Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

PRKCQ-AS1:18

Sequence Length

661 nt

GC Content

0.4327

AGGAGGAAAUCCUAUGUGUCUGCUCCCGGAGCUGCCACAACCCAUCUUCCCACAACUCGGAACUUGGAAAAAGGAACCCAGGACACGACUUUGCUUUUCUUUUGGACCUAGUUGAAGUCACAGCUUGGAGGAAACCAGUUUGCACUAUUUGAUGAGGAAUUUGGCCACCAAACCACUGAUACUUUCCCAAAGAUACAAGUUAACAGGAUAUGCUUCUGGCCUGUUUCUGGAUUCUAAGGGUAGAACCAGCAUAAAACUAGUCAGUCCAAGUAUUUCUAAAGAUCCACAGACACAGUUCUCCUGGAUUUGGGAAGCCUAGAGAUAUUAGCACAAUAAUUAAGGCCCAACAACUUUUAAAAGCCUUUCCACUGCACAGUGAAAGAAAACCACAAACUCCUUGUUUAAUAAGUGGGAUCACGUGCUUUUAACACGAGGAAAAGGUCAAUCUGAAGCAACUGAUAUGGAACUGCCAGAGUAGGAGUUGAAAAUCUUCCUAAACUGCUGGAGGAUACACCUCUGAUAGCUUGAGACAAAUAUCCUCUUGAUCAUUGUUUCACCAUAUUUGUCUUUGCUCAUGGAGAACCAUUUUGAUCCGUGGUUUAGCCUCCCAGGUGAUUGAACAAUACCGGUGAUCUGAGGCAGACCCUCUGUGACGGAUAAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-168.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -179.92

Frequency: 0.0000

Diversity: 219.68

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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