Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG11:22
Sequence Length
1422 nt
GC Content
0.5021
CGCCUGCAUUCGUAAGUGAUCACGGGCUGCCCGUGUCCUGGUCAUUGGUAGUGCAGGCAGAGGAAAUGCGGGAAAGGUUGCUGUGUUUGGAGGGUCCACAUCUUCACCCUCCUGUCCCAGGAGCUUUCCUACACUCCUCCUUCUCAAAGCUGCACACACCUGGGGCCUCCAGGGGAUUGGGGGCUGCCGUGUGUGUUAUAUCAUGAUUAGAGCUUUCACUUCCUGCUCCCUGCUGUUGGGAACCAGGCUGUGUGUGUUGCUUAAAUUCCCCUUGAUGACCAGCAGAGUCACUGCCACUCAGCCAUGGCACACUGCUGUAAACCUGGUUUUGAUCUCCUUUCAAUCUUUUGCUGAUUAACUACACAUUGAUCAGUGUUGGCCACCCUCACCCUGCCAUAGACCAUCCGCUGUCUUCCUCUGUAGAGUUAACUAUUUUCUCUUUUAUGAGGAAAUAGUGUGUUUGCUUAGGAGUGUUUACUGUCUGGUAACUACUGUGCUAAGCCCUUUCCUGUUGCCUGCCAUCCCUGCUGCGAGCAGGGACAAGCUGGGUGCUCACUCAUGGCAUCUUAUCUGUUGCAGAUAGUCCACUGUGUGCAGAGGCAUGGGAGUUGUCAUGUUGGGAACAUGCUAGACCUCAGUAUCCUUGAGGUAAGAUCUCUGGUUCAUUCUCUGGAAUGUUGGUUCCUUGUAUCUAGUACAGUUCUGUACAUGUUCCCAGGGGCUUUGGGGUUGGUGUAGGGGAGCUGAGAGGUGAGAUGAGAAUGGCACUGUGGGUCCCCAGAUCCGCUGUCCACCCAGCCAACCCAGAUCACCUCUGGCCUUUCCUGUGCCUUCCGGGCUUGCUGCUGGGGGGAAACCUCCAGAGUCCCACUUUGGUAAUAAGAGGUCUCUGCCCUUUCUCCCUGGGCAGCAGGAUGUUGUAAUGGAAAAUGAGUGGACCUAGGCUUCAGAGACUCUGGUCCCCUGGCUUUGAAUCCCCUUCUGCCACUAUCCCAGUCAAGGACUGAUUCAGAACCUAAUUUUCUUCAUUUGGAAAAUAAUGUUCUGAUAGAGGUGACUUUUGUGGUACUUGAGACCAUAUGAUUCCUAUCAUUACCAACCAAUAUUUUCCGAUUGUUUUUGCCCCAUGUGACUUCUCUGUGAUUCCUCCUGGCAAGGAAGUUUUACAGGAAAGCAGGGCCACUUUUGGGAUCCUGUGCUGGGCUGGAUCAUUUUCCUGGACUGGACCUAGUCCACAAGCUGCUGGCAUCUGUUUCUCCUCAUGGAUCUCUCUCUGCCCUUGUAUACACCUGCAUUCAAAAAUGAUCACGGGCUGCCUGUGCUCUGGUCAUCAAUAACGCAGGGAGAGGAAUUGCUGAAAGCCGUUUCCCGUGUUUGGAGGGUUCACACCUGUCCCUUUCAAAUGCUGGCGCUUUCACACAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-520.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -545.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 255.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((....((((((((.((((.......))))))))))))...))))))))).(((((..((.(((((((.((.(((.(...(((((((..........)))))))...).))).))))))))).)).)))))......((((((((((((((..(.(((((((((....))))))))).).))))))))..............))))))...(((((.((((((((.((((((((..((((..........))))...))))).(((((((((((((((((...(((((........))))).))).))))..........((((.......))))......(((((((((.......)))))))))..((((............)))).((((........))))((((..(((((....(((((((((((......)))))))))))...)))))..))))(((...((((((((.((((....(((((((((...........((((((..((((((((...))))))))...)).)))))))......)))))).......)))))))))))).)))(((((((((.((((.(((((...(((((..((((((((((((((((((((.....))))))).((((((((............(((((....))))).........(((((....))))).((((.(((((((((((((((((((((((((((((.(.((((((((..((.(..((((((.(((((((....))))))).)).......))))..)))..)))))))).).))))))))))))((((.(((.....))).))))..)))).))))))))))....))).))))))))))))((((((.........))))))(((..(((......(((((((((..(((((..((((....)).))..)))))..((((...(((.....))).))))(((.((((((..(((((((..(((((((...(((((((......)))))))...)))))))))).(((((....((((((.......))))))((((....)))))))))..........((((((..((....((((..(((...(((.((((((..(.((((....)))).)..))))))))).))))))).))..))))))))))..)))))).))).))))))))).((((((....)))))))))..)))))))))..)))))).)..)))))....))))))))).)))))))))...............((.((((((...)))))).)))))))))))).)))))))))))))))).((.(((((((.....((.((((((((((((..((....))..)))))))))))).)).)))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((....((((((((.((((.......))))))))))))...))))))))).(((((..((.((((((({((.(((.(...(((((((..........)))))))...}.))).))))))))).)).)))))......(((((,((((((((..(.(((((((((....))))))))).).)))))))).............,}|||||{{.(((((.((((((((.(({(((((..((((..........))))...))))).(((((((((((((((({...{((((..,,{{.,|||||.|},,}}}|...,,||||.{(((.......)))}......(((((((((.......))))))))),.{(((............)))}.((((........)))}((((..(((((....(((((((((((......)))))))))))...)))))..))))|{{...{{(({{{{{((((....{,((,,,||........}}}|||,||,.((((((((...))))))))...)).)))})},......})))},..{{,,,|}}})))))))}.}}}(((((((((.((((.(((((..,(((((..((((((((((((((((((((.....))))))).((((((((,{..........(((((....))))).........(((((....))))).{{{{.(((((((((((((((({((({((((((((,(.((((((((..((.(..((((((.(((((((....))))))).)).......))))..)))..)))))))),).))))))))}))){(((.(((.....))).)))},.)))).))))))))))....))).}))}))))))))((((((.........))))))(((..{,|......((((((((({.(((((.{(({(....}}.}}..))))),,{(((...{{|.....},,.))))(((.((((((..(((({{...(((((((.,.(((((((......)))))))...))))))).,|,({,,..,,.{(((((.......)))))}((((....))))},,,,..........((((((..((....((((..,,(,..(((.((((((..(.((((....)))).)..))))))))).))))))).))..))))))))))..)))))).))).))))))))){((((((....)))))))},..}}}))))))..})))))))..))))),,..))))))))).)))))))))..,,,..{,.....}||.((((((...)))))).}))))))))))).}))))))))))))))).,|.|||||||,,...{(.((((((((((((..((....})..)))))))))))).)),)))))},.....
Back