Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG12:1
Sequence Length
1365 nt
GC Content
0.4952
CUGCCUCAGCCUCCCGGGUAGCUGGGACUACAGGCGCCCGCGACCACGCCCGGCUAAUUUUUUUUUGUAUUUUUUUUUAGUAGAGACCGGGUUUCGCCGUGUUAGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUCGUGAUCCACCCGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGUAACCGCACCCGGCAGUAGUACCUACUUUUUAAAGUGUAAGCAAGGAAAGUUGGCCCGCACCUGUAGUCCCAUCUACCUGGGAGGCUGAGGUGGAAGAAUUGCUUGAGCCCAGUUGGUCGAGGCUGCAAUGAGCCUUGAUCACGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAACAGAACAAGACCCUGUCUCAAACAAAAAAGUGUAUGUAAGAAUAAAAAUUAAUAGAUUAGGCACAGGAUGGGUGUUUAAUUCUCGGCAAUCACCACUAAGUUUUCAUACUGAGGCUUAUUCAUUCCAUGGGCAAAACAUUGCGCUAUGUGUGGUGCCUGGGGUGGGCUCCAAAUUCCAGUCCUCUCCUCGCUUGCGAUAGCUGUGUGAUCCAUUCCUAAGUUUCCUUAUUUGUCCACAGAGCGUACACAGGGUUUUUAUGAAAACUAGAUCAGAUAAUCAGACACAGUUAAAAUAGCACGCGCUCAGUAAAAUUACAUAUUAGUGGAAGAGACAAGCCUUGAAUAAAUCGCCUUUCGGGGAGUAUGACCCCCUCCCCGAAACCCACUCAGGCGCUGCUCGCUCGCACGCCCACUGAGCUCGGAGCGGAGCCCGAGCCCUUUCCCAGCACACAGGGUUCAUUUCCAGACUGAAAGACAUCCCAGAGACAACUCCAGAGGCCAAGGCGGGUCGGCUUCCUGCGUGGGCCCAGCGCCGGGCACUGAAAGGCGGAUAAAACGGUCCCAUCAAGACUGAGAAAAAGCACACCAGCUAUUGGCACAGCGUGGGCAGUGGGGCCUACAGGAUGACUGACUUAGUCUACAGAGAUCCCGGCGUACUUAAGCAGAUGAAGACUCUUAAGAUGACAGAAGGUGAUUUUUCUGGUGAUCGAGGACUUCCGGGGUAAUGACAGUGAUGAAAUGCAGGGGACCUGGUUGCCCCCAAGUUUCCUGGCAGUGUGUGAUACUGAGGAGGUGAGCUUGUUUCUGGAGCUGUGCUUUAAGAUUCAUGUUACAUGUAAAGCUGUCCUCAUUUGUGACUAUGGACCUAUGGAGUUGGGACAAUCUCUAUGGGAAGCAGAAGGCAAGGACCCCGGUCAUUUUAGGUAGAAACAACAGCAUGCUAAUGCAAAAAAUUAUGCAGUGUGCUACUGAACUUCAGAGGUGAUCAAUAAAAGAAGAAUAAAAAGACUAAUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-454.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -480.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 373.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((((((.((((((((((((.((..(((....)))..((((((((((((((((((((((.....(((((.((((((......))).))).(((.((.((((......(((.((.(((.(((((((...(((.((((....)))).)))...)))))))))))).)))..))))..)).)))........)))))....))))))))...)))))))))))))).)).)))))))))))).)))))))))))))))))))))..(((((....(((((((..(((((((((((......))))))))))).(((...((......))...))).((((.........))))..((.(((......))).))..................((((((((((.......))))))))))(((((....((((((((((((((......)))))))).......(((((((((....)))).))))).)))))).))))).)))))))..)))))..(((((..((((((((....(((((((((((((..(((.((((...((((...(((.(.......).))).))))..)))).))).....))))..........)))))))))....((((((.((((..........(((....)))..((((((((((..........(((((((((((((((.........))))))))).((((.(((.(((((((..........((((..((.(((.((((.((.((....)))).)))).))).))..)))).((((((...((((......(((((.(((....(((....((((.(.(((((.......))))).).))))..((((((((..(((......((((......)))).....((((((((....((((..((.(((........)))((((((......)))))).)).)).))..)))))))).)))....)))))))).((((((.((.......))))))))....(((((((....)))))))......)))...))).))))).....))))...))))))((((((((.(((......))).))))))))))))))).)))...)).)))))))))))))))))).))))))))))......(((((((((((..................)))))).)))))((((((((((((...))).))))))))))))).).)))..)))))...(((((((((..(.((...((..((((((((...(((........)))))))))))..))..)).).)))))))))..............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((((((((.((((((((((((.((..(((....)))..(((((((((((((((((,{,{{,,...(({((.{{((((({...{|||.|||.{{({((,,(((...,|||||,||.{{{.(((((((...(((,((((....)))}.)})..,))))))))))}},},,..}}})}})))))}.,,.,...)))))....)))),,...)))))))))))))))).)).)))))))))))).)))))))))))))))))))))..(((((....((((((({,(((((((((((......))))))))))).{{,...((,,.,,,}|,{{}||.,{{{.....,,,.}})}||,,.{{,......}}}.|}..................{{{{{{{{{|.,,..,,))))))}}}}{{{(({...{(((((((((((((,....,)))))))).......(((((((({....}))).))))).))))))})})))})))))))..)})))..(((((..((({((((.,..(((((((((((({..,{{.({((..,{{{{...{((,,,,.,,,,},,,,.})}|,,||,,.}}),,,}.}}}}......,,..}))))))))....((((((.((((.,,.....|||......}}}..((((((((((..........(((((((((((((((.........))))))))),..,.,{({((((,(((..,...}}}}}}}...}}}|(({((,{{,,.)})}))))||.,|||{|||{{{{{,|{{.((((((...((((..,...(((((.(((....|||..{.((((.{.(((((.......))))).}.))))}.((((((((..(((...,{,{(({.....,}}}},.,..{({((({(....{((...,,.|||.,,,,|..})}{{{{{{......)))))),|,.,}.)),.)))))))).}}}.,..)))))))).,{{{{{.{{..,,,,.}||}}}}|((.{(((((((....))))))),}.)))})),.,))).)))))..,..))))...))))))((((((((.(((......))).))))))))}),,)))})},..})),)))))))))))))))))).)))))))))).,....{((((((((((.,....,......,.,,.)))))).))))}((((((((({({...}}).))))))))))))).).}))..)))))...(((((((((.,(.{{...((..(((((((,..{(((........)))))))))))..))..))}).)))))))))..............................
Back