Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG11:37
Sequence Length
1522 nt
GC Content
0.5933
GUAUUUCCGCGGGCGCUGAGCACUAGAGAGAGCGUCUUGUGGCUGCGGCCUGCCCCUCAGCCUCCUCCGCGCGGUUACCCCUGUACCCGCCGCCAUCCGUCCUGGCGCUCCGGAUGAGUCAAUGAGGGGCAGGGCCCGAGGAGUGGUCUUCCCAAGAACCCCUGGUGGCCUCCCAAGGCCGGUGCUGUGUACCUCCUCCCCGACAAAAGGGGAAACUGAGGCCCCGAGGGGAGUGGGAAGAGCCGGCUGGACGUCAGGCCCAGCCGCUGGUGCAGUGGUCCGUCCCCUCUGCCGGGGUGGGCCCCUCGGGUUUCGCGUGUCCUCGGGAAAGAGACUGGCGGGUGAGCCGCGCCCUCGGCCUUCGCUGGGCUAAGCCGACCCCAUGCAGACGUCAAACCCCCCUAGGUCGGCACAGCCUCUCUGCGGGGAGGCUUAGUGCCCCCUUGAGAAACGGCUUGGCAACGCUGUGCCCGGGGCCUUGCACGCGGGCUGAGGGGGCUAGAGACCUCGCGACUUUUACUCCCCCGACCCCGAUCUCCGACUCCUGACUUUGGAAGCCCCCAAAGCUGCUUUUCGGUUGCCUACAAAGUGUCGGUCAUUGUGCCACGUCCUUGGAACCGUGAACUCAUUUUCUCCUCAAUAACCUUUAAAAAGUAGCUGUAAAACCUCCAUUUUACAGACCAGUUGGCUGAGGUUUAAAUGGAGGACGCUCCCAGGGCCCCAGAGGGGCGAAUUCCAGACUCCUUUGCCAGGACCUUGUACUAAGCCCCUUCCCUACGCUUUUCCCUGCCUAGGCCUCGUGGGCUGUGCGGCUAUCCUGGAGACAGAUGACAGCUCUCCCUUGGAUGGCUUUGCUGGUUCCGCACCAGCCAGCGCCCCCAUUUUUCCUGCAGCACCCUGAUCUGCACUCCCUGAGGGGCUCCCACUGUCCGCGGUGUGAGGAUGUCCCUGGAUAGUCCACUGUGUGCAGAGGCAUGGGAGUUGUCAUGUUGGGAACAUGCUAGACCUCAGUAUCCUUGAGGGAUGCUGCCUUGGGUCUGGAAACUGUUAGAGGAAACCCCAAGAGGUGCAGGCACUGAGCCUCUCAGGACAAUGACCUGGGGUCCCAGCUCCCCUGGAGGGGCCUCCUCAUGAUUGUUUGGGGGUUGAUCACAGACCAAGAGUGACGAGUGAUGUCACCCUGUGACUCAUGGCUGGACCUUCUUGCCCCUAUUGUCUCAGCACAACAUUAUUCGACUUUUCCCUCAGCGUGGGUGGGCAGAGGAAAAGCCCUGUGGCUCUGGGGACUUGGGAUCCAGAGUUGAAGACCCUUCAGCUGGCUCUGCCCUGCCAGUGCCACAGAGUGCCAUGGCCCAGGAAGACAGGUUUUCUUCCAUCUAGGCCAGGCCAUCCAGUGGCCAUCCUCCGUGUCCUCCCGCCUCCUCCUGGUGUGACUUCUGAAAACCAAGAAUUUGUUCCUGUUGACUUUUUCUGUGCUAUGGACCAUUGUCCUCUCACCCACUCAAUAAAUCUUGAAACAUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-632.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -653.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 447.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((.(((.((((.((....)).)).))..))).))))))(((((((((((..(((.((((.((((.(((....))).))))(((((.......)))))...)))).)))....)))))))))))((((((((...((((((((((....(((((((.((((((....((..(((((...))))).))(((((.......)))))....)))))))).)))))..)))))))).))((((((.(.....).))))))((((...))))((((((.((((......))))))))))))))))))...((((((..((((((........((.(((((((..((((((((((((...(((((((((((((..((((..(((((......(((......))).(((...)))..))))))))).))))))))((((((((.....(((((........)))))(((((.(((...)).).))))).))))))))..((((..(((.(..................))))))))..........((((((......))))))((((((((.(((((.....((((((....((((.((.(((......))).)).))))...))))))........)))))....))))))))((((((((......)))))))).))))).)))))))).......((((((((((((((((.((((((((((((......(((..((((.....))))..)))......)))))....(((((((((((((((((((((....(((((..((((((((((((.((((((........).)))))...))))))))..((((((.....))))))..)))).)))))....))))(((....))).....((((((((((((((((((((((((.(((((((.((...((((....)))).))))))))).)))).....)))))))(((..((((((((.((..(((((((((((((((((...)))))))))....))))))))((((.(((((((((..((((.((((((.(((...))).))))))((......)).((.((((........)))).)).))))..))))).)))).))))((((((.((((.(((.(((.((((.(((.(((....)))..))).)))).))))))))...))..))))))..))))))))))..))).............))))))).).)))))))))).))))))))...)))).))))))).))))))).....((((((((...))))))))(((........))).(.(((((.((..(((.(((((..((((((.......)))))).....))))))))..))..)))))).......)))))))))((((.......))))................((((...(((......)))...))))))))...((((....)))).))))))).)).......)))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,...(((((((((((,,,(.,..,.,,.})}})))}))))})})||(((((((((((..(((.((((.((((.(((....))).))))(((((.......)))))...)))).)))....)))))))))))}))||||({((((,(((((((....(((((((.((((((...,((..(((((...))))).))|((((.......))))}....)))))))).)))))..)))))))|({{((((((.(.....}.))))))))}((.((((((((((((,,{((({((({,{((((((((((((((....((({((,,((((((,,(({,.(((,((({{{({{(({(((((((((,..(({(((((((((((,{{,,..{,.{..,,....,,.....,||}.((({{{||{((((...,)))}))))..))))),|||,}.,...||||}}}}}...}}}}}|||||,|||,..}}.).))))),}))))||},.((({,.{{{,{,.......,,.,.,}...,}),}}}}.,..|,|.,,{,{(((.,,,,,))}}||((((((((.(((((.....((((((..{,((((.((.(((......))).)).)))).,.))))))........}))))....))))))))||((((({......})))))}|.}|||}.}|||||||...,,,,(({({.{{||||(((((((,(((((((((........}.))))))))...)).)))))..,..{((((|...((((.((........)).))))....}.)))))}})}|||(((((.((((((........).)))))...)))))))}..((((((.....)))))).))))))))))))),,)))}|})}...,,).},})),...}}})}))))),.,,((((({((.(({{,,,..}||,}).}}))))})))))).)).)))))){((((((({..((((...{(((((((..(((((((((((((((((...)))))))))....)))))))),{{(.{((((((({.,((((.{(((((.(((...))).)))))){{,,,,,,|,,{{.((((,,,,....}}}}.)).)))),,)))}}.)})),)))|((((({.{{{{.({{.(((.((((.{((,(((,,,,}}}.|||},||}}.}|||}|||...)),.)))}}}...))),)}),,..}}},,,,}}|,,....,,,,,||.(((((.((((((((((...(({(((((((.((((.{....{((,.,{{,{(((((((...)))))})}|}|}}},}}},.)))).))))))).).}}..(((((.,((((((.......)))))).....)))))((((({...)))))).)))))..))))).)))))}},}||.||||,,..,,|||,...,,,,,}},..})))))},.))))..})))))))).}}))))))))))))......)))))}........,}}........
Back