Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
RNF219-AS1:9
Sequence Length
570 nt
GC Content
0.4789
AAAAUGUGUCUGGAAUUGGUGGGUUCUUGGUCUUACUGACUUUAAGAAUGAAGUUGCGGACUUUUGCGAUGCCAAUAUUUUACCUCUUGGGUACUUUCUGUGUAGAAGAUUCAUAACAAGAACAAUACUUAUUCUGCAAUUCUUUAUAUAAAGCUAAAAGAAAAUGCAUUCUGCCAACAACUAAUGAGCUUGGAAGAGAACUCCAAACCCCAGAAGAGGCCUGUCACAUUGGCUAACACCUUGAUUUCCACCCACUGAGACCUUGAGCAGAGACUUCAGUUACACCCCACCCAGACUUCUGACCUGCAAAACUCUCCAGAGGGAAGUGAGAAGGAUGUUCACUUGCUGGUGAGAGAAGGAGCUGGUUCCAUCCAUUACGCAGUCCCCUGGGAGCGCUAAAUGCAACUUUAUCUCAACGGGGAGUGGACGAUGAGCAGGACGUCGCUAGAGGGAAAGAGUGAGUCCUACGGUAGUCAUCACACCGGGAGUCCGGGCUUAACCUAGUCCUUCCUGACACCCCUGGUGGCCGUUCCCUGCGCUCUCUCUUGACGGGAAAGAAAAGGCCCCCAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-155.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -166.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 160.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((.((((..(((((((((((((((.....))))..)))))....(((((((....)))))))((((((......((((((((((...((((((...((....))...)).))))............((((.((((((...........))))))..))))....((((........)).))(((((.......)))))))))...))))))........))))))....................((((((..(((.....)))..)))))).....))))))..((((((((.(((.....(((.(((....))))))....)))..((((((((.(((.(((((((((..(((((......)))....((..(((....)))..)).....))..)))).))))).))).))))))))((((((((((((.(((((..........))))))))))...))..)))))....)))))))).(((((......))))))))).)))))...(((.((((.(((((((((........)).))))...)))..)))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....(((((.((({..(((((((((,,((((,,,..||||,{|}}},},}}|{(((({....}))))},((((((......((((((((({...,{,({{{{{({,...||...,.,||},.........,,.|(({.((((((.,.......,.)))))}..)))}.,,,{{{{........}}.)}{((({.,.....))))}}})),..})))))...,....)))))).........,..........|{||||,,|{{,,,,.}}}..,}}})).....})))}),,((((((({.(((.,...{((,(({...|))}}))..,.}}}..((((((((.(((.{(((({(((..(((((......))},,.,((..(((....))),,)},,...))..)))}.))))).))).))))))))(({({(((((((.(((((..........))))))))))...}}..)))))....)))))))).(((((......)))))}))).)))))...|((.((((.{{{{{||||,||.....,),))))...)))..)))).))}.
Back