Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NEAT1:26
Sequence Length
6847 nt
GC Content
0.4611
GGAGUUAGCGACAGGGAGGGAUGCGCGCCUGGGUGUAGUUGUGGGGGAGGAAGUGGCUAGCUCAGGGCUUCAGGGGACAGACAGGGAGAGAUGACUGAGUUAGAUGAGACGAGGGGGCGGGCUGGGGGUGCGAGAAGGAAGCUUGGCAAGGAGACUAGGUCUAGGGGGACCACAGUGGGGCAGGCUGCAUGGAAAAUAUCCGCAGGGUCCCCCAGGCAGAACAGCCACGCUCCAGGCCAGGCUGUCCCUACUGCCUGGUGGAGGGGGAACUUGACCUCUGGGAGGGCGCCGCUCUUGCAUAGCUGAGCGAGCCCGGGUGCGCUGGUCUGUGUGGAAGGAGGAAGGCAGGGAGAGGUAGAAGGGGUGGAGGAGUCAGGAGGAAUAGGCCGCAGCAGCCCUGGAAAUGAUCAGGAAGGCAGGCAGUGGGUGCAGGGCUGCAGGAGGGCCGGGAGGGCUAAUCUUCAACUUGUCCAUGCCAGCAGCCCCUUUUUUUCCAGACCAAGGGCUGUGAACCCGCCUGGGGAUGAGGCCUGGUCUUGUGGAACUGAACUUAGCUCGACGGGGCUGACCGCUCUGGCCCAGGGUGGUAUGUAAUUUUCGCUCGGCCUGGGACGGGGCCCAGGCCGGGCCCAGCCUGGUGGAGCGUCCAGGUCUGGGUGCGAAGCCAGGCCCCUGGGCGGAGGUGAGGGGUGGUCUGAGGAGUGAUGUGGAGUUAAGGCGCCAUCCUCACCGGUGACUGGUGCGGCACCUAGCAUGUUUGACAGGCGGGGACUGCGAGGCACGCUGCUCGGGUGUUGGGGACAACAUUGACCAACGCUUUAUUUUCCAGGUGGCAGUGCUCCUUUUGGACUUUUCUCUAGGUUUGGCGCUAAACUCUUCUUGUGAGCUCACUCCACCCCUUCUUCCUCCCUUUAACUUAUCCAUUCACUUAAAACAUUACCUGGUCAUCUGGUAAGCCCGGGACAGUAAGCCGAGUGGCUGUUGGAGUCGGUAUUGUUGGUAAUGGUGGAGGAAGAGAGGCCUUCCCGCUGAGGCUGGGGUGGGGCGGAUCGGUGUUGCUUGCCUGCAGAGAGGGUGGGGAGUGAAUGUGCACCCUUGGGUGGGCCUGCAGCCAUCCAGCUGAAAGUUACAAAAAUGCUUCAUGGACCGUGGUUUGUUACUAUAGUGUUCCUCAUGGCGAGCAGAUGGAACCGGGAGACAUGGAGUCCCUGGCCAGUGUGAGUCCUAGCAUUGCAGGAGGGGAGACCCUGGAGGAGAGAGCCCGCCUCAAUUGAUGCCUGCAGAUUGAAUUUCCAGAGGCUUAGGAGGAGGAAGUUCUCCAAUGUUCUGUUUCCAGGCCUUGCUCAGGAAGCCCUGUAUUCAGGAGGCUACCAUUUAAAGUUUGCAGAUGAGCUUAUGGGGGGCAAUCUUAAAAAGUCCACAGCAGAUGCAUCCGGCUCGAGGGGCCAUCAGCUUUGAAUAAAUGCUUGUUCCAGAGCCCAUGAAUGCCAGCAGGCACCCCUCCUUUCCUGGGGUAAAGGUUUUCAGAUGCUGCAUCUUCUAAAUUGAGCCUCCGGUCAUACUAGUUUUGUGCUUGGAACCUUGCUUCAAGAAGAUCCCUAAGCUGUAGAACAUUUUAACGUUGAUGCCACAACGCAGAUUGAUGCCUUGUAGAUGGAGCUUGCAGAUGGAGCCCCGUGACCUCUCACCUACCCACCUGUUUGCCUGCCUUCUUGUGCGUUUCUCGGAGAAGUUCUUAGCCUGAUGAAAUAACUUGGGGCGUUGAAGAGCUGUUUAAUUUUAAAUGCCUUAGACUGGGGAUAUAUUAGAGGAAGCAGAUUGUCAAAUUAAGGGUGUCAUUGUGUUGUGCUAAACGCUGGGAGGGUACAAGUUGGUCAUUCCUAAAUCUGUGUGUGAGAAAUGGCAGGUCUAGUUUGGGCAUUGUGAUUGCAUUGCAGAUUACUAGGAGAAGGGAAUGGUGGGUACACCGGUAGUGCUCUUUUGUUCUUGCUUCGUUUUUUUAAACUUGAACUUUACUUCGUUAGAUUUCAUAAUACUUUCUUGGCAUUCUAGUAAGAGGACCCUGAGGUGGGAGUUGUGGGGGACGGGGAGAAGGGGACAGCUUGGCACCGGUCCCGUGGGCGUUGCAGUGUGGGGGAUGGGGGUAUGCAGCUUGGCACUGGUACUGGGAGGGAUGAGGGUGAAGAAGGGGAGAGGGUUGGUUAGAGAUACAGUGUGGGUGGUGGGGGUGGUAGGAAAUGCAGGUUGAAGGGAAUUCUCUGGGGCUUUGGGGAAUUUAGUGCGUGGGUGAGCCAAGAAAAUACUAAUUAAUAAUAGUAAGUUGUUAGUGUUGGUUAAGUUGUUGCUUGGAAGUGAGAAGUUGCUUAGAAACUUUCCAAAGUGCUUAGAACUUUAAGUGCAAACAGACAAACUAACAAACAAAAAUUGUUUUGCUUUGCUACAAGGUGGGGAAGACUGAAGAAGUGUUAACUGAAAACAGGUGACACAGAGUCACCAGUUUUCCGAGAACCAAAGGGAGGGGUGUGUGAUGCCAUCUCACAGGCAGGGGAAAUGUCUUUACCAGCUUCCUCCUGGUGGCCAAGACAGCCUGUUUCAGAGGGUUGUUUUGUUUGGGGUGUGGGUGUUAUCAAGUGAAUUAGUCACUUGAAAGAUGGGCGUCAGACUUGCAUACGCAGGAAUUUAGUAUGUAAAUCGUGCCUUAGAAACACAUCUGUUGUCUUUUCUGUGUUUGGUCGAUAUUAAUAAUGGCAAAAUUUUUGCCUAUCUAGUAUCUUCAAAUUGUAGUCUUUGUAACAACCAAAUAACCUUUUGUGGUCACUGUAAAAUUAAUAUUUGGUAGACAGAAUCCAUGUACCUUUGCUAAGGUUAGAAUGAAUAAUUUAUUGUAUUUUUAAUUUGAAUGUUUGUGCUUUUUAAAUGAGCCAAGACUAGAGGGGAAACUAUCACCUAAAAUCAGUUUGGAAAACAAGACCUAAAAAGGGAAGGGGAUGGGGAUUGUGGGGAGAGAGUGGGCGAGGUGCCUUUACUACAUGUGUGAUCUGAAAACCCUGCUUGGUUCUGAGCUGCGUCUAUUGAAUUGGUAAAGUAAUACCAAUGGCUUUUUAUCAUUUCCUUCUUCCCUUUAAGUUUCACUUGAAAUUUUAAAAAUCAUGGUUAUUUUUAUCGUUGGGAUCUUUCUGUCUUCUGGGUUCCAUUUUUUAAAUGUUUAAAAAUAUGUUGACAUGGUAGUUCAGUUCUUAACCAAUGACUUGGGGAUGAUGCAAACAAUUACUGUCGUUGGGAUUUAGAGUGUAUUAGUCACGCAUGUAUGGGGAAGUAGUCUCGGGUAUGCUGUUGUGAAAUUGAAACUGUAAAAGUAGAUGGUUGAAAGUACUGGUAUGUUGCUCUGUAUGGUAAGAACUAAUUCUGUUACGUCAUGUACAUAAUUACUAAUCACUUUUCUUCCCCUUUACAGCACAAAUAAAGUUUGAGUUCUAAACUCAUUAGAAUUGUUGUAUUGCUAUGUUACAUUUCUCGACCCCUAUCACAUUGCCUUCAUAACGACUUUGGAUGUAUCUUCAUAUUGUAGAUUUAGGUCUAGAUUUGCUAGCUCCAAGUAAUUAAGGCCAUGUAGGAGAGCAUGGUAACCACAGAUAGAACUGGUAUUAUCCCAAGUGGUCUGCAGACUGCUGAGUGGGGAUGGGAUCUGCUCUCUGUUGAGAGUUGGUAAUCAUUGGUUUGAAAUGUGAUGAAACCACUCAAGCCAAUGAAGGUGGGUGUGUAGGUGGGGAGUACUUUGCCAUAAUAUUUUAAAACAUUACCUGGUUAGAGUUCUAAGUGGUACUUAUUUUUGUUUGGUUAGGGGAAAGCCUGAAUAAAAACAGAAAUGGACACAUAAUAUGCAUAUUCCAUAGUCUUUGGGAGGCUGGAAUGUGCCUGGGAUUUGGGUCUAAGUGUAUGCGUAAUUCUUACCUCACUAAAGAAUUUGCCUUGUUUUUUUCCUUUUGGUGAGUGACUAAAACGUCUGGGCUUCCCUGUGUGCGUGCUACAGUAAGCAAGCAGAGGCUGUGCAAAGGUGUGAGCAGGAUCACGUGGAAUCUGGAGGAUACAUCUUGGCUUGCAAACUGCCUCUGUCUCCUGGGUGGGACUGUUCUGUCCUUGCACUGCUGUUCUGUGUUACCUCUUGGGGUGUAAGGUUUUGCUUACAGGAGACAAACUUUGGGCGUAGAAUGGAAGCCACUGCCAGCCUCUGUGCUGAGAAGGAAGGUGCUUGUUUCAAAGGGAGCAGCAAGGGAGGCUUGUUCUACUCACCUGGGCCUGUUUGCCUGAGAAGGGGAGAUAAGGGCUGAACUGGGACUAGCCAGGGGGACCAACACAAAUGGUGGGGGAUCAUGACCUGAAGGAUUCUUUCCUUCCCAUGAGCUGCAGGGCUGGUUGCCGUCCUUGCAACUGUGUCUUAUUUGCCUGUGCCGUUAUAUCUUGGUGACCCCUCCACGUGUACACUACUGACAAACGGGUGGAGUGCUGGGGAGAAGUCACUGUGCCGCCCACCUAGUAAACCUUCUGUCUGUGCUCAUGGCAUCUCCAAGAUGGGGCACUGCUGUGUGCAGAAUCCAGGGUCCUCUUUCUGCUUGCAACUCCUUUCCCUGGAUGCCCCAGAAACAAUCCAGGCCUCCUUUCCUAUCUUACCCCUUUGCUUUGCUUUUUACCCCAGCACCUCUAUAACCGCCUUCUCUUCUUUUCAGAACUCCUUGUUUCUCGUCCUGUUUUUUAUGAUUACAAAACUCUUGCUUCCACCCUGGAAGAUAACUGCUAUAGAUGCCUGUAUGUAAAUGGUGCUGUCUCCAGCAACUGGCAUGCUGAAGAAGAAUUGAUUCACGGGGUAUAAAUGUUGGGGAUUGGAAGUGGGGAUGAAAUGGCACUUGUUGAUACAGGAGCAGAGAGGUGAGGCCGACUGCUGAAGACAGCUCGCCACCCUCCUUGCCUCCACUCCAAUCCAGGGGCUGGGGCCACAUUCUUUG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2265.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2402.93
Frequency: 0.0000
Diversity: 1712.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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