Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NEAT1:24

Sequence Length

1721 nt

GC Content

0.5404

GGAGUUAGCGACAGGGAGGGAUGCGCGCCUGGGUGUAGUUGUGGGGGAGGAAGUGGCUAGCUCAGGGCUUCAGGGGACAGACAGGGAGAGAUGACUGAGUUAGAUGAGACGAGGGGGCGGGCUGGGGGUGCGAGAAGGAAGCUUGGCAAGGAGACUAGGUCUAGGGGGACCACAGUGGGGCAGGCUGCAUGGAAAAUAUCCGCAGGGUCCCCCAGGCAGAACAGCCACGCUCCAGGCCAGGCUGUCCCUACUGCCUGGUGGAGGGGGAACUUGACCUCUGGGAGGGCGCCGCUCUUGCAUAGCUGAGCGAGCCCGGGUGCGCUGGUCUGUGUGGAAGGAGGAAGGCAGGGAGAGGUAGAAGGGGUGGAGGAGUCAGGAGGAAUAGGCCGCAGCAGCCCUGGAAAUGAUCAGGAAGGCAGGCAGUGGGUGCAGGGCUGCAGGAGGGCCGGGAGGGCUAAUCUUCAACUUGUCCAUGCCAGCAGCCCCUUUUUUUCCAGACCAAGGGCUGUGAACCCGCCUGGGGAUGAGGCCUGGUCUUGUGGAACUGAACUUAGCUCGACGGGGCUGACCGCUCUGGCCCAGGGUGGUGGCAGUGCUCCUUUUGGACUUUUCUCUAGGUUUGGCGCUAAACUCUUCUUGUGAGCUCACUCCACCCCUUCUUCCUCCCUUUAACUUAUCCAUUCACUUAAAACAUUACCUGGUCAUCUGGUAAGCCCGGGACAGUAAGCCGAGUGGCUGUUGGAGUCGGUAUUGUUGGUAAUGGUGGAGGAAGAGAGGCCUUCCCGCUGAGGCUGGGGUGGGGCGGAUCGGUGUUGCUUGCCUGCAGAGAGGGUGGGGAGUGAAUGUGCACCCUUGGGUGGGCCUGCAGCCAUCCAGCUGAAAGUUACAAAAAUGCUUCAUGGACCGUGGUUUGUUACUAUAGUGUUCCUCAUGGCGAGCAGAUGGAACCGGGAGACAUGGAGUCCCUGGCCAGUGUGAGUCCUAGCAUUGCAGGAGGGGAGACCCUGGAGGAGAGAGCCCGCCUCAAUUGAUGCCUGCAGAUUGAAUUUCCAGAGGCUUAGGAGGAGGAAGUUCUCCAAUGUUCUGUUUCCAGGCCUUGCUCAGGAAGCCCUGUAUUCAGGAGGCUACCAUUUAAAGUUUGCAGAUGAGCUUAUGGGGGGCAAUCUUAAAAAGUCCACAGCAGAUGCAUCCGGCUCGAGGGGCCAUCAGCUUUGAAUAAAUGCUUGUUCCAGAGCCCAUGAAUGCCAGCAGGCACCCCUCCUUUCCUGGGGUAAAGGUUUUCAGAUGCUGCAUCUUCUAAAUUGAGCCUCCGGUCAUACUAGUUUUGUGCUUGGAACCUUGCUUCAAGAAGAUCCCUAAGCUGUAGAACAUUUUAACGUUGAUGCCACAACGCAGAUUGAUGCCUUGUAGAUGGAGCUUGCAGAUGGAGCCCCGUGACCUCUCACCUACCCACCUGUUUGCCUGCCUUCUUGUGCGUUUCUCGGAGAAGUUCUUAGCCUGAUGAAAUAACUUGGGGCGUUGAAGAGCUGUUUAAUUUUAAAUGCCUUAGACUGGGGAUAUAUUAGAGGAAGCAGAUUGUCAAAUUAAGGGUGUCAUUGUGUUGUGCUAAACGCUGGGAGGGUACAAGUUGGUCAUUCCUAAAUCUGUGUGUGAGAAAUGGCAGGUCUAGUUUGGGCAUUGUGAUUGCAUUGCAGAUUACUAGGAGAAGGGAAUGGUGGGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-640.9 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -674.03

Frequency: 0.0000

Diversity: 631.44

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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