Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

PRKCQ-AS1:1

Sequence Length

1054 nt

GC Content

0.5351

CCGGCCUCCCGGGACCCGGCACCUCUAGCCAGGGACGCGCGCUCGGUCCCCCGCCGUGCGCCCCCGGUCCCGCGCCCAGGCUCCCGCCCCUGGCCUCCUUACCAGCCACUUGUCGCCCAGCUGCGAACUGGAGCGGGAGGCGGCGGCCGGAGGGCCCAGGACAGCCCCGGGAGGGCGGCGAGGCGGAGCAGGAGCGCCCCGGCUCCGGCCACAUUCUCAGAGUCAGGAAAAGGGGCGAGAGGCCACAUGUCUCCCUCUCGCCCAACUGAAAACGAAACGGCGCUCCAGCAGAUUGGGUGGAAAGAGCUGGGUCUCUUUUCUCUGUUUUUCACGCUAGAAAGGGCUUGUAAACAUUGUUCCUUUUAAAAUGACCUACCCCAGGCAUUUGUUUGGGCACACUUCUGUCCUGGGGUCAUCGUUCCUAGGUGGCUUCGGACCUGGGACUUUUCCUGUAUCUGCACAUUGUCGUUUUAUACACAAUUGCCAAGGUGGGACUGCUUUCAACUUUACUGUGCUUGAAGCUGCAAAGGUUCUGCCCUGAUGUUUCCUGGAAUAAUGCUGAGGACUGCCUUUCGGGUAGCCGCCCUAUUCAGUUCACUUCAUCUCGGAAAUACCUGACCCCUGCCUUGGAUCCAGCGGCCCUCCUGAGAGCUGAGGAAGGAGGAAAUCCUAUGUGUCUGCUCCCGGAGCUGCCACAACCCAUCUUCCCACAACUCGGAACUUGGAAAAAGGAACCCAGGACACGACUUUGCUUUUCUUUUGGACCUAGUUGGUGAUUAUACUCUGUCUCCCAUGGAGACCACGUCUUGCAUCCUUCCUUCUAUAUGGGAUUUAGGAUAGAAAUUAAAAAGAAAACAUAUUAUUUUGAGUCUUGAUUUGGAGAAAGAAGUCACAGCUUGGAGGAAACCAGUUUGCACUAUUUGAUGAGGAAUUUGGCCACCAAACCACUGAUACUUUCCCAAAGGUUUGGCAGAAAUUGUUUUUUGAGUGGCUCACCAGAGUACCCAGAAGAAUCAGUAUGGAAUUAGAGGACAGUGGCCUACCCUAAAUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-373.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -388.5

Frequency: 0.0000

Diversity: 312.73

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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