Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

PRKCQ-AS1:21

Sequence Length

767 nt

GC Content

0.4068

CGGAGCUGCCACAACCCAUCUUCCCACAACUCGGAACUUGGAAAAAGGAACCCAGGACACGACUUUGCUUUUCUUUUGGACCUAGUUGAUACAAGUUAACAGGAUAUGCUUCUGGCCUGUUUCUGGAUUCUAAGGGUAGAACCAGCAUAAAACUAGUCAGUCCAAGUAUUUCUAAAGAUCCACAGACACAGUUCUCCUGGAUUUGGGAAGCCUAGAGAUAUUAGCACAAUAAUUAAGGCCCAACAACUUUUAAAAGCCUUUCCACUGCACAGUGAAAGAAAACCACAAACUCCUUGUUUAAUAAGUGGGAUCACGUGCUUUUAACACGAGGAAAAGGUCAAUCUGAAGCAACUGAUAUGGAACUGCCAGAGUAGGAGUUGAAAAUCUUCCUAAACUGCUGGAGGAUACACCUCUGAUAGCUUGAGACAAAUAUCCUCUUGAUCAUUGUUUCACCAUAUUUGUCUUUGCUCAUGGAGAACCAUUUUGAUCCGUGGUUUAGCCUCCCAGGUGAUUGAACAAUACCGGUGAUCUGAGGCAGACCCUCUGUGACGGAUAACAGGAAAGAAUAUUGAUUGAACAUCUACUCAAGAACUGCAAAACAGAGAUUACCUGACCUAAAGCAUUUAUAUUGCCAAUCAUGUUGGAGAGUCCAUGUGGUGAUUUCUGAAAACGAGAUGUGAGAAAGAAGAGGAUAAUUUAAGUCUAGACCUACAGAUUGUGCUGAUAAAGUGAUGAAGAACUACAAUCUUCUUAGUCAUUUCAUUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-192.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -205.9

Frequency: 0.0000

Diversity: 189.54

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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