Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
RNF219-AS1:2
Sequence Length
792 nt
GC Content
0.4394
UUGGACAUUCAUAGUUACUUGGGACAACAGUUUUAGCAGGGCUCUCUUUCUCCUUUCCUGAUCUCUCUGUUAAGCUGCCUGGCUCAUUUGAUAUCACAUCCAAAUUAUCAGCUGAUUGCUCUAUUGUUUUGGACAAUGCCCUGAAGCAUACCAAAAUGUGUCUGGAAUUGGUGGGUUCUUGGUCUUACUGACUUUAAGAAUGAAGUUGCGGACUUUUGCGGUGAUCCACCCUACCACAUAUUGUCUCCUAAUGGCCGUCCAGUUUAUCCUGGAGCCCUUGCAUGACACAGGCCUAUCGAAGCAUAGGAGAUGCCAAUAUUUUACCUCUUGGGUACUUUCUGUGUAGAAGAUUCAUAACAAGAACAAUACUUAUUCUGCAAUUCUUUAUAUAAAGCUAAAAGAAAAUGCAUUCUGCCAACAACUAAUGAGCUUGGAAGAGAACUCCAAACCCCAGAAGAGGCCUGUCACAUUGGCUAACACCUUGAUUUCCACCCACUGAGACCUUGAGCAGAGACUUCAGUUACACCCCACCCAGACUUCUGACCUGCAAAACUUAAGAAGAAAGCCCAAAGACAAAACCAGAGGCAACUGGCUGCUGCAUCGCCCACCUAGUGGCAGUAGUGUGAGCUAUGGACAAAAGAUCUAAGUCUCCAGGACAAAGAGUUGUGCAGCUGCUCAUUUUCCUGUUGACUUCUGUCUAAGACUUGGAGAUGUUUGUAAGAUUGGGACCUACCUACAGAGGUAUCACACUCCUCUUGGUCUAACUCACUCUUGAACUGACAUUCGUGGUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-194.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -212.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 209.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((((((((.....((((((.(((((.................((((..((((((((.((((....)))).....((((............))))(((.....))).....(((((((...((((......)))).)))))))......((..(((((((((((..(((.(((..(((((((....)))))))..((((...((.((((........)))).))....))))......(((..(((((......))))))))...(((((..((((((((.((...(((((((((.((((................)))).)))))))))...............................((((.((((((...........))))))..))))....((((........)).))(((((.......)))))......))..))))))))..)))..))))).)))..)).....)))))))))..))...))))))))..))))............(((....))).)))))))))))...........)))))........((((......))))(((((((..(((.......)))))))))).)))).)))))))..........(((((..(((((.((.((((.((...)).)))).)).)))))..))))).))))))).(((....((((((..(((((.((((....(((...(((((.........))))).)))....)))).)))))....))))))...)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((.,(((((((({({((((,{...,|||||}|{,(({{{.{{,,,........((((..((((((((,{({{....||||{(.{(((((............)))))|,}},..}}}.....(((((((...((((......)))).)))))))|,{{{{{(..,{(((((((((..(((,,,,..(((((({....))))))}{.(({{...((.((((........)))).))....|||}.,,,,.(((..(((((......)))))||}..||..{{,,{(((((((.{{...(((((((((.((((,,............,,)))).))))))))).,,.,.,,,......,||,.........,,,|(((.((((((.........,,))))))..)))}.,,,{(((........}}.)}{((({.,....,))))}......}}..))))))))..}},.})}},..}))..)}..,}})))}}})})},))...))))))))..))))............(((....))).,,,,,,,,,,,..,}}})}.}}))),,........((((......))))(((((((..(((.......)))))))))).)),))))))))|{{,,...{{{(((((,.(((((.((.((((.((...)).)))).)).)))))..|||},.,)))},)}|||}}|},,{,||}}|,{{{.((((....,||,..(((((.........))))).)))}},.,|||{|},||{{..,,,,)))}.)))},
Back