Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
RNF219-AS1:7
Sequence Length
577 nt
GC Content
0.4263
ACAACAGUUUUAGCAGGGCUCUCUUUCUCCUUUCCUGAUCUCUCUGUUAAGCUGCCUGGCUCAUUUGAUAUCACAUCCAAAUUAUCAGCUGAUUGCUCUAUUGUUUUGGACAAUGCCCUGAAGCAUACCAAAAUGUGUCUGGAAUUGGUGGGUUCUUGGUCUUACUGACUUUAAGAAUGAAGUUGCGGACUUUUGCGAUGUGUGAACCUCCAGAACUGUGAAAUAAACAACCUCAGUCAACAUCAAGCAGAAUUCAAAGAAGUCUAAAGUCUUAAUAAUUGUCUGUUCAGUCUGGGAGGAAAGGACUAAAAUGGCAUGAAUCCAGGUGAUCCACCCUACCACAUAUUGUCUCCUAAUGGCCGUCCAGUUUAUCCUGGAGCCCUUGCAUGACACAGGCCUAUCGAAGCAUAGGAGAUGCCAAUAUUUUACCUCUUGGGUACUUUCUGUGUAGAAGAUUCAUAACAAGAACAAUACUUAUUCUGCAAUUCUUUAUAUAAAGCUCCAGAGGGAAGUGAGAAGGAUGUUCACUUGCUGGUGAGAGAAGGAGCUGGUUCCAUCCAUUACGCAGUCCCCUGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-139.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -152.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 202.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.............(((((..(((((((((((((((...((((((((...(((((((((..((((..((((............))))(((.....))).....(((((((...((((......)))).)))))))..(((((.((((.....((((((((((.....))))..))))))..)))).)))))....((((((((((..((((((((.(((...........................((((((........(((........)))........)))))))))))).)))))...(((...............))).((((...))))....))))))))))....(((.(((..(((((......)))))))).))).))))..)))))........(((((((((.((((................)))).))))))))).(((((((((.((.(((.......))).)).)).)).)))))......)))).))))))))...).)))))....(((((....)))))))))))))).(((......)))..........)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..........,,{(((((,.{(((((((((({{{({,,.,.,,{{(,{{(((((,,((({(((({((({{............}}}}|((.....))}.....(((((((...((((......)))).))))))),.(((((.((((.....((((((((((.....)))}.,})))))..)))).))))).,,{((((((({((..(((((((,,(((,{.............,,}}.....,,.{(((((........{{{.|....}.)))........))))))))))))))))))...{{{.,....{{{.,,,...}}|(({(...))))....)}}}}}}}}},...,||,|||}}|||||,,,,.,)})))))),,}}...}||{||||}.,{{,.,,(,||{{((({{{,,.....,.,.,,,,,}.)))).,,))))))).(({((,,{{.,,.{((,......}}}.}),)).,,,)))))...,,,))))|))))))))}}.)})))))}...,},}},{{{|((((..((.((({....,))).))..)))).)))}.)))))..
Back