt
GC Content
0.6184
GCAGAAGUGCCGAGUCCCGGCCGGGGGCAGCCUCGCCGCCGCUCAGCUCGGGAAUCCCUGCCCCCCACCAGCACCUCAGUGGGGGAUACUGCAAGUUCAAGAAUUGGGGCCAGGAUCAGGUGGUGACAGAGCCACCUGGGUUUCCGGAGACUCUCAAGCCAACCCCAAGUCAUGACAAAUGCCAGUCGCCUUGGACAGAGGCAAGGUCAACCUGCUUGCCGCCCCCAGCCAGGCCCUGCCACCAAGGGGCCUGGACGCAGAGACCAGAGGCCUGAACUGGCAGACUGUCCUCACAGGCUGUGUGACGCUGGCUGGUCGUCCCAUCUCUCUGGGGCCCCACAGGACUGGGGACCAGGUCGUGGAAUGACAGUGGACCACAGUGGUCCGGGGACCCCGCUCGUUGGUGGCAGGCACAGGCCCGUGUGAUGGGGACAAUGAGCUUUGGUAUUUGUGAGUCCUGUCCAGAGCAUAGGUCCUCCUGUUCAGAAGCCACCUCAUAAAUGUCCCCAGUGCCUCCCGGACUUAGGAAGGCAUCCCCUUGUGGUUCUGGCCAGUUAGGGACACAGGGCCGGGGAGUCUAUGCCGCUCAGAACAGGCUCAGCUGCAUCUAAUCCCAGGGGAGCCCCUGAGGAGCCUGCACACCCCCCAGGCUGGCCCACAGGAGCUGAGGCAGGGCUCUCCUCCAGGUUCACCUCCUGGGCUCACGGCCCCUUCCCCACAUCCCAAGGCCGGCUCUGCAGAGUCAUGGGGAGAAGCCGGAGCCCCAGCCACACUCGCCACACACGCCGACACCCACUCUGGUGUCCUCCGGCCAGCGACAGCGAGGGACAGAGGGACGCCCCCUGCACCUGCCCAGUGCAGAGGCUUCUUGAGUGAUGCCAGGCCCUUCUCCCAGCCCUGUACGCCCCGCUAAAGACCCCAUGUCUCACCAUAAAGGAGGCCAGGAGGUUUUAAGCUUCUACCUGGUCUGAGCACUUUUCUGGAAACUAAAUAGCCACUCGGCUUCCCACUGGCAGCGGGAGAGCGUGGUGUGAGGUGUGGUGUCCAAACUCCCCCUGCAAGGCCCCUCCCCUGCAGCCCACUUCCUCCUGCCUGCCGUCUCCAGGCAGGGUUGAGGGGGGCAGGCCAGGCCUGCAGCUGGGGUCAGGGGCAUAGACAGCCACAAUGGGGGAGGUGGGGAGCAGUCUGCAGGCCUGGGCAGGCGGCUCUGUAAAGGAUGCGGGUGCUUUGUGGUGGUGAGAGAGAGGGUAUGCAGCAGACGUGGCCAUAAAUCACCCUCCUCACGGCAGCCCCACACCCACGGACCAGGGCACGGGCACAGGGCCAUCUCCUUCCAGGAGAAGGGCUGGUGUGGGUGGCCAGAUCUGACAGCCCCCAGGCCGUAGGACAGAGCCAGAAGACAGAGCAGUUCCCCCGUUUACCCAUAGCACCAGCCUCACAGUAACAGCCGGCACACAGCACUUAGGCUGCCUGGUGUUCCAGAAGCUUCUGCAGGGGCUCUAUGCUGCACUCAAGGCAUCCCUAAGAGGAGAGCAUUUUGCUGUCCCCACUUUACGGAGAAGGAACGUGGGCUCAGGGUGGUUUAAGGCGUGAAUGAAUGAAGGAGCAAGCAGUAAGCCCCGACAGCAAGGCCACCACAGCCCUCGCCCCACAGGGACGCCUGAGCAAGGACCCAAGCAGGGGACAAGCAGGCUCACCCCGCCCUUGCGGGGCUGACCACGAGGCCCCGUCCGGUGGAACACGCCAUGACGCUUCAGGAGGCUCAUGUAGCUGGCGCCGUAUGGGACAGCGGGGGAGAGAGAAAAUGCACAGCCCAGGGAAUGUGGAGACAGGCCCAGCGCCAGGCAUGGGGGCCGGAAGGAGCAGCCGGGGAGCAGGGGGCAGGGCCUGGAGUCCCGCCUUGCAGGUCAGAGGUCAGAGGUCAGGGAAGGCCUGGGUGGGGGUGAAUGAACAGGCCCCCCAGUGAUGUCAGAGGGGCAGGCGGGGAAGGGUCCCGGAAGAGCACCCCGGGGAGUGUGUACAGGAAGGCAGGAGCCCGGAGGCGGGAAGGGGGGCCUGGUGUGUCCAGCGGGCAGCAGGAGGCCAGCAUGGCUGCCACUGGGGCAGUGGCAGUGGAUGGGUGGCCUGGGGCUGGGCUUCGGGCAGGGUCAGACCACGUCAGGCCUUGUAGGCCAGUGCCAGGGCUGCAGGUGUCCUGCUGAGGGGCACAGGCCUGGGCAGGCUGGCACGGCUAUAGCAGGGUCCUUAUGGCUUAUCUGCUGAGGGUGAGGGUGGAGGGCAGAGGCUGGAGCAUCAGGGGCCCUGCCCAGCUGCGGUGCCCUGGGGAGGGCUGCCCAGCUCUGGCUGUGCCUUGAAAGUUUGCCCGAAAGAUUCACUGUUGGAGCAGAUGUGGUCACAAGAGCAAGGGGGGAUGUCAGAUGGCCUGGGCCCUGAGGAACAGAGUGCAUCCCUAGGAGGGGGACGGCCCGUCACCAGGGAGCCUUCUGAGACCAUUUUGUAGGUGGGGAAACUGAGGCUCAGGAGGAAAAGCCAGUUGCCCAGCACGCGAAGACCCAGAGCCUAUCUUCCUGCCCCUACAUCCUUGUCUGUCCCCAGAUCUGAACCUGCCCCAGCCCCAGGACUCUGAGUGCAGCAAGAGGGGAGCCGGGCUGGAGAGUGGGGAGCACGGAGACUGUGGCCUGGAUGGUGCCAGAGCAAACAGGAGAGAGGCUGCCCAACGCAGAGGCUGCAGCACAGACCAGAGGGUCCCGGGGCUGACUGGGUGGGGGCAGCUCCCAGCGAGAGGCCCCUGGGAUUUGGGUAAGUAGAGGCACAUGCAGACUCUGGCCACAGGGCACCUCGCGCACGAGGGGAGUUCACCACACAAGCUGAGCGGAGGGCGGACGCAGGAGAGCAGCGGUUUCUCGGAAGCCAAGGGCGGUCAUGGAGCCCCACGCCACAGCGCUUCCCACGGGGCCACACCAUCCGGUCUGCGGAGGGGGCUGCAUUGCCGGGAAGGACCAUCUGAUUCUGGAUUCCAGCCUCACCCUGGGCCACCGCUGAGUGUCCCAAGUGGCCCCUUAGCCCCCAGGGCCAGGCGGCAUCCCAAUCCCCUAGGGAUGUCUGUGCUCAGAAUGUGGCACACACGCCCCGGCAGGGCCAUCCUCCUCCUCCUGCACCCGCCACAGCCGUGGAUUCGGGGUCUCUAUCGUGGGCAGAAAUUCACACAGUCAAGGUGAGGGUCCCAGGAGCAGCUGUGACCAGGCCCCGGCUGCCAGGGAGAGGGGGUCUUCAGCCGACGGGGCAGACACCCUGAGAUGGACCCUUGUCCAGGGGAGGGCCCUGCCACCCACAAUUCCUUGGCAUUCCUGCACCAGCAGGACGGGCUGAGGGAGGCGCCUCACCAGUGCCAGCGCCCAGCAUCACUGUGCCCCGGUGGAGGGGGAGGCCCUUCCGAGCCUGGGCCUGGGUGUGGAUGAGGGCAGGUCUCUCACCUCUCUGACCUCAGCUUCCUCAACUGGGAAGGGGGGCCACAGCACCCCCUUAGGGGUGAUGAGGAAGUGGGAGCUCAGGGAGGACCCCGGGCAGGGCUGCCUCCUCACCUCUCUUCGGCCUUUGGACACUGGAGCUCAGAGGACCAAGUGAAUGAAUGAAUGACUCGAUCAAUCAACUGAUCCAUGAAUCCAUGGACCCCUGAACAGCUGGACAGCUGGGCUGUGGGCAGGACAGGGGACUCUGGCUGAAGCCGCGUUCAUAUGUGUUCAGCUUUAGGCCUCCACUGUGCCCGGACCAGCGGCCCACUCAGUGAGUCGAGUGUGCACCUGGCACCCCUCUUUCUGGAAAUCCACGAACAAUGGGCUCCCAGCAGAGGACUGAGGCUGAGCAGGCCACUUCCCUGGAGCUGACCCCACAGCUGUGUAGGUACAGGGUGGCCGUGAACACUUAGGGCUCUCUCGGGCUGUGCGCUUCUUGUUCACUGCAAGGAGCAGGGUGUUGGCUCCUGACCAAGCCCUGUCACUGCUGCCCAGCCACACGUGGGGCCCCUUCACCCACCCCUGACCACCUCAUGCAGGUGAAGCCACUGUGGAAACAGCCUGGCAGUCCCUUGAAAAAUGAAGUCAUAAACCCCAGCAAUUGCACUCCUGGGCCUCUGACAGAGCUUGCACGUCCCCUCCAAAGCUCGUGUUAAGCUGUGAGCCCCAGUGCCGGAGGUGGGGCCUGGUGUGUUUGGGUUCUGGGGGUGGAUCCCUCAUGGCUGGGUGCCAUGAACCCACUCACCACAGUGAGUUCUCACGAGAUCUGGUUGUUGAGAAGUGUGUCAUACCUCCCCCACAACUCUCUGUCUUUUGUUCCGGCUCUGGCAAUGUAACAAGCCUGCUCCUCCUUCGCCUUCUGCCAUGACUGUAAGCUUUCUGAGGGCUGACCAGAAGCCCAGCAGAUGCCAGCACCAUGCUUCCUAUACAGCCUGCAGAACCGUGAGCCAGCUAAACCUCUCCUCAUAAAUCACCGAGCCCCAGGUUUAUCUUUACAGCAAUGCAAGACCUGACUAAUACAGCACCAGCUCCCCAAAAUAAAAAGAAAUAUUCAAACAAAUAAGCGCACAGAAGUGUUCCCAGCAGCACUAUUCACAGCAGCCAAAAGGCGGAGGAGCCACAGGCUUGUCAGCUGAUGACAGAUAAAGAAAGCAUGGCCUGUCAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGUGGGUGGAUCACCUGAGGUUGGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCAGUCUCUACUAAAAAUAUAAAAAUUAGCUGGGUGUGAUGAUGAGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUUGGAAGGCUGAGGAACAAGAAUCGCUUGAACCCGGGAGGCAGAGGUCGCAGUGAACCGAGAUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2190 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2262.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 1334.5
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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