Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
MIR1-1HG-AS1:44
Sequence Length
4752 nt
GC Content
0.6277
AGAGUUAGGGAGAGGCGGCCGAGCUGCACACCUUGAGCCCCGGCCUCCUCCGAAGGGAACCCCUGCACCCCAGCGGGGUCAGCACAAGGUAGAGAAGGUAGAGGUCAGGGUGGAACAAAAGGGAAGGUCCCGCGGGUGUGCACGCUCUCGCAGGCACACAGCCGGCUCGCGGAGACACAGGGGCGGGGGAGGGGAGGGGAGGGGAGGGGAGGGCCUGACCUGAGAGGCCAGAGCGGGCGUGGGGGCCCCCCUCGGGUCAGGAGCCGGCCUCACCUUUGCAGUUCUUAUAUACCCGGCCAAGCAUCCCAAACACGCGGCCCUGGCCAAGUGGCCCCCUCGGGCUGCGCUCCCUGACCAUAUUUAGUCAAGCAGGGGAAAAAAUAGCCUGUCAGCUGGGCCGCGGCUGGCCCGGCCACCGGGAACAGGGUGGGAGCACCCACGCCAUUGACGGCGGGUCCCGGGCUCAGGCUGCUGUCCUGCCCCUCCCGGCCCCUCCCUGACAGGCCUCCCACCGGCUGUCCCUGCCCGAGAUCCCCCCGCUAUUUUUAGCCCAGCCAGUACAGAGGCGCCUCCUCAGUAGCCGGGCAGCAGCCUCCAUGCCAUGCCAGCCGGCUCCUAGGGUGCCCUGGGGAGACCCGGGCAUCUCCCAGGCUGCAGGGCCGGGGGUGGGGGGGGCGGGCAGAAUGGUACGGCCUCCUUCGCUGCUCUGAGCCUCCAGUGGGCUGAGCCCACCCAGGCCACCAGGAGUGGGUGGCCCCCUCCACAGUCCCAUCGGCUCUGCCCUUUUGCCUAGAAUUGGGGCCAGGAUCAGGUGGUGACAGAGCCACCUGGGUUUCCGGAGACUCUCAAGCCAACCCCAAGUCAUGACAAAUGCCAGUCGCCUUGGACAGAGGCAAGGUCAACCUGCUUGCCGCCCCCAGCCAGGCCCUGCCACCAAGGGGCCUGGACGCAGAGACCAGAGGCCUGAACUGGCAGACUGUCCUCACAGGCUGUGUGACGCUGGCUGGUCGUCCCAUCUCUCUGGGGCCCCACAGGACUGGGGACCAGGUCGUGGAAUGACAGUGGACCACAGUGGUCCGGGGACCCCGCUCGUUGGUGGCAGGCACAGGCCCGUGUGAUGGGGACAAUGAGCUUUGGUAUUUGUGAGUCCUGUCCAGAGCAUAGGUCCUCCUGUUCAGAAGCCACCUCAUAAAUGUCCCCAGUGCCUCCCGGACUUAGGAAGGCAUCCCCUUGUGGUUCUGGCCAGUUAGGGACACAGGGCCGGGGAGUCUAUGCCGCUCAGAACAGGCUCAGCUGCAUCUAAUCCCAGGGGAGCCCCUGAGGAGCCUGCACACCCCCCAGGCUGGCCCACAGGAGCUGAGGCAGGGCUCUCCUCCAGGUUCACCUCCUGGGCUCACGGCCCCUUCCCCACAUCCCAAGGCCGGCUCUGCAGAGUCAUGGGGAGAAGCCGGAGCCCCAGCCACACUCGCCACACACGCCGACACCCACUCUGGUGUCCUCCGGCCAGCGACAGCGAGGGACAGAGGGACGCCCCCUGCACCUGCCCAGUGCAGAGGCUUCUUGAGUGAUGCCAGGCCCUUCUCCCAGCCCUGUACGCCCCGCUAAAGACCCCAUGUCUCACCAUAAAGGAGGCCAGGAGGUUUUAAGCUUCUACCUGGUCUGAGCACUUUUCUGGAAACUAAAUAGCCACUCGGCUUCCCACUGGCAGCGGGAGAGCGUGGUGUGAGGUGUGGUGUCCAAACUCCCCCUGCAAGGCCCCUCCCCUGCAGCCCACUUCCUCCUGCCUGCCGUCUCCAGGCAGGGUUGAGGGGGGCAGGCCAGGCCUGCAGCUGGGGUCAGGGGCAUAGACAGCCACAAUGGGGGAGGUGGGGAGCAGUCUGCAGGCCUGGGCAGGCGGCUCUGUAAAGGAUGCGGGUGCUUUGUGGUGGUGAGAGAGAGGGUAUGCAGCAGACGUGGCCAUAAAUCACCCUCCUCACGGCAGCCCCACACCCACGGACCAGGGCACGGGCACAGGGCCAUCUCCUUCCAGGAGAAGGGCUGGUGUGGGUGGCCAGAUCUGACAGCCCCCAGGCCGUAGGACAGAGCCAGAAGACAGAGCAGUUCCCCCGUUUACCCAUAGCACCAGCCUCACAGUAACAGCCGGCACACAGCACUUAGGCUGCCUGGUGUUCCAGAAGCUUCUGCAGGGGCUCUAUGCUGCACUCAAGGCAUCCCUAAGAGGAGAGCAUUUUGCUGUCCCCACUUUACGGAGAAGGAACGUGGGCUCAGGGUGGUUUAAGGCGUGAAUGAAUGAAGGAGCAAGCAGUAAGCCCCGACAGCAAGGCCACCACAGCCCUCGCCCCACAGGGACGCCUGAGCAAGGACCCAAGCAGGGGACAAGCAGGCUCACCCCGCCCUUGCGGGGCUGACCACGAGGCCCCGUCCGGUGGAACACGCCAUGACGCUUCAGGAGGCUCAUGUAGCUGGCGCCGUAUGGGACAGCGGGGGAGAGAGAAAAUGCACAGCCCAGGGAAUGUGGAGACAGGCCCAGCGCCAGGCAUGGGGGCCGGAAGGAGCAGCCGGGGAGCAGGGGGCAGGGCCUGGAGUCCCGCCUUGCAGGUCAGAGCUGGAGCAUCAGGGGCCCUGCCCAGCUGCGGUGCCCUGGGGAGGGCUGCCCAGCUCUGGCUGUGCCUUGAAAGUUUGCCCGAAAGAUUCACUGUUGGAGCAGAUGUGGUCACAAGAGCAAGGGGGGAUGUCAGAUGGCCUGGGCCCUGAGGAACAGAGUGCAUCCCUAGGAGGGGGACGGCCCGUCACCAGGGAGCCUUCUGAGACCAUUUUGUAGGUGGGGAAACUGAGGCUCAGGAGGAAAAGCCAGUUGCCCAGCACGCGAAGACCCAGAGCCUAUCUUCCUGCCCCUACAUCCUUGUCUGUCCCCAGAUCUGAACCUGCCCCAGCCCCAGGACUCUGAGUGCAGCAAGAGGGGAGCCGGGCUGGAGAGUGGGGAGCACGGAGACUGUGGCCUGGAUGGUGCCAGAGCAAACAGGAGAGAGGCUGCCCAACGCAGAGGCUGCAGCACAGACCAGAGGGUCCCGGGGCUGACUGGGUGGGGGCAGCUCCCAGCGAGAGGCCCCUGGGAUUUGGGUAAGUAGAGGCACAUGCAGACUCUGGCCACAGGGCACCUCGCGCACGAGGGGAGUUCACCACACAAGCUGAGCGGAGGGCGGACGCAGGAGAGCAGCGGUUUCUCGGAAGCCAAGGGCGGUCAUGGAGCCCCACGCCACAGCGCUUCCCACGGGGCCACACCAUCCGGUCUGCGGAGGGGGCUGCAUUGCCGGGAAGGACCAUCUGAUUCUGGAUUCCAGCCUCACCCUGGGCCACCGCUGAGUGUCCCAAGUGGCCCCUUAGCCCCCAGGGCCAGGCGGCAUCCCAAUCCCCUAGGGAUGUCUGUGCUCAGAAUGUGGCACACACGCCCCGGCAGGGCCAUCCUCCUCCUCCUGCACCCGCCACAGCCGUGGAUUCGGGGUCUCUAUCGUGGGCAGAAAUUCACACAGUCAAGGUGAGGGUCCCAGGAGCAGCUGUGACCAGGCCCCGGCUGCCAGGGAGAGGGGGUCUUCAGCCGACGGGGCAGACACCCUGAGAUGGACCCUUGUCCAGGGGAGGGCCCUGCCACCCACAAUUCCUUGGCAUUCCUGCACCAGCAGGACGGGCUGAGGGAGGCGCCUCACCAGUGCCAGCGCCCAGCAUCACUGUGCCCCGGUGGAGGGGGAGGCCCUUCCGAGCCUGGGCCUGGGUGUGGAUGAGGGCAGGUCUCUCACCUCUCUGACCUCAGCUUCCUCAACUGGGAAGGGGGGCCACAGCACCCCCUUAGGGGUGAUGAGGAAGUGGGAGCUCAGGGAGGACCCCGGGCAGGGCUGCCUCCUCACCUCUCUUCGGCCUUUGGACACUGGAGCUCAGAGGACCAAGUGAAUGAAUGAAUGACUCGAUCAAUCAACUGAUCCAUGAAUCCAUGGACCCCUGAACAGCUGGACAGCUGGGCUGUGGGCAGGACAGGGGACUCUGGCUGAAGCCGCGUUCAUAUGUGUUCAGCUUUAGGCCUCCACUGUGCCCGGACCAGCGGCCCACUCAGUGAGUCGAGUGUGCACCUGGCACCCCUCUUUCUGGAAAUCCACGAACAAUGGGCUCCCAGCAGAGGACUGAGGCUGAGCAGGCCACUUCCCUGGAGCUGACCCCACAGCUGUCCUGCUCCUCCUUCGCCUUCUGCCAUGACUGUAAGCUUUCUGAGGGCUGACCAGAAGCCCAGCAGAUGCCAGCACCAUGCUUCCUAUACAGCCUGCAGAACCGUGAGCCAGCUAAACCUCUCCUCAUAAAUCACCGAGCCCCAGGUUUAUCUUUACAGCAAUGCAAGACCUGACUAAUACAGCACCAGCUCCCCAAAAUAAAAAGAAAUAUUCAAACAAAUAAGCGCACAGAAGUGUUCCCAGCAGCACUAUUCACAGCAGCCAAAAGGCGGAGGAGCCACAGGCUUGUCAGCUGAUGACAGAUAAAGAAAGCAUGGCCUGUCAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGUGGGUGGAUCACCUGAGGUUGGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCAGUCUCUACUAAAAAUAUAAAAAUUAGCUGGGUGUGAUGAUGAGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUUGGAAGGCUGAGGAACAAGAAUCGCUUGAACCCGGGAGGCAGAGGUCGCAGUGAACCGAGAUCAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2167.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2235.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 1160.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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