Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

PRKCQ-AS1:26

Sequence Length

697 nt

GC Content

0.4017

GCUAUAAAAUUCUGAGACUAAAUAUCAAAUUAAAGAAAGUACUAAUUGUCAGCGAUGGGGGAUGUACUGCUAUUUGCUUCUAGUGGUACUCACUGCUCAUUUCCUAUAUUCACUGGUAUAAAAAAAUUUCAAACACCCUCAAAAAAGCCUAUACUGGUGGUACCAGGAAAACGCUGAAAAUCAUUACUUUCUGUGUGGUGUCCAGCUCUUUUGGUUACAUCAUCACUUCGACCAUUCACUUUUAAAGAAAAACUUUUGUGGAACAAAAAUAUAAAGAUUUAUUUUUUUUCUUGGUGGCUUAGCACAGUGGCCUAAUGUGGCUGACCAUGUGCACCUGUUGUGUGAGUCACUUAGACGUGCUUUGUUUCUUGGUCACAGUUGAUCCCUCAACUCAAGCAUCUCACCCUCAAAAUGUUUGUUUGGGACCCAAGAGGCAAACCUUGAGAUGGGUUAUUUCUUUCACCUUGGAUUGGCUCAUCUGCUGGGAGUGGAGCCAAGCUGACAUUUCCUUUCCUUUUUGUCUGCCUAUCACUACGUAGAGGCAGCACAUAAGAGAGGGAAAGCCAUGCGCGUGGAGUCCAGCACAUCACCCAGAAGGCAGAUGUUCUAUCUCCAUUUUACUCAUUAAAACAAACAAAACCACACCUGGAUUGCCUGGUACUUAAAUAAAAUGCACUAUGAUGAUUGAAGAAAAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-181.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -196.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 149.74

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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