Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

PRKCQ-AS1:22

Sequence Length

1132 nt

GC Content

0.4337

CGGAGCUGCCACAACCCAUCUUCCCACAACUCGGAACUUGGAAAAAGGAACCCAGGACACGACUUUGCUUUUCUUUUGGACCUAGUUGAUACAAGUUAACAGGAUAUGCUUCUGGCCUGUUUCUGGAUUCUAAGGGUAGAACCAGCAUAAAACUAGUCAGUCCAAGUAUUUCUAAAGAUCCACAGACACAGUUCUCCUGGAUUUGGGAAGCCUAGAGAUAUUAGCACAAUAAUUAAGGCCCAACAACUUUUAAAAGCCUUUCCACUGCACAGUGAAAGAAAACCACAAACUCCUUGUUUAAUAAGUGGGAUCACGUGCUUUUAACACGAGGAAAAGGUCAAUCUGAAGCAACUGAUAUGGAACUGCCAGAGUAGGAGUUGAAAAUCUUCCUAAACUGCUGGAGGAUACACCUCUGAUAGCUUGAGACAAAUAUCCUCUUGAUCAUUGUUUCACCAUAUUUGUCUUUGCUCAUGGAGAACCAUUUUGAUCCGUGGUUUAGCCUCCCAGGUGAUUGAACAAUACCGGUGAUCUGAGGCAGACCCUCUGUGACGGAUAACAGGAAAGAAUAUUGAUUGAACAUCUACUCAAGAACUGCAAAACAGAGAUUACCUGACCUAAAGAUGAAUCCAGGAUUCGGUGGUGCCUGUUCCAGGAACCUUUAGUGUGAAGGAUCCUCCAGAUGUGCCUUUUGCCUUCCACCAUGAUUGUGAGGCCUCCCCAGCCACACAGAACUGAGUCCAUUCUCAAUUUUCUGUGCAAAUUGGGGAAGGCUGUUGAUAAUCGGUGGAUGCUAUAGUGCCCAUGGAAAGACUCUAGUCUGAAGAUACCAGUCUCUCCCUCCCAAGAUCACCUCCCCUGACCAACCUUCUGCACUCCUGACAGAUACAAGGGAGCAAGCAAGUUGCACCCAACCUAAUAGUAAAUUGCAGGGACAUUUCCAUUCUAAGGAAGGAAUUUUUGUGUGUGUUGCAACUCAGCUUCUGCUCUGGCAUUUUGCUGUGCAUUUAUAUUGCCAAUCAUGUUGGAGAGUCCAUGUGGUGAUUUCUGAAAACGAGAUGUGAGAAAGAAGAGGAUAAUUUAAGUCUAGACCUACAGAUUGUGCUGAUAAAGUGAUGAAGAACUACAAUCUUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-320.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -340.11

Frequency: 0.0000

Diversity: 249.74

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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