Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NEAT1:15

Sequence Length

1367 nt

GC Content

0.3943

GAUACAGUGUGGGUGGUGGGGGUGGUAGGAAAUGCAGGUUGAAGGGAAUUCUCUGGGGCUUUGGGGAAUUUAGUGCGUGGGUGAGCCAAGAAAAUACUAAUUAAUAAUAGUAAGUUGUUAGUGUUGGUUAAGUUGUUGCUUGGAAGUGAGAAGUUGCUUAGAAACUUUCCAAAGUGCUUAGAACUUUAAGUGCAAACAGACAAACUAACAAACAAAAAUUGUUUUGCUUUGCUACAAGGUGGGGAAGACUGAAGAAGUGUUAACUGAAAACAGGUGACACAGAGUCACCAGUUUUCCGAGAACCAAAGGGAGGGGUGUGUGAUGCCAUCUCACAGGCAGGGGAAAUGUCUUUACCAGCUUCCUCCUGGUGGCCAAGACAGCCUGUUUCAGAGGGUUGUUUUGUUUGGGGUGUGGGUGUUAUCAAGUGAAUUAGUCACUUGAAAGAUGGGCGUCAGACUUGCAUACGCAGCAGAUCAGCAUCCUUCGCUGCCCCUUAGCAACUUAGGUGGUUGAUUUGAAACUGUGAAGGUGUGAUUUUUUCAGGAGCUGGAAGUCUUAGAAAAGCCUUGUAAAUGCCUAUAUUGUGGGCUUUUAACGUAUUUAAGGGACCACUUAAGACGAGAUUAGAUGGGCUCUUCUGGAUUUGUUCCUCAUUUGUCACAGGUGUCUUGUGAUUGAAAAUCAUGAGCGAAGUGAAAUUGCAUUGAAUUUCAAGGGAAUUUAGUAUGUAAAUCGUGCCUUAGAAACACAUCUGUUGUCUUUUCUGUGUUUGGUCGAUAUUAAUAAUGGCAAAAUUUUUGCCUAUCUAGUAUCUUCAAAUUGUAGUCUUUGUAACAACCAAAUAACCUUUUGUGGUCACUGUAAAAUUAAUAUUUGGUAGACAGAAUCCAUGUACCUUUGCUAAGGUUAGAAUGAAUAAUUUAUUGUAUUUUUAAUUUGAAUGUUUGUGCUUUUUAAAUGAGCCAAGACUAGAGGGGAAACUAUCACCUAAAAUCAGUUUGGAAAACAAGACCUAAAAAGGGAAGGGGAUGGGGAUUGUGGGGAGAGAGUGGGCGAGGUGCCUUUACUACAUGUGUGAUCUGAAAACCCUGCUUGGUUCUGAGCUGCGUCUAUUGAAUUGGUAAAGUAAUACCAAUGGCUUUUUAUCAUUUCCUUCUUCCCUUUAAGUUUCACUUGAAAUUUUAAAAAUCAUGGUUAUUUUUAUCGUUGGGAUCUUUCUGUCUUCUGGGUUCCAUUUUUUAAAUGUUUAAAAAUAUGUUGACAUGGUAGUUCAGUUCUUAACCAAUGACUUGGGGAUGAUGCAAACAAUUACUGUCGUUGGGAUUUAGAGUGUAUUAGUCACGCAUGUAUGGGGAAGUAGUCUCGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-370.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -400.56

Frequency: 0.0000

Diversity: 361.1

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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