Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

SNHG11:24

Sequence Length

1186 nt

GC Content

0.5076

ACUAGAUGGUGGAGAAAGCCUGUGUGAAUUAUUUUUAAUGAAUAAGUGUGAUGAUGGGUGGCAUACAGUCACUGCCUUAAGAUUUUCAAAGAGAAGCAGCCUUUUGGAGGUGGUGGGCCUGGGCAGGUCUUUCAAGGAGUGGGAUGUGAUGGGCAGUAGAAAGGUAUUCCAGGGAGGGGUAGCAACAUGAGAAGGUCUUUCAAGGAUUGGGAUGUGAUGGGCAGUAGAAAGGUAUUCCAGGGAGGGGUAGCAGCAUGAGAAGGUCUUUGAGUCUGGGAUGAGCAAGAGUGUCUAGUCCCACCAGGGAGACAGAUGUGUAGGCAAGUAAUGACAGCAUGGAGGGAUGGCUGCUGGGGUGAUCCUUGGCUCCCAGCACGGCGAGGUGGACAUCUAUGGGAGGGGCCCUGAGAGGUCUCUUGAGCUGUCUUUCUGCCAGUUGCACAUCUGCUCAGUUGCCUGUUAAGACUCUUAAGACAGUUUUGCUGGACUCUUAAGUUUUUAUUUUGAUAUUCUUUGGGAGCAUUGAGAUUCCUUUUUGAGAUGAGUUUGGUAUGAAAGAAACUGGCAACUCAUACCUGAUUGAUUAACUGGGGGCAUUCCCAUUGACAUCAGCUUGAAGAAAGACGACAGAACACUGGAGACCAAGUACUUACAGCCUUCUGCUCUGUGGCCCCUCCUCACUCCAGGGAUGCUGCCUUGGGUCUGGAAACUGUUAGAGGAAACCCCAAGAGGUGCAGGCACUGAGCCUCUCAGGACAAUGACCUGGGGUCCCAGCUCCCCUGGAGGGGCCUCCUCAUGAUUGUUUGGGGGUUGAUCACAGACCAAGAGUGACGAGUGAUGUCACCCUGUGACUCAUGGCUGGACCUUCUUGCCCCUAUUGUCUCAGCACAACAUUAUUCGACUUUUCCCUCAGCGUGGGUGGGCAGAGGAAAAGCCCUGUGGCUCUGGGGACUUGGGAUCCAGAGUUGAAGACCCUUCAGCUGGCUCUGCCCUGCCAGUGCCACAGAGUGCCAUGGCCCAGGAAGACAGGUUUUCUUCCAUCUAGGCCAGGCCAUCCAGUGGCCAUCCUCCGUGUCCUCCCGCCUCCUCCUGGUGUGACUUCUGAAAACCAAGAAUUUGUUCCUGUUGACUUUUUCUGUGCUAUGGACCAUUGUCCUCUCACCCACUCAAUAAAUCUUGAAACAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-426.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -448.5

Frequency: 0.0000

Diversity: 247.89

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.............((((((((((.(..(((((.((((.....)))).)))))....((((((.....))))))((((....((((((((((.(......).))))))))))...))))..).))))).)))))...(((((((.((.((.(((((((.....((....)).((.....((((((.((.(((((((((.....((((((((..((((((.(((........((....)).(((((((((.((((.(..((((((.((.((((((((((((((((((((.(((((((((....(((((((.((((((((((((((.(.((.((((((.(.((((((((.((((((((((.(....).)).))))))).).)..........(((..(((.....)))..))).))))))).))))))).)))))))...))))))))))))).....))))....))))....))))).)))))))(((.(((((((((((((.............))))))).)))))).))).......(((.((((.(((((((..............))))))).)))).)))...(((((....)))))....))))..(((.....))).(..(((....)))..).)).)).))))).))))))))..))))).)))))))))..((((((((..(((((((((((((......(((.....((.....)).((((((.(((...))).)))))))))......)))))))))...))))..))))))))......(((((........)))))))).))))))..))))(((.((((((((((((....(((.(((....(((.(((...))).)))......))).)))....)))))))))).....)).)))((.(((((.((((((((((...((((((((((.((((.(....(((...(((((((((((...)))))....)))))))))).)))).))))))).).))..(((((..((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).)))))..))))).)))))))..((.((((.............)))).))......))))...)))))))))))))))))...))))))))))).)))))))))..................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,.,.,,..,...((((((((((.(,.,(((({(.....,}}))}|,||}||.,,.{{{{{|,,...)))))}((((....((((((((((,(.......}))))))))))...)))).,).))))).)))))...(((((((.((.((.(((((((.....((,...||.,{,.,|,((((({{((.(((((((((...,.{(((,((({{((({,{{(({{{{{,...{{|,,,}}.(((((((((.((((.,..((((((.((.(((((((((,...(((((((.(((((((((....(((((((.((((((((((((({,(.{{.((((((.(.(((((((,{((((((((((.(....).)).))))))}.}})........{.(((..(((.....)))..))).))))))).))))))).},)))))...))))))))))))).....))))....))))....))))).)))))))(((.(((((((((((((....,.....,..))))))).)))))).))),{{{{{{((((((((,({({{,.......,},.,}}))))),,|(({||{.((((.(((({....}))))))))})))))|||}}}},,,,.(..(((....)))..).)),}).))))).))))))))..,)))).))))))))}..((((((((..(((((((((((((.,....(({.....{{....||}.((((((.(((...))).))))))}}),.....))))))))),..))))..))))))))}|||||((,|{....,}..,)))))}}.}||,||,.|||,((((.{(({((({{{{,,,.{{|,{||,,.,|||,|||...})}.))).,,,.,))).))}....}}}}}}}}}},,,,.}},},,{{.(((((.((((((((((...((((((((((.((((.{....(((..,({{((((((((...)))))})}}),))),}))}.)))).))))))).).))..(((((.,((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).)))))..))))).))))))},,||.|||{,,..,,,|,....,}}},)},.....})))...)))))))))))))))))..,))))))))))).)))))))))......,}}.........