Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG12:12
Sequence Length
682 nt
GC Content
0.5425
CCUUCCUGCGCGCCGUUCCCCGCUAGUCGCUGCUGCUGGCGCGCACUCGCCGGGUUUUUCCUCCCACGGCCUCGAGAUGGUGGUGAAUGUGGCACGGAGGAGCCGGGCCUUCCAACCCGGUGGGCCCGAGCUCCGAAAGGCCCCCUCGGCAGUGAGAGGGGCGGGAGCCCGCGGGGGCCGCGCCCUUCUCUCGCUUCGGACUGCGCAACGCUGCGCUCUGGGCUGACAGGCGGAUAAAACGGUCCCAUCAAGACUGAGAAAAAGCACACCAGCUAUUGGCACAGCGUGGGCAGUGGGGCCUACAGGAUGACUGACUUAGUCUACAGAGAUCCCGGCGUACUUAAGCAGGUAGUAAUGAUGGACAGAUGAAGACUCUUAAGAUGACAGAAGGUGAUUUUUCUGGUGAUCGAGGACUUCCGGGGUAAUGACAGUGAUGAAAUGCAGGGGACCUGGUUGCCCCCAAGUUUCCUGGCAGUGUGUGAUACUGAGGAGAUUCAUGUUACAUGUAAAGCUGUCCUCAUUUGUGACUAUGGACCUAUGGAGUUGGGACAAUCUCUAUGGGAAGCAGAAGGCAAGGACCCCGGUCAUUUUAGGUAGAAACAACAGCAUGCUAAUGCAAAAAAUUAUGCAGUGUGCUACUGAACUUCAGAGGUGAUCAAUAAAAGAAGAAUAAAAAGACUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-257.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -269.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 149.79
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((..........(((.((((((((((((((.((.......((((((((((((((((((((.(((.......))).)))..........))))))(((((((((.((.....)).))))))).))(((...(((((((.((((.(((((((((((((.(.((((....))))).)))))..))))))))))))(((((.((.(((((.(((...(((((....((........(((((.......))))).......))....)))))...))).))))))).))))))))))))...))).(((((...)))))....)))).))))))).......)).)))))))((((.((((((..((((..((((..(((.((((((((....)))))).)).))).)))))))).((((((((...............((((...))))))))))))..((((((((..((((((...))))))))))))))................))))))))))..)))))))))).((((((((((((...))).)))))))))..))))))))..........(((((((((..(.((...((..((((((((...(((........)))))))))))..))..)).).))))))))).........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((.(((((((({....,,({.,,,,||.||,|||}||}}}},..(((((((,(((((({{((((.(((.......))).)))..,|,},...)))||{(((((((((.((.....)).))))))).))|||...(((((((.{(((.(((((((((((((.(.((((....))))).))))),.))))))))))))(((((.(,{(((((.(((...(((((....((........(((((.......))))).......))....)))))...))).))))))).))))))))))))...|},.(((({...}))))....)))).))))))){{{{,..,,,)))),}|,((({,{{(,,.{((((.{((((,,(((,((((((({....})))))},}.}}}.}},})}}|{(((((,,,,{(({{..,,...,{(((({{{{.{{{.,,,,,)}}.}}}}}}},,||,{(({{{{{|,|{{|....)))})))))))),....})))))}}|}|,,||,,,,}||,.((((((((({({...}}).)))))))))..|}}..,,)},},,}}}}}|||||||||}||.||...{{..(((((((,..,(((........)))))))))))..}}..))))},,})),))),......}}}}..............
Back