Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

SNHG11:1

Sequence Length

1322 nt

GC Content

0.5983

GCAGCUCCGUCCUCCCAGGGGGCGCUGCAGGCACGUCUGCUUGGGCAGGGGCCCGGCGGAAGCGCCGCUCUAGGCUGCAGCCGCGCCCCCAGCCGUAUUUCCGCGGGCGCUGAGCACUAGAGAGAGCGUCUUGUGGCUGCGGCCUGCCCCUCAGCCUCCUCCGCGCGGUUACCCCUGUACCCGCCGCCAUCCGUCCUGGCGCUCCGGAUGAGUCAAUGAGGGGCAGGGCCCGAGGAGUGGUCUUCCCAAGAACCCCUGGUGGCCUCCCAAGGCCGGUGCUGUGUACCUCCUCCCCGACAAAAGGGGAAACUGAGGCCCCGAGGGGAGUGGGAAGAGCCGGCUGGACGUCAGGCCCAGCCGCUGGUGCAGUGGUCCGUCCCCUCUGCCGGGGUGGGCCCCUCGGGUUUCGCGUGUCCUCGGGAAAGAGACUGGCGGGCCUCGUGGGCUGUGCGGCUAUCCUGGAGACAGAUGACAGCUCUCCCUUGGAUGGCUUUGCUGGUUCCGCACCAGCCAGCGCCCCCAUUUUUCCUGCAGCACCCUGAUCUGCACUCCCUGAGGGGCUCCCACUGUCCGCGGUGUGAGGAUGUCCCUGGAUAGUCCACUGUGUGCAGAGGCAUGGGAGUUGUCAUGUUGGGAACAUGCUAGACCUCAGUAUCCUUGAGCUUGAAGAAAGACGACAGAACACUGGAGACCAAGUACUUACAGCCUUCUGCUCUGUGGCCCCUCCUCACUCCAGGGAUGCUGCCUUGGGUCUGGAAACUGUUAGAGGAAACCCCAAGAGGUGCAGGCACUGAGCCUCUCAGGACAAUGACCUGGGGUCCCAGCUCCCCUGGAGGGGCCUCCUCAUGGUAAGUGAAUGCCAAGAGGUUAAGUUGGCCUGUGUUUCCGAGGUGGAAAUUCCAGGUCGCUGGCUUCAUUUGUCUUCUCUUUUAGAUUGUUUGGGGGUUGAUCACAGACCAAGAGUGACGAGUGAUGUCACCCUGUGACUCAUGGCUGGACCUUCUUGCCCCUAUUGUCUCAGCACAACAUUAUUCGACUUUUCCCUCAGCGUGGGUGGGCAGAGGAAAAGCCCUGUGGCUCUGGGGACUUGGGAUCCAGAGUUGAAGACCCUUCAGCUGGCUCUGCCCUGCCAGUGCCACAGAGUGCCAUGGCCCAGGAAGACAGGUUUUCUUCCAUCUAGGCCAGGCCAUCCAGUGGCCAUCCUCCGUGUCCUCCCGCCUCCUCCUGGUGUGACUUCUGAAAACCAAGAAUUUGUUCCUGUUGACUUUUUCUGUGCUAUGGACCAUUGUCCUCUCACCCACUCAAUAAAUCUUGAAACAUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-568.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -590.11

Frequency: 0.0000

Diversity: 238.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.((.((((...)))))).)))))..(((.((...(((((((.(((((...((((..(((((......))).))..)))))))))..((((((...(((((((((((.............)))))).))))).))))))((((((((((..(((.((((.((((.(((....))).))))(((((.......)))))...)))).)))....)))))))))).)))))))((((((.(((((((....(((((((.((((((....((..(((((...))))).))(((((.......)))))....)))))))).)))))..)))))))(((.((((((.(.....).)))))))))((.((((((((((((...((((((((.(((((((((((((((....(((.((((((((((((((...(((.((((...((.((((((((((((((((.((((((........).)))))...)))))))...........)))).))))).)))))))))))))))))).))......))).)))....))))))))))....((((((((.(((((....))).)).))))))))))))).)).))))))(((((((((..((((...(((((((((((((((((((((.....)))))((.(((((((((((((((((..((((((........))).)))..)))))......(((((((((.......((((..(((((((((((((......(((.....((.....)).((((((.(((...))).)))))))))......)))))))))...))))..))))))))))))).((((.(((((......))))).))))...(((.((((((.((((((.....))))))..)))))))))........))))))).))))).))......(((((((.((((.(((.(((.((((.(((.(((....)))..))).)))).))))))))...))..)))))))..)))).)))).......................((.(((((.((((((((((...((((((((((.((((.(....(((...(((((((((((...)))))....)))))))))).)))).))))))).).))..(((((..((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).)))))..))))).)))))))..((.((((.............)))).))...)))))))).))))..))))))))).))))))))))))))......)))))).............)).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((.{(,((((,..,))))),)))))..(({.,,,,.(((((((.(((((.,,(({{..(((((......))).)).,)))})))))..{(((((...(((((((((((...,....,....))))))}})))).)))))|((((((((((..(((.((((.((((.(((....))).))))(((((.......)))))...)))).)))....))))))))))})))))))((((((,(((((((....(((((((.((((((...,((..(((((...))))).))|((((.......))))}....)))))))).)))))..)))))))|(,{((((((.(.....}.))))))))}((.((((((((((((...((((((((.(((((((((((((((....(((,(({{{(((((((((...(((.((((...((.((((((((((((((((.((((((........).)))))...))))))}..........,))))}})))).)))))))))))))))))).}).,,...))}.}))....))))))))))....((((((((.(({({....}}}.)).))))))))))))).)).))))))(((((((((..((((...,(((((((,((((((((((({.,,,,|||||({.((((({((({((((((,..{(((((.{,..,,.}},.}||..}}}}).,,,,,(((((({{.....,{{((((..(((((((((((((.,....(({...,.{{....|||.((((((.(((...))).))))))}}),.....))))))))),..})))..))))))))))))).((((.(((((......))))).))))...{(,,((((((.((((((,...,))))))..)))))))))}))))},,}))))}).))))).}}......|((((({.{{{{.(({.(((.((((.(((,(((,,,,}}}.|||},||}}.}|||}|||...))..)))}}}}..)))},))},..,,,,,,,,,|...........{{.(((((.((((((((((...((((((((((.((((.{....(((..,({{((((((((...)))))})}}),))),}))}.)))).))))))).).))..(((((.,((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).)))))..))))).)))))}},,||.||||.,,..,{{{....,,,,,)),..)))))))}.))))..))))))))).))))))))))))))......))))))..............,.,}}