Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NEAT1:11

Sequence Length

2096 nt

GC Content

0.5458

CGCGCCUGGGUGUAGUUGUGGGGGAGGAAGUGGCUAGCUCAGGGCUUCAGGGGACAGACAGGGAGAGAUGACUGAGUUAGAUGAGACGAGGGGGCGGGCUGGGGGUGCGAGAAGGAAGCUUGGCAAGGAGACUAGGUCUAGGGGGACCACAGUGGGGCAGGCUGCAUGGAAAAUAUCCGCAGGGUCCCCCAGGCAGAACAGCCACGCUCCAGGCCAGGCUGUCCCUACUGCCUGGUGGAGGGGGAACUUGACCUCUGGGAGGGCGCCGCUCUUGCAUAGCUGAGCGAGCCCGGGUGCGCUGGUCUGUGUGGAAGGAGGAAGGCAGGGAGAGGUAGAAGGGGUGGAGGAGUCAGGAGGAAUAGGCCGCAGCAGCCCUGGAAAUGAUCAGGAAGGCAGGCAGUGGGUGCAGGGCUGCAGGAGGGCCGGGAGGGCUAAUCUUCAACUUGUCCAUGCCAGCAGCCCCUUUUUUUCCAGACCAAGGGCUGUGAACCCGCCUGGGGAUGAGGCCUGGUCUUGUGGAACUGAACUUAGCUCGACGGGGCUGACCGCUCUGGCCCAGGGUGGUAUGUAAUUUUCGCUCGGCCUGGGACGGGGCCCAGGCCGGGCCCAGCCUGGUGGAGCGUCCAGGUCUGGGUGCGAAGCCAGGCCCCUGGGCGGAGGUGAGGGGUGGUCUGAGGAGUGAUGUGGAGUUAAGGCGCCAUCCUCACCGGUGACUGGUGCGGCACCUAGCAUGUUUGACAGGCGGGGACUGCGAGGCACGCUGCUCGGGUGUUGGGGACAACAUUGACCAACGCUUUAUUUUCCAGGUGGCAGUGCUCCUUUUGGACUUUUCUCUAGGUUUGGCGCUAAACUCUUCUUGUGAGCUCACUCCACCCCUUCUUCCUCCCUUUAACUUAUCCAUUCACUUAAAACAUUACCUGGUCAUCUGGUAAGCCCGGGACAGUAAGCCGAGUGGCUGUUGGAGUCGGUAUUGUUGGUAAUGGUGGAGGAAGAGAGGCCUUCCCGCUGAGGCUGGGGUGGGGCGGAUCGGUGUUGCUUGCCUGCAGAGAGGGUGGGGAGUGAAUGUGCACCCUUGGGUGGGCCUGCAGCCAUCCAGCUGAAAGUUACAAAAAUGCUUCAUGGACCGUGGUUUGUUACUAUAGUGUUCCUCAUGGCGAGCAGAUGGAACCGGGAGACAUGGAGUCCCUGGCCAGUGUGAGUCCUAGCAUUGCAGGAGGGGAGACCCUGGAGGAGAGAGCCCGCCUCAAUUGAUGCCUGCAGAUUGAAUUUCCAGAGGCUUAGGAGGAGGAAGUUCUCCAAUGUUCUGUUUCCAGGCCUUGCUCAGGAAGCCCUGUAUUCAGGAGGCUACCAUUUAAAGUUUGCAGAUGAGCUUAUGGGGGGCAAUCUUAAAAAGUCCACAGCAGAUGCAUCCGGCUCGAGGGGCCAUCAGCUUUGAAUAAAUGCUUGUUCCAGAGCCCAUGAAUGCCAGCAGGCACCCCUCCUUUCCUGGGGUAAAGGUUUUCAGAUGCUGCAUCUUCUAAAUUGAGCCUCCGGUCAUACUAGUUUUGUGCUUGGAACCUUGCUUCAAGAAGAUCCCUAAGCUGUAGAACAUUUUAACGUUGAUGCCACAACGCAGAUUGAUGCCUUGUAGAUGGAGCUUGCAGAUGGAGCCCCGUGACCUCUCACCUACCCACCUGUUUGCCUGCCUUCUUGUGCGUUUCUCGGAGAAGUUCUUAGCCUGAUGAAAUAACUUGGGGCGUUGAAGAGCUGUUUAAUUUUAAAUGCCUUAGACUGGGGAUAUAUUAGAGGAAGCAGAUUGUCAAAUUAAGGGUGUCAUUGUGUUGUGCUAAACGCUGGGAGGGUACAAGUUGGUCAUUCCUAAAUCUGUGUGUGAGAAAUGGCAGGUCUAGUUUGGGCAUUGUGAUUGCAUUGCAGAUUACUAGGAGAAGGGAAUGGUGGGUACACCGGUAGUGCUCUUUUGUUCUUGCUUCGUUUUUUUAAACUUGAACUUUACUUCGUUAGAUUUCAUAAUACUUUCUUGGCAUUCUAGUAAGAGGACCCUGAGGUGGGAGUUGUGGGGGACGGGGAGAAGGGGACAGCUUGGCACCGGUCCCGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-805.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -845.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 621.95

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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