Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG11:16
Sequence Length
1058 nt
GC Content
0.5888
CCCGCCGCCAUCCGUCCUGGCGCUCCGGAUGAGUCAAUGAGGGGCAGGGCCCGAGGAGUGGUCUUCCCAAGAACCCCUGGUGGCCUCCCAAGGCCGGUGCUGUGUACCUCCUCCCCGACAAAAGGGGAAACUGAGGCCCCGAGGGGAGUGGGAAGAGCCGGCUGGACGUCAGGCCCAGCCGCUGGUGCAGUGGUCCGUCCCCUCUGCCGGGGUGGGCCCCUCGGGUUUCGCGUGUCCUCGGGAAAGAGACUGGCGGGCCUCGUGGGCUGUGCGGCUAUCCUGGAGACAGAUGACAGCUCUCCCUUGGAUGGCUUUGCUGGUUCCGCACCAGCCAGCGCCCCCAUUUUUCCUGCAGCACCCUGAUCUGCACUCCCUGAGGGGCUCCCACUGUCCGCGGUGUGAGGAUGUCCCUGGAUAGUCCACUGUGUGCAGAGGCAUGGGAGUUGUCAUGUUGGGAACAUGCUAGACCUCAGUAUCCUUGAGCUUGAAGAAAGACGACAGAACACUGGAGACCAAGUACUUACAGCCUUCUGCUCUGUGGCCCCUCCUCACUCCAGGGAUGCUGCCUUGGGUCUGGAAACUGUUAGAGGAAACCCCAAGAGGUGCAGGCACUGAGCCUCUCAGGACAAUGACCUGGGGUCCCAGCUCCCCUGGAGGGGCCUCCUCAUGAUUGUUUGGGGGUUGAUCACAGACCAAGAGUGACGAGUGAUGUCACCCUGUGACUCAUGGCUGGACCUUCUUGCCCCUAUUGUCUCAGCACAACAUUAUUCGACUUUUCCCUCAGCGUGGGUGGGCAGAGGAAAAGCCCUGUGGCUCUGGGGACUUGGGAUCCAGAGUUGAAGACCCUUCAGCUGGCUCUGCCCUGCCAGUGCCACAGAGUGCCAUGGCCCAGGAAGACAGGUUUUCUUCCAUCUAGGCCAGGCCAUCCAGUGGCCAUCCUCCGUGUCCUCCCGCCUCCUCCUGGUGUGACUUCUGAAAACCAAGAAUUUGUUCCUGUUGACUUUUUCUGUGCUAUGGACCAUUGUCCUCUCACCCACUCAAUAAAUCUUGAAACAUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-438.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -455.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 238.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((.......)))))...))).(((((...((((((((.(((((.((.((((((((((((((....(((((((.((((((....((..(((((...))))).))(((((.......)))))....)))))))).)))))..)))))))).)).)))...).)).))))).)))...((.((((((((((((...((((((((.(((((((((((((((....(((.((((((((((((((...(((.((((...((.((((((((((((((((.((((((........).)))))...)))))))...........)))).))))).)))))))))))))))))).))......))).)))....))))))))))....((((((((.(((((....))).)).))))))))))))).)).))))))(((((((((..((((...((((((((..(((((((((((((((((((.(..(((.((..(.(.(((((.((((((((........))).))).....)).))))).).)..)).)))..))))))))))))....))))))))((((.(((((((((..((((.((((((.(((...))).))))))((......)).((.((((........)))).)).))))..))))).)))).))))(((((.............((((((..((((((((((....(((.(((....(((.(((...))).)))......))).)))....)))))))))))))))))))))((.(((((.((((((((((...((((((((((.((((.(....(((...(((((((((((...)))))....)))))))))).)))).))))))).).))..(((((..((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).)))))..))))).)))))))..((.((((.............)))).))...)))))))).))))..))))))))).)))))))))))))))))))...)))))..................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.(((((.......}))))...)))|{({{(,.,{{({{(((.{{|{{,{{.((((((((((((((....(((((((.((((((...,((..(((((...))))).))|((((.......))))}....)))))))).)))))..)))))))}{}|{{||{{.|.,,.}),))})))}},((.((((((((((((..,((((((((.(((((((((((((((....(((,(({{{(((((((((...(((.((((...((.((((((((((((((((.((((((........).)))))...))))))}..........,))))}})))).)))))))))))))))))).}),,,...))}.}))....))))))))))....((((((((.(({({....}}}.)).))))))))))))).)).))))))(((((((((..((((...{(((((((..((((((((((((((((((({(..(((.((..(.(.(((((.(({{((((.,...,,.,,,.}}).,}}})).))))).).}..)).)))}}})))))))))))....)))))))),,{{.{((((((({.,((((.{(((((.(((...))).)))))){{|{,,,,|,,,{.((((,,{{..,.||,,.)}.)))),,)))}}.)})),)))|((((({,{,,{.({{.{{(.((((.{(({((({{{,,,,.{{|,{||,,.}|||,|||...)),.)))}},...))).}}),,..}}}}}}}}}},,,,,,,,,,,||.(((((.((((((((((...((((((((((.((((.{....(((..,({{((((((((...)))))})}}),))),}))}.)))).))))))).).))..(((((.,((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).)))))..))))).)))))}},}}}.|}||,,..,||||,....,,.,}}...)))))))}.))))..))))))))).)))))))))))))).,,,,.,,)))),.......,,,........
Back