Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG10:3
Sequence Length
428 nt
GC Content
0.4907
AGCCUCAUCCUACUGCCUUACUAUUGGUCGUCGGCAACCGCUUUGUUAGUUAAUUGGAGAGACUGGAUGUCCAUCAGGGUCACGCUUGCAGGGCAACGAGAGGCAAAACAAGAGGGAAGACGACUUUCCUCCUGUGAGCCAAUGAGGCCAGCUGGACUACGCCGAGACAACUGGGAGAGGCGCGGGACUCGCCCGUUCCGCGGAACGCCGGGAAGGGGUCACCUCCUGAUGAAGUUUCCGGUUCCGGUGUCAGCGGCGGUUGAAUUGCCAUGGCAAUGCGAUUCAUUGAUUCCAGGUAAAUCAGAGGAACAAGCAACAUGAACAGAAAUAUGUAGAAAAAGCUAUUAUGCAGAAGCAUAAUUGUUGUUUCAGAAGUCCAGCAUCUGGUGCACUUAACAAUAGAGAAUAUAUUAAACUCUUUCCAAAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-140.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -146.65
Frequency: 0.0001
Diversity: 73.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....((.((.(((........))).)).)).....)))...........(((((((((((.(.(((((..((((......))))..))))).).)).(((...(((.((((((((....)))))))).)))..)))..((((((((((((((((.(((((.((((((((((((...(((((((...((((.((((.(((....))))))).))))....))))).))...)))))))).....))))..))))).((((.(((((.((((((((.....)))))...)))))))).))))...........(((((........))))).((((.(((.(((((((....))))))).))).))))...))))))))...))))...)))).....................)))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((.....((.((.(((........))).)).)).....))}...........(((((((((((.(.(((((..((((......))))..))))).).)).(((...(((.((((((((....)))))))).)))..)))..{{,{((((((((((((.(((((.((({{((((((,.{{(((((((...((((.((((.(((....))))))).))))....))))).}}...}}})),,))))))))))..))))).,(((,(((({,(,{,{|||},,}}))|||.{{||,}},,}.})},.}}}},,,...{{{{{........}}))).((({.(((.(((((((....))))))).))).))))...))))))))...))))...}}},...,,,.......,.......)))))))))...
Back