Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
MIR1-1HG-AS1:47
Sequence Length
4777 nt
GC Content
0.6301
AGAGUUAGGGAGAGGCGGCCGAGCUGCACACCUUGAGCCCCGGCCUCCUCCGAAGGGAACCCCUGCACCCCAGCGGGGUCAGCACAAGGUAGAGAAGGUAGAGGUCAGGGUGGAACAAAAGGGAAGGUCCCGCGGGUGUGCACGCUCUCGCAGGCACACAGCCGGCUCGCGGAGACACAGGGGCGGGGGAGGGGAGGGGAGGGGAGGGGAGGGCCUGACCUGAGAGGCCAGAGCGGGCGUGGGGGCCCCCCUCGGGUCAGGAGCCGGCCUCACCUUUGCAGUUCUUAUAUACCCGGCCAAGCAUCCCAAACACGCGGCCCUGGCCAAGUGGCCCCCUCGGGCUGCGCUCCCUGACCAUAUUUAGUCAAGCAGGGGAAAAAAUAGCCUGUCAGCUGGGCCGCGGCUGGCCCGGCCACCGGGAACAGGGUGGGAGCACCCACGCCAUUGACGGCGGGUCCCGGGCUCAGGCUGCUGUCCUGCCCCUCCCGGCCCCUCCCUGACAGGCCUCCCACCGGCUGUCCCUGCCCGAGAUCCCCCCGCUAUUUUUAGCCCAGCCAGUACAGAGGCGCCUCCUCAGUAGCCGGGCAGCAGCCUCCAUGCCAUGCCAGCCGGCUCCUAGGGUGCCCUGGGGAGACCCGGGCAUCUCCCAGGCUGCAGGGCCGGGGGUGGGGGGGGCGGGCAGAAUGGUACGGCCUCCUUCGCUGCUCUGAGCCUCCAGUGGGCUGAGCCCACCCAGGCCACCAGGAGUGGGUGGCCCCCUCCACAGUCCCAUCGGCUCUGCCCUUUUGCCUAGAAUUGGGGCCAGGAUCAGGUGGUGACAGAGCCACCUGGGUUUCCGGAGACUCUCAAGCCAACCCCAAGUCAUGACAAAUGCCAGUCGCCUUGGACAGAGGCAAGGUCAACCUGCUUGCCGCCCCCAGCCAGGCCCUGCCACCAAGGGGCCUGGACGCAGAGACCAGAGGCCUGAACUGGCAGACUGUCCUCACAGGCUGUGUGACGCUGGCUGGUCGUCCCAUCUCUCUGGGGCCCCACAGGACUGGGGACCAGGUCGUGGAAUGACAGUGGACCACAGUGGUCCGGGGACCCCGCUCGUUGGUGGCAGGCACAGGCCCGUGUGAUGGGGACAAUGAGCUUUGGUAUUUGUGAGUCCUGUCCAGAGCAUAGGUCCUCCUGUUCAGAAGCCACCUCAUAAAUGUCCCCAGUGCCUCCCGGACUUAGGAAGGCAUCCCCUUGUGGUUCUGGCCAGUUAGGGACACAGGGCCGGGGAGUCUAUGCCGCUCAGAACAGGCUCAGCUGCAUCUAAUCCCAGGGGAGCCCCUGAGGAGCCUGCACACCCCCCAGGCUGGCCCACAGGAGCUGAGGCAGGGCUCUCCUCCAGGUUCACCUCCUGGGCUCACGGCCCCUUCCCCACAUCCCAAGGCCGGCUCUGCAGAGUCAUGGGGAGAAGCCGGAGCCCCAGCCACACUCGCCACACACGCCGACACCCACUCUGGUGUCCUCCGGCCAGCGACAGCGAGGGACAGAGGGACGCCCCCUGCACCUGCCCAGUGCAGAGGCUUCUUGAGUGAUGCCAGGCCCUUCUCCCAGCCCUGUACGCCCCGCUAAAGACCCCAUGUCUCACCAUAAAGGAGGCCAGGAGGUUUUAAGCUUCUACCUGGUCUGAGCACUUUUCUGGAAACUAAAUAGCCACUCGGCUUCCCACUGGCAGCGGGAGAGCGUGGUGUGAGGUGUGGUGUCCAAACUCCCCCUGCAAGGCCCCUCCCCUGCAGCCCACUUCCUCCUGCCUGCCGUCUCCAGGCAGGGUUGAGGGGGGCAGGCCAGGCCUGCAGCUGGGGUCAGGGGCAUAGACAGCCACAAUGGGGGAGGUGGGGAGCAGUCUGCAGGCCUGGGCAGGCGGCUCUGUAAAGGAUGCGGGUGCUUUGUGGUGGUGAGAGAGAGGGUAUGCAGCAGACGUGGCCAUAAAUCACCCUCCUCACGGCAGCCCCACACCCACGGACCAGGGCACGGGCACAGGGCCAUCUCCUUCCAGGAGAAGGGCUGGUGUGGGUGGCCAGAUCUGACAGCCCCCAGGCCGUAGGACAGAGCCAGAAGACAGAGCAGUUCCCCCGUUUACCCAUAGCACCAGCCUCACAGUAACAGCCGGCACACAGCACUUAGGCUGCCUGGUGUUCCAGAAGCUUCUGCAGGGGCUCUAUGCUGCACUCAAGGCAUCCCUAAGAGGAGAGCAUUUUGCUGUCCCCACUUUACGGAGAAGGAACGUGGGCUCAGGGUGGUUUAAGGCGUGAAUGAAUGAAGGAGCAAGCAGUAAGCCCCGACAGCAAGGCCACCACAGCCCUCGCCCCACAGGGACGCCUGAGCAAGGACCCAAGCAGGGGACAAGCAGGCUCACCCCGCCCUUGCGGGGCUGACCACGAGGCCCCGUCCGGUGGAACACGCCAUGACGCUUCAGGAGGCUCAUGUAGCUGGCGCCGUAUGGGACAGCGGGGGAGAGAGAAAAUGCACAGCCCAGGGAAUGUGGAGACAGGCCCAGCGCCAGGCAUGGGGGCCGGAAGGAGCAGCCGGGGAGCAGGGGGCAGGGCCUGGAGUCCCGCCUUGCAGGUCAGAGAUCUGAACCUGCCCCAGCCCCAGGACUCUGAGUGCAGCAAGAGGGGAGCCGGGCUGGAGAGUGGGGAGCACGGAGACUGUGGCCUGGAUGGUGCCAGAGCAAACAGGAGAGAGGCUGCCCAACGCAGAGGCUGCAGCACAGACCAGAGGGUCCCGGGGCUGACUGGGUGGGGGCAGCUCCCAGCGAGAGGCCCCUGGGAUUUGGGUAAGUAGAGGCACAUGCAGACUCUGGCCACAGGGCACCUCGCGCACGAGGGGAGUUCACCACACAAGCUGAGCGGAGGGCGGACGCAGGAGAGCAGCGGUUUCUCGGAAGCCAAGGGCGGUCAUGGAGCCCCACGCCACAGCGCUUCCCACGGGGCCACACCAUCCGGUCUGCGGAGGGGGCUGCAUUGCCGGGAAGGACCAUCUGAUUCUGGAUUCCAGCCUCACCCUGGGCCACCGCUGAGUGUCCCAAGUGGCCCCUUAGCCCCCAGGGCCAGGCGGCAUCCCAAUCCCCUAGGGAUGUCUGUGCUCAGAAUGUGGCACACACGCCCCGGCAGGGCCAUCCUCCUCCUCCUGCACCCGCCACAGCCGUGGAUUCGGGGUCUCUAUCGUGGGCAGAAAUUCACACAGUCAAGGUGAGGGUCCCAGGAGCAGCUGUGACCAGGCCCCGGCUGCCAGGGAGAGGGGGUCUUCAGCCGACGGGGCAGACACCCUGAGAUGGACCCUUGUCCAGGGGAGGGCCCUGCCACCCACAAUUCCUUGGCAUUCCUGCACCAGCAGGACGGGCUGAGGGAGGCGCCUCACCAGUGCCAGCGCCCAGCAUCACUGUGCCCCGGUGGAGGGGGAGGCCCUUCCGAGCCUGGGCCUGGGUGUGGAUGAGGGCAGGUCUCUCACCUCUCUGACCUCAGCUUCCUCAACUGGGAAGGGGGGCCACAGCACCCCCUUAGGGGUGAUGAGGAAGUGGGAGCUCAGGGAGGACCCCGGGCAGGGCUGCCUCCUCACCUCUCUUCGGCCUUUGGACACUGGAGCUCAGAGGACCAAGUGAAUGAAUGAAUGACUCGAUCAAUCAACUGAUCCAUGAAUCCAUGGACCCCUGAACAGCUGGACAGCUGGGCUGUGGGCAGGACAGGGGACUCUGGCUGAAGCCGCGUUCAUAUGUGUUCAGCUUUGUGAGUGGGGCGAGGUUGAGGGCUUAUUCAGUGGGGGAGGUGCACGGCAGGGCCAGUACCCUUGGAGGGUCAGGCCACAGGGGCGGGGACACCUGCCAGGAUGCCCAACCCCAGAGGCAGUGGGAGCUGUUGGGGAGCCGUGGUCCCAGUCAGCGGUGGCUUGAUGAGGGCUGCUCCCACUUCAUCCGCAGGAUUCCAGCCGCAGCUACCCCACACCCGAGCUGUCCCUAGUCGCCCACCGCGGCCGGACAAAGCCCCAGCAGCCAAGGUGCUCCGUGGGGAGGGUUUCUUGGGUUUCUUGAAGCCAGUAUUUCCCAUAGUAUCUUACGUCCCAGCAGAGGCCUCCACUGUGCCCGGACCAGCGGCCCACUCAGUGAGUCGAGUGUGCACCUGGCACCCCUCUUUCUGGAAAUCCACGAACAAUGGGCUCCCAGCAGAGGACUGAGGCUGAGCAGGCCACUUCCCUGGAGCUGACCCCACAGCUGUCCUGCUCCUCCUUCGCCUUCUGCCAUGACUGUAAGCUUUCUGAGGGCUGACCAGAAGCCCAGCAGAUGCCAGCACCAUGCUUCCUAUACAGCCUGCAGAACCGUGAGCCAGCUAAACCUCUCCUCAUAAAUCACCGAGCCCCAGGUUUAUCUUUACAGCAAUGCAAGACCUGACUAAUACAGCACCAGCUCCCCAAAAUAAAAAGAAAUAUUCAAACAAAUAAGCGCACAGAAGUGUUCCCAGCAGCACUAUUCACAGCAGCCAAAAGGCGGAGGAGCCACAGGCUUGUCAGCUGAUGACAGAUAAAGAAAGCAUGGCCUGUCAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGUGGGUGGAUCACCUGAGGUUGGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCAGUCUCUACUAAAAAUAUAAAAAUUAGCUGGGUGUGAUGAUGAGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUUGGAAGGCUGAGGAACAAGAAUCGCUUGAACCCGGGAGGCAGAGGUCGCAGUGAACCGAGAUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2176.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2243.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 1104.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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