Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
RNF219-AS1:13
Sequence Length
552 nt
GC Content
0.4203
GUGGUCUUGCUGGCUUAGGAGUGAAGCUGCAGACUUUCGUGGUGAUCCACCCUACCACAUAUUGUCUCCUAAUGGCCGUCCAGUUUAUCCUGGAGCCCUUGCAUGACACAGGCCUAUCGAAGCAUAGGAGAUGCCAAUAUUUUACCUCUUGGGUACUUUCUGUGUAGAAGAUUCAUAACAAGAACAAUACUUAUUCUGCAAUUCUUUAUAUAAAGUAAGAAGAAAGCCCAAAGACAAAACCAGAGGCAACUGGCUGCUGCAUCGCCCACCUAGUGGCAGUAGUGUGAGCUAUGGACAAAAGAUCUAAGUCUCCAGGACAAAGAGUUGUGCAGCUGCUCAUUUUCCUGUUGACUUCUGUCUAAGACUUGGAGAUGUUUGUAAGAUUGGGACCUACCUACAGAGGUAUCACACUCCUCUUGGUCUAACUCACUCUUGAACUGACAUUCGUGGUGAAUUUCUUUUGUCACUUAGCAUAUUAGAAGAGAUGUUUUACUAUAAUUCUCACAAUCAAUCCAUAAGCAAGUGGUUAAAGGCCUUUUUGUACUUAGUUAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-143.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -153.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 136.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((.((((((.((((.((.((((......((((((........))))))(((((((((((((..((((.(((((......)))))((....))........))))..........)))))))...))))))......(((((((..((((((.(((((((........................)))))))..((((..........))))))))))))).)))).....((((......)))))))).)).))))...))))).).))))...(((.((((.(((((((((((((((((((.(((((.((.((((.((...)).)))).)).)))))..(((....)))..)))))))))((((((..(((((.((((....(((...(((((.........))))).)))....)))).)))))....))))))...........))))))))).).)))).))).....((((..............)))).........((((......))))...)))))).................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((({((((((,{(((.((.({((.,....((((((........)))))),,,,{((({(({{..{{{,.(((((......)))))||}..,|}..,,},,,||||,.,....,,,})))}}}|,,|,,},}......(((((((,.{(((((.(((((((...,........,...........))))))).,{((({,{.....,,)))))))))))))))})}.....{{{{.,,...))))||||,||.}}}}...}}}}),),))))}}|(({.((((.(((((((((((((((((((.(((((.((.((((.({...}).)))).)).)))))..(((....)))..)))))))))((((((.,(((((.((((....(((...(((((.........))))).)))....)))).))))}.,,.)))))),..........))))))))).).)))).}},,....((({.,{,.....,,}..)))).........{|{{..,,..))))...,))))).................
Back