Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG11:20
Sequence Length
634 nt
GC Content
0.5410
CUCCAGGCAGCUCACUUUGGCCUCUGUUCCUGGAUCCCCUUUGCUCUUUUCUGCGCCUGCAUUCAUAGUCCACUGUGUGCAGAGGCAUGGGAGUUGUCAUGUUGGGAACAUGCUAGACCUCAGUAUCCUUGAGGGAUGCUGCCUUGGGUCUGGAAACUGUUAGAGGAAACCCCAAGAGGUGCAGGCACUGAGCCUCUCAGGACAAUGACCUGGGGUCCCAGCUCCCCUGGAGGGGCCUCCUCAUGAUUGUUUGGGGGUUGAUCACAGACCAAGAGUGACGAGUGAUGUCACCCUGUGACUCAUGGCUGGACCUUCUUGCCCCUAUUGUCUCAGCACAACAUUAUUCGACUUUUCCCUCAGCGUGGGUGGGCAGAGGAAAAGCCCUGUGGCUCUGGGGACUUGGGAUCCAGAGUUGAAGACCCUUCAGCUGGCUCUGCCCUGCCAGUGCCACAGAGUGCCAUGGCCCAGGAAGACAGGUUUUCUUCCAUCUAGGCCAGGCCAUCCAGUGGCCAUCCUCCGUGUCCUCCCGCCUCCUCCUGGUGUGACUUCUGAAAACCAAGAAUUUGUUCCUGUUGACUUUUUCUGUGCUAUGGACCAUUGUCCUCUCACCCACUCAAUAAAUCUUGAAACAUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-233.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -243.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 182.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((.(((......((((((((((..(((((((((....((((((...(((..(((((..(((((....))))))))))..))).))))))(((..((((((((.((..(((((((((((((((((...)))))))))....))))))))((((.(((((((((..((((.((((((.(((...))).))))))((......)).((.((((........)))).)).))))..))))).)))).))))((((((.((((.(((.(((.((((.(((.(((....)))..))).)))).))))))))...))..))))))..))))))))))..)))............((((.(((.((.(..((((.........))))..).)).)))))))...)))))))))((((((((...))))))))(((.(((......))).))))))))).))))(((((..((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).............((.((((.......)))).)).((((........))))...)))))))............(((....((((....))))...)))....((((......)))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,{{((((((((.({.,,({{(((((.{{{{(((......{((.,.....,,,..,,|||..,,,,|}}},,,),),))))}}))}.))))))}}}|,{{{({{{{{{{,,(((((((((((((((((...)))))))))....)))))))),{{{.{{{((((((..((((.((((((.(((...))).)))))){{{{,,,,||.{{.((((,,,,....}}}}.)).)))),,)))}}.)})).))}|||||{{.{{,,.(({.(((.((((.(((,(((,,,.}}}.|||},||}}.}|||}}||...))..)))}}},..|||,}||{{,,,,},,,,|||{{.........{{.(((((.((((((((((...(({(((((((.((((.{....{((,.{({{((((((((...)))))))}}),})},}}}}.)))).))))))).).))..(((((.,((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).)))))..))))).)))))},.,,,.||||,.,,.,{{{....,,,,})}}..,},,,,,}}})}....,..)}})}}..||||....)))),..,,),,,.{{{{......}))}...,...
Back