Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NEAT1:30
Sequence Length
3441 nt
GC Content
0.4760
GCAAAAGUUGUGGCAAGUCCAGCCGGAGUUAGCGACAGGGAGGGAUGCGCGCCUGGGUGUAGUUGUGGGGGAGGAAGUGGCUAGCUCAGGGCUUCAGGGGACAGACAGGGAGAGAUGACUGAGUUAGAUGAGACGAGGGGGCGGGCUGGGGGUGCGAGAAGGAAGCUUGGCAAGGAGACUAGGUCUAGGGGGACCACAGUGGGGCAGGCUGCAUGGAAAAUAUCCGCAGGGUCCCCCAGGCAGAACAGCCACGCUCCAGGCCAGGCUGUCCCUACUGCCUGGUGGAGGGGGAACUUGACCUCUGGGAGGGCGCCGCUCUUGCAUAGCUGAGCGAGCCCGGGUGCGCUGGUCUGUGUGGAAGGAGGAAGGCAGGGAGAGGUAGAAGGGGUGGAGGAGUCAGGAGGAAUAGGCCGCAGCAGCCCUGGAAAUGAUCAGGAAGGCAGGCAGUGGGUGCAGGGCUGCAGGAGGGCCGGGAGGGCUAAUCUUCAACUUGUCCAUGCCAGCAGCCCCUUUUUUUCCAGACCAAGGGCUGUGAACCCGCCUGGGGAUGAGGCCUGGUCUUGUGGAACUGAACUUAGCUCGACGGGGCUGACCGCUCUGGCCCAGGGUGGUGGCAGUGCUCCUUUUGGACUUUUCUCUAGGUUUGGCGCUAAACUCUUCUUGUGAGCUCACUCCACCCCUUCUUCCUCCCUUUAACUUAUCCAUUCACUUAAAACAUUACCUGGUCAUCUGGUAAGCCCGGGACAGUAAGCCGAGUGGCUGUUGGAGUCGGUAUUGUUGGUAAUGGUGGAGGAAGAGAGGCCUUCCCGCUGAGGCUGGGGUGGGGCGGAUCGGUGUUGCUUGCCUGCAGAGAGGGUGGGGAGUGAAUGUGCACCCUUGGGUGGGCCUGCAGCCAUCCAGCUGAAAGUUACAAAAAUGCUUCAUGGACCGUGGUUUGUUACUAUAGUGUUCCUCAUGGCGAGCAGAUGGAACCGGGAGACAUGGAGUCCCUGGCCAGUGUGAGUCCUAGCAUUGCAGGAGGGGAGACCCUGGAGGAGAGAGCCCGCCUCAAUUGAUGCCUGCAGAUUGAAUUUCCAGAGGCUUAGGAGGAGGAAGUUCUCCAAUGUUCUGUUUCCAGGCCUUGCUCAGGAAGCCCUGUAUUCAGGAGGCUACCAUUUAAAGUUUGCAGAUGAGCUUAUGGGGGGCAAUCUUAAAAAGUCCACAGCAGAUGCAUCCGGCUCGAGGGGCCAUCAGCUUUGAAUAAAUGCUUGUUCCAGAGCCCAUGAAUGCCAGCAGGCACCCCUCCUUUCCUGGGGUAAAGGUUUUCAGAUGCUGCAUCUUCUAAAUUGAGCCUCCGGUCAUACUAGUUUUGUGCUUGGAACCUUGCUUCAAGAAGAUCCCUAAGCUGUAGAACAUUUUAACGUUGAUGCCACAACGCAGAUUGAUGCCUUGUAGAUGGAGCUUGCAGAUGGAGCCCCGUGACCUCUCACCUACCCACCUGUUUGCCUGCCUUCUUGUGCGUUUCUCGGAGAAGUUCUUAGCCUGAUGAAAUAACUUGGGGCGUUGAAGAGCUGUUUAAUUUUAAAUGCCUUAGACUGGGGAUAUAUUAGAGGAAGCAGAUUGUCAAAUUAAGGGUGUCAUUGUGUUGUGCUAAACGCUGGGAGGGUACAAGUUGGUCAUUCCUAAAUCUGUGUGUGAGAAAUGGCAGGUCUAGUUUGGGCAUUGUGAUUGCAUUGCAGAUUACUAGGAGAAGGGAAUGGUGGGUACACCGGUAGUGCUCUUUUGUUCUUGCUUCGUUUUUUUAAACUUGAACUUUACUUCGUUAGAUUUCAUAAUACUUUCUUGGCAUUCUAGUAAGAGGACCCUGAGGUGGGAGUUGUGGGGGACGGGGAGAAGGGGACAGCUUGGCACCGGUCCCGUGGGCGUUGCAGUGUGGGGGAUGGGGGUAUGCAGCUUGGCACUGGUACUGGGAGGGAUGAGGGUGAAGAAGGGGAGAGGGUUGGUUAGAGAUACAGUGUGGGUGGUGGGGGUGGUAGGAAAUGCAGGUUGAAGGGAAUUCUCUGGGGCUUUGGGGAAUUUAGUGCGUGGGUGAGCCAAGAAAAUACUAAUUAAUAAUAGUAAGUUGUUAGUGUUGGUUAAGUUGUUGCUUGGAAGUGAGAAGUUGCUUAGAAACUUUCCAAAGUGCUUAGAACUUUAAGUGCAAACAGACAAACUAACAAACAAAAAUUGUUUUGCUUUGCUACAAGGUGGGGAAGACUGAAGAAGUGUUAACUGAAAACAGGUGACACAGAGUCACCAGUUUUCCGAGAACCAAAGGGAGGGGUGUGUGAUGCCAUCUCACAGGCAGGGGAAAUGUCUUUACCAGCUUCCUCCUGGUGGCCAAGACAGCCUGUUUCAGAGGGUUGUUUUGUUUGGGGUGUGGGUGUUAUCAAGUGAAUUAGUCACUUGAAAGAUGGGCGUCAGACUUGCAUACGCAGCAGAUCAGCAUCCUUCGCUGCCCCUUAGCAACUUAGGUGGUUGAUUUGAAACUGUGAAGGUGUGAUUUUUUCAGGAGCUGGAAGUCUUAGAAAAGCCUUGUAAAUGCCUAUAUUGUGGGCUUUUAACGUAUUUAAGGGACCACUUAAGACGAGAUUAGAUGGGCUCUUCUGGAUUUGUUCCUCAUUUGUCACAGGUGUCUUGUGAUUGAAAAUCAUGAGCGAAGUGAAAUUGCAUUGAAUUUCAAGGGAAUUUAGUAUGUAAAUCGUGCCUUAGAAACACAUCUGUUGUCUUUUCUGUGUUUGGUCGAUAUUAAUAAUGGCAAAAUUUUUGCCUAUCUAGUAUCUUCAAAUUGUAGUCUUUGUAACAACCAAAUAACCUUUUGUGGUCACUGUAAAAUUAAUAUUUGGUAGACAGAAUCCAUGUACCUUUGCUAAGGUUAGAAUGAAUAAUUUAUUGUAUUUUUAAUUUGAAUGUUUGUGCUUUUUAAAUGAGCCAAGACUAGAGGGGAAACUAUCACCUAAAAUCAGUUUGGAAAACAAGACCUAAAAAGGGAAGGGGAUGGGGAUUGUGGGGAGAGAGUGGGCGAGGUGCCUUUACUACAUGUGUGAUCUGAAAACCCUGCUUGGUUCUGAGCUGCGUCUAUUGAAUUGGUAAAGUAAUACCAAUGGCUUUUUAUCAUUUCCUUCUUCCCUUUAAGUUUCACUUGAAAUUUUAAAAAUCAUGGUUAUUUUUAUCGUUGGGAUCUUUCUGUCUUCUGGGUUCCAUUUUUUAAAUGUUUAAAAAUAUGUUGACAUGGUAGUUCAGUUCUUAACCAAUGACUUGGGGAUGAUGCAAACAAUUACUGUCGUUGGGAUUUAGAGUGUAUUAGUCACGCAUGUAUGGGGAAGUAGUCUCGGGUAUGCUGUUGUGAAAUUGAAACUGUAAAAGUAGAUGGUUGAAAGUACUGGUAUGUUGCUCUGUAUGGUAAGAACUAAUUCUGUUACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1136 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1208.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 980.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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