Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG11:12
Sequence Length
1110 nt
GC Content
0.5937
UGCGGCCUGCCCCUCAGCCUCCUCCGCGCGGUUACCCCUGUACCCGCCGCCAUCCGUCCUGGCGCUCCGGAUGAGUCAAUGAGGGGCAGGGCCCGAGGAGUGGUCUUCCCAAGAACCCCUGGUGGCCUCCCAAGGCCGGUGCUGUGUACCUCCUCCCCGACAAAAGGGGAAACUGAGGCCCCGAGGGGAGUGGGAAGAGCCGGCUGGACGUCAGGCCCAGCCGCUGGUGCAGUGGUCCGUCCCCUCUGCCGGGGUGGGCCCCUCGGGUUUCGCGUGUCCUCGGGAAAGAGACUGGCGGGUGCCUCGUGGGCUGUGCGGCUAUCCUGGAGACAGAUGACAGCUCUCCCUUGGAUGGCUUUGCUGGUUCCGCACCAGCCAGCGCCCCCAUUUUUCCUGCAGCACCCUGAUCUGCACUCCCUGAGGGGCUCCCACUGUCCGCGGUGUGAGGAUGUCCCUGGGUAUAGUCCACUGUGUGCAGAGGCAUGGGAGUUGUCAUGUUGGGAACAUGCUAGACCUCAGUAUCCUUGAGCUUGAAGAAAGACGACAGAACACUGGAGACCAAGUACUUACAGCCUUCUGCUCUGUGGCCCCUCCUCACUCCAGGGAUGCUGCCUUGGGUCUGGAAACUGUUAGAGGAAACCCCAAGAGGUGCAGGCACUGAGCCUCUCAGGACAAUGACCUGGGGUCCCAGCUCCCCUGGAGGGGCCUCCUCAUGGUAUUGUUUGGGGGUUGAUCACAGACCAAGAGUGACGAGUGAUGUCACCCUGUGACUCAUGGCUGGACCUUCUUGCCCCUAUUGUCUCAGCACAACAUUAUUCGACUUUUCCCUCAGCGUGGGUGGGCAGAGGAAAAGCCCUGUGGCUCUGGGGACUUGGGAUCCAGAGUUGAAGACCCUUCAGCUGGCUCUGCCCUGCCAGUGCCACAGAGUGCCAUGGCCCAGGAAGACAGGUUUUCUUCCAUCUAGGCCAGGCCAUCCAGUGGCCAUCCUCCGUGUCCUCCCGCCUCCUCCUGGUGUGACUUCUGAAAACCAAGAAUUUGUUCCUGUUGACUUUUUCUGUGCUAUGGACCAUUGUCCUCUCACCCACUCAAUAAAUCUUGAAACAUGCCCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-469.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -487.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 185.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((((((..(((.((((.((((.(((....))).))))(((((.......)))))...)))).)))....))))))))).))))((((((((((.(((((((....(((((((.((((((....((..(((((...))))).))(((((.......)))))....)))))))).)))))..)))))))(((.((((((.(.....).)))))))))((.((((((((((((((((......)))).((((((((((((....(((.((((((((((((((...(((.((((((......((((((((((((((((.((((((........).)))))...)))))))...........)))).))))).)))))))))))))))))).))......))).)))....))))))))))))...((((.(((((((.((..(((.((...)))))..))))))))).)))).((((((((((..((((...((((((((..(((((((((((((((((((.(..(((.((..(.(.(((((.((((((((........))).))).....)).))))).).)..)).)))..))))))))))))....))))))))......(((((((..((.(((.((((...((((.(((((...)))))(((((((.(((((((.(((..((((...)))))))...))))).)))))))))((((((.............((((((..((((((((((....(((.(((....(((.(((...))).)))......))).)))....))))))))))))))))))))))....(((.((((((((((...((((((((((.((((.(....(((...(((((((((((...)))))....)))))))))).)))).))))))).).))..(((((..((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).)))))..))))).))))))))))).))).))..)))))))............)))))))).))))..))))))))))))))))))))))))......)))))).......))))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,.(((((((((((((..(((.((((.((((.(((....))).))))(((((.......)))))...)))).)))....)))))))))))}))||,,((((((,(((((((....(((((((.((((((...,((..(((((...))))).))|((((.......))))}....)))))))).)))))..)))))))|(,{((((((.(.....}.))))))))}((.((((((((((((((((......)))).((((((((((((....(((,(({{{(((((((((...(((.((((((....,,((((((((((((((((.((((((........).)))))...))))))}..........,))))},))))})))))))))))))))))).}),,,...))}.}))....))))))))))}),..((((.(((((((.((..(((.((...)))))..))))))))).)))).((((((((((..((((...,(((((((..((((((((((((((((((({(..(((.((..(.(.(((((.(({{((((.,...,,.,},.}}).,}}})).))))).).}..)).)))}}})))))))))))....))))))))......{{{((((.,(({(({,(((((.(((,,.|||,|}}}))|||((((((,{(((((((,(((..((((...))))))),,.))})).)))))))))|||||||,,,|{.({{,(((.((({.{(({((({{{{,,,.{{|,{||,,.,|||,|{|...))}.))),,,,..))).}})....}}}}}}}}}},........,,|{.(((((.((((((((((...((((((((((.((((.{....(((..,({{((((((((...)))))})}}),))),}))}.)))).))))))).).))..(((((.,((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).)))))..))))).)))))}}}))).))),})..}}|||},.......,,...)))))))}.))))..))))))))))))))))))))))))......))))))........,,,............
Back