Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG11:30
Sequence Length
1065 nt
GC Content
0.6000
GUAUUUCCGCGGGCGCUGAGCACUAGAGAGAGCGUCUUGUGGCUGCGGCCUGCCCCUCAGCCUCCUCCGCGCGGUUACCCCUGUACCCGCCGCCAUCCGUCCUGGCGCUCCGGAUGAGUCAAUGAGGGGCAGGGCCCGAGGAGUGGUCUUCCCAAGAACCCCUGGUGGCCUCCCAAGGCCGGUGCUGUGUACCUCCUCCCCGACAAAAGGGGAAACUGAGGCCCCGAGGGGAGUGGGAAGAGCCGGCUGGACGUCAGGCCCAGCCGCUGGUGCAGUGGUCCGUCCCCUCUGCCGGGGUGGGCCCCUCGGGUUUCGCGUGUCCUCGGGAAAGAGACUGGCGGGCCUCGUGGGCUGUGCGGCUAUCCUGGAGACAGAUGACAGCUCUCCCUUGGAUGGCUUUGCUGGUUCCGCACCAGCCAGCGCCCCCAUUUUUCCUGCAGCACCCUGAUCUGCACUCCCUGAGGGGCUCCCACUGUCCGCGGUGUGAGGAUGUCCCUGGUCCACUGUGUGCAGAGGCAUGGGAGUUGUCAUGUUGGGAACAUGCUAGACCUCAGUAUCCUUGAGGGAUGCUGCCUUGGGUCUGGAAACUGUUAGAGGAAACCCCAAGAGGUGCAGGCACUGAGCCUCUCAGGACAAUGACCUGGGGUCCCAGCUCCCCUGGAGGGGCCUCCUCAUGAUUGUUUGGGGGUUGAUCACAGACCAAGAGUGACGAGUGAUGUCACCCUGUGACUCAUGGCUGGACCUUCUUGCCCCUAUUGUCUCAGCACAACAUUAUUCGACUUUUCCCUCAGCGUGGGUGGGCAGAGGAAAAGCCCUGUGGCUCUGGGGACUUGGGAUCCAGAGUUGAAGACCCUUCAGCUGGCUCUGCCCUGCCAGUGCCACAGAGUGCCAUGGCCCAGGAAGACAGGUUUUCUUCCAUCUAGGCCAGGCCAUCCAGUGGCCAUCCUCCGUGUCCUCCCGCCUCCUCCUGGUGUGACUUCUGAAAACCAAGAAUUUGUUCCUGUUGACUUUUUCUGUGCUAUGGACCAUUGUCCUCUCACCCACUCAAUAAAUCUUGAAACAUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-466.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -482.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 219.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.((((((((((((.(..((((.....))))..)))).))))((((((((((..(((.((((.((((.(((....))).))))(((((.......)))))...)))).)))....)))))))))).))))).)))).((((((((((....(((((((.((((((....((..(((((...))))).))(((((.......)))))....)))))))).)))))..)))))))).))((((((.(.....).))))))((.((.(((((((.(((.((((......)))))))((((((((((....(((.((((((((((((((...(((.((((...((.((((((((((((((((.((((((........).)))))...)))))))...........)))).))))).)))))))))))))))))).))......))).)))....))))))))))..)))))))))))((((.((((((.....((((((((((....))).((((((((((..((((...((((((((..(((((((((((((((((...)))))))))....))))))))((((.(((((((((..((((.((((((.(((...))).))))))((......)).((.((((........)))).)).))))..))))).)))).))))(((((.............((((((..((((((((((....(((.(((....(((.(((...))).)))......))).)))....)))))))))))))))))))))((.(((((.((((((((((...((((((((((.((((.(....(((...(((((((((((...)))))....)))))))))).)))).))))))).).))..(((((..((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).)))))..))))).)))))))..((.((((.............)))).))...)))))))).))))..)))))))))).)))))))..)))))).))))...((((......))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,..{((,(((((((({{((.{..{{{{..,,,)))),,)))).)|}|((((((((((..(((.((((.((((.(((....))).))))(((((.......)))))...)))).)))....))))))))))}))))).)||{{((((((((((....(((((((.((((((...,((..(((((...))))).))|((((.......))))}....)))))))).)))))..)))))))|{}|((((((.(.....}.))))))||,((.(((((((,(((,((((......)))),||((((((((((....(((,(({{{(((((((((...(((.((((...((.((((((((((((((((.((((((........).)))))...))))))}..........,))))}})))).)))))))))))))))))).}),,,...))}.}))....)))))))))),})}}||||}|||((((.{((({{...,,|{{{{|||||,}.}))).((((((((((..((((...{(((((((..(((((((((((((((((...)))))))))....)))))))),{{{.{((((((({.,((((.{(((((.(((...))).)))))){{,,,,,,|,,{{.((((,,{{..,.}},}.)}.)))),,)))}}.)})),)))|((((({.{,{{.({{.(((.((((.{((,(((,,,,}}}.{||},||}}.}|||}|||...)),.)))}},...))).))),,..}}},,,,}}}},..,,,,,,,{{.(((((.((((((((((...((((((((((.((((.{....(((..,({{((((((((...)))))})}}),))),}))}.)))).))))))).).))..(((((.,((((((.......)))))).....)))))((((((...)))))).)))))..))))).)))))}},}||.||||,,..,||||,...,,,,,)}...)))))))}.))))..)))))))))),))))))),)))))}}.}}})}}}||{,......}))}....,,,
Back