Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG11:13
Sequence Length
556 nt
GC Content
0.5917
GCGGCCUGCCCCUCAGCCUCCUCCGCGCGGUUACCCCUGUACCCGCCGCCAUCCGUCCUGGCGCUCCGGAUGAGUCAAUGAGGGGCAGGGCCCGAGGAGUGGUCUUCCCAAGAACCCCUGGUGGCCUCCCAAGGCCGGCCUCGUGGGCUGUGCGGCUAUCCUGGAGACAGAUGACAGCUCUCCCUUGGAUGGCUUUGCUGGUUCCGCACCAGCCAGCGCCCCCAUUUUUCCUGCAGCACCCUGAUCUGCACUCCCUGAGGGGCUCCCACUGUCCGCGGUGUGAGGAUGUCCCUGGAAAUUGGUCUUCUGUGACUUUCUUGAUGGGGGCAGAUGAGAUCUUUGUACUGCAUUAAGUGGAUAGCGCUCAGGUCCUUUGGGCUUGGCGCUUUGGCAAUCUCCAGGCAGCUCACUUUGGCCUCUGUUCCUGGAUCCCCUUUGCUCUUUUCUGCGCCUGCAUUCAUAGUCCACUGUGUGCAGAGGCAUGGGAGUUGUCAUGUUGGGAACAUGCUAGACCUCAGUAUCCUUGAGGGAUGCUGCCUUGGGUCUGGAAACUGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-235.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -243.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 86.5
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((..(((.((((.((((.(((....))).))))(((((.......)))))...)))).)))....)))))))))))....(((((....)))))(((........))).(((((....)))))((((..(((((((((..((((((((.((((((........).)))))...))))))))..(((((((.......)))))))(((((((.......(((((.........))))).....)).)))))..(((((....(((((((((((((((((((((((...((((......))))))))....))))))).......))))))))))))....)))))..(((((.(((((((...))))))))))))((((......)))))))))))))...))))..(((((((((.........((((((...(((..(((((..(((((....))))))))))..))).)))))).......)))))))))..(((((((((((((((((...)))))))))....))))))))...)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((..(((.((((.((((.(((....))).))))(((((.......)))))...)))).)))....)))))))))))|||,,(((.,.{,{{||.,,|}},,}}}))}).(((((....)))))((((..(((((((((..((((((((.((((((........).)))))...))))))))..(((((({.......)))))))(((((((,,.....(((((.,....,..))))).....},,|||||,,(((((....{{{{{|,{{|||{||||||({{{...((((......)))),,,}...,))))))}......,)))}}})}))))....)))))..(((((.(((((((...)))))))))))){(((......)))})))))))))...))))..(((((((((.........((((((...(((..(((((..(((((....))))))))))..))).)))))).......)))))))))..(((((((((((((((((...)))))))))....))))))))...}})}.
Back