Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG10:2
Sequence Length
1323 nt
GC Content
0.5457
AGCCUCAUCCUACUGCCUUACUAUUGGUCGUCGGCAACCGCUUUGUUAGUUAAUUGGAGAGACUGGAUGUCCAUCAGGGUCACGCUUGCAGGGCAACGAGAGGCAAAACAAGAGGGAAGACGACUUUCCUCCUGUGAGCCAAUGAGGCCAGCUGGACUACGCCGAGACAACUGGGAGAGGCGCGGGACUCGCCCGUUCCGCGGAACGCCGGGAAGGGGUCACCUCCUGAUGAAGUUUCCGGUUCCGGUGUCAGCGGCGGUUGAAUUGCCAUGGCAAUGCGGUGGGCGCGCGCUUGUCGUGUUGGUCUCUUGGGAGGUAGCGGGGCUAGGCCGGGCGGGUAUCCGCCUCUCCCAGCUUAGGUGAGCGUCCCCGGGCGCCUCCGGAGCGCCGCGGCCGCAUGCAGUUCGUCGUGGCGGGGAGCCGGAGCCUGACCGGGGUUCCAGCGCUCGGGCCGUAGCCUUGGCUCCUGGACUUUCCCUGGCUCCGCCGCCACGUGGGAGCUGAGGCUCUGGGGCUUCCGCCUCCGGCGCGCGAUUAUUUCUCUAGAACAGUUUUCAUUUUUAAAAUUUGUAAAGCGCUUUUGCCUGUGUGAUUUCCUCUGGGUUUUUUUUUUUUUUCUUCCUUUUUGUAGAGACGGAAUUGGCGGCGGGGGCGGGGGGUCGAUGUCUCACUUUUUUGCCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGGCUUCAAGGGAUCCUCCUGCCUCGGCCUCUUAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCCCCCGGCCGCCUCUGAGUUUCCAGCCUCGUUGGCCCUCCAGCCUUUUAACCUGUUGGGCCUAGGAUCAGGAAAGGUUUGUUGAAUGGGGAACUAAGAAGUGAAUUCGUUCGUUCGACAAACGUUUCCUGAGCAGCCGCUGGGUGCUAGGCGCAGUGCCAGCGCGGAAUGUCCAGGGAGACCUGGUGCCCAAAGCUUGGACCCAUCGUGAGAAAUGAGAAGCAGAUACAAAGCAGUGUGGGAGUGCAGAGGAGACAAAGCAAGCCUCAUCAGGCCCAUUGCUUGCUCUGCUCUCCCUUGUACUUACCAGUGCUUGACAAUAUACAGUUAUUUACUAGCUUGGUUAUUGACUUCCUACCCAGCACUCAGUUUUAUUCACUGCUGUAUCCUCAGUGCCUAGGACGAUGCUUGGAACGUGAUUCAUUGAUUCCAGGUAAAUCAGAGGAACAAGCAACAUGAACAGAAAUAUGUAGAAAAAGCUAUUAUGCAGAAGCAUAAUUGUUGUUUCAGAAGUCCAGCAUCUGGUGCACUUAACAAUAGAGAAUAUAUUAAACUCUUUCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-524.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -547.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 231.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....((.((.(((........))).)).)).....)))((((((((..((((((..(.((((((.((.....(((((..(((((((((.....(((((((...(((.((((((((....)))))))).)))..(((((((((((....((((...(((((.((..((((((((...(((((((...((((.((((.(((....))))))).))))....))))).))...)))))))))))))))((((.((((((((.(((((....)))))(((((((.(.(((((((((.((.(((((((.(((((((((..((((((.(((..((((((....))))))...(((((((.((((((((...(((((((((....).))))).))).)))....(((((.(((((((((((((((((.((((.....))))(((((.(((.((((....)))).)))..)))))......)))))))).)))))))).).)))))(((((..(.((.((((((((((((.(((.(((((...((((((.(((((.(((........))).))))...((((........))))..........(((................)))....).))))))...)))))))).)))))))))))).)).).)))))......))))).)))))))........((((........))))....)))))))))))))))))))).))))).)).))))))))).))))))))...)))))))).))))...)))))))))))))))......)))))))..)))))((((((((((.((((((((.(((((((((((((((((((....)))....)).)))))))))))))).))))))))....((.(((((((((.(((.....)))))))).......))))))...))))).)))))))))...)))))...((((((((((((..((.......(((((.((.(..(((((((.(((((((.(((((((...............))))))).)).))))).)))))))..))).)))))..(((((..((((((.....)))).))..)))))............)).)))).))))..))))((((((.(((((..(((((.((((((((..(........)..)))))..)))))))).....))))))).))))(((((........))))).((((.(((.(((((((....))))))).))).)))).)).))))))).))))))..)).)))))).((((...........))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((.....((.((.(((........))).)).)).....))}((((((((..((((((..{.((((((.((.....(((((..(((({{{((,,,..{((((((...(((.((((((((....)))))))).))){.(((((((((({...,((((..{(((((.((..((((((((...(((((((...((((.((((.(((....))))))).))))....))))).))...)))))))))))))))|(((.((((((((.(((((....)))))((((({({(.(((((((((.((.(((((,,,(((((((((..((((((.(((,.((((((....)))))}...(((((((.((((((((...(((((((((....).))))).))).})}...|(((((.(((((((((((((((((,((((.....))))|((((.(((.((((....)))).)))..))))}.....,)})))))).)))))))).).)))))(((((..{.((.((((((((((((.(((.(((((...((((((.((,{({(((,,......}}}.,)),,,|{|((....,|,.},},,....,,...|||.................,,...,).))))))...)))))))).)))))))))))).)).}.))))),.....})))).)))))))....,...,{{{},,,...,||},....))))))))))))))))))}).))))).)).))))))))).))))))))...)))))))).)))}...))))))))))))))).,....))))))}..}}}}}{||{{{{{{{.((((((((.((((((((((((({((({,....,,,...})).)))))))))))))).)))))))).,.,|{,|{{|(((((.(((,...,)))))))),......||||{....))))),))))})))).,,)))))...((((({{{((((..((.......(((((.((.(.{(((((((.(((((((.(((((((,......,,......))))))).)).))))).))))))),.))).))))),.(((((..((((((.....))))},)..)))))............)).)))).})}}.,))))(((({{.(((((.,(((((.((((((((..(.,......)..))))).,)))))))).....)))))}).}))){{{{{.,......}}))).((((.(((.(((((((....))))))).))).)))).)}.))))))}.))))))..)}}}))))).{(((...........,))}....
Back