Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

SNHG12:13

Sequence Length

1588 nt

GC Content

0.4924

GAGGGGCGGGAGCCCGCGGGGGCCGCGCCCUUCUCUCGCUUCGGACUGCGCAACGCUGCGCUCUGGGCUGACAGGCGGAUAAAACGGUCCCAUCAAGACUGAGAAAAAGCACACCAGCUAUUGGCACAGCGUGGGCAGUGGGGCCUACAGGAUGACUGACUUAGUCUACAGAGAUCCCGGCGUACUUAAGCAGGUAGUAAUGAUGGACAGGUGAGGCUUUAGGCGGCCGCCCUGGGAUCUGAAUUGCCCCUUGGCCCUUAUCGAAGCUGCAGCUGCUUCCGCAUAGCUGCUGUGGUCAAAAAGGAGCCCAGAGUGACAGUUUUCCUUGACGGUCGCCGUUCUGUUUGUUGUAACUGAUCUGCAACAUUUUGGGAAAAUACAGUUCCAUUGUACCUGCCACCUUUCAGCUGUAGCCAGAGACCUUUAUCAAAAUGGGCUUGUUUCCACAGAACAGCAGAACGGUUGGGGGUUUGCAUGUACAGUUAACCAGCAUAAGACUCGUACUGGGAAAAUCCAGCUGGGAUGUGACACAGCUUAACUGAUAGCUUAAGGCAUCAGUAUUGGGACCAAAGGCUGGUCAGAUUUGUAUCAUUCUGAGGACCAAAUGAUGGGAACAAUAAAAUUGUUCAUGACAGUUGUUCUCAUUUUGCUGUCCAGAUGAAGACUCUUAAGAUGACAGAAGGUGAUUUUUCUGGUGAUCGAGGACUUCCGGGGUAAUGACAGUGAUGAAAUGCAGGGGACCUGGUAGGUUUCUUUUGGAGACUAACUGGGGGCUGCCUGGUGGGACAGAACAGCAUGUUUCCAAGGGCUGUGGCUGGUCAUAGCCAUGGGAUCUCCAACUGCAUGCAAGAGCAACCUGGAAAGACUUUGACAGCGCAGGUCAGUACAAUACCUGCAAGCUGCCACUCAGCUUUCCUAUAAUGUUUCAGGACCAGGGCUGGAAGCCUUCCAUGUGUCAACUUCAAUGUAGAUGGGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUUGCUCUGUCACCCAGGCUGCUGGAGUGCAGUGGCAUGAUCUCGGCUCAUGGCAACCUCUGCCUCCUGGGUUCAAGCGACUCUCCUACCUCAUCCUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAGGUGCCCACCAUCACACCCAGCUAAUUUUCUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGUUUUCACCAUGUUGGCUAGAUGGGUCUCGAACUUCUGACCUCGGGUGAUCCGCCCGACUCGGCCUCCCCUUCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCGCUCCUGGCCAGUUUAGUUUUCACGCUAAGCUUUUUGUUCUGCAGGUUGCCCCCAAGUUUCCUGGCAGUGUGUGAUACUGAGGAGGUGAGCUUGUUUCUGGAGCUGUGCUUUAAGAUUCAUGUUACAUGUAAAGCUGUCCUCAUUUGUGACUAUGGACCUAUGGAGUUGGGACAAUCUCUAUGGGAAGCAGAAGGCAAGGACCCCGGUCAUUUUAGGUAGAAACAACAGCAUGCUAAUGCAAAAAAUUAUGCAGUGUGCUACUGAACUUCAGAGGUGAUCAAUAAAAGAAGAAUAAAAAGACUAAUAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-548.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -575.61

Frequency: 0.0000

Diversity: 445.9

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((.(.((((....))))).)))))))).....((((..(((((.((.(((((.(((...(((((....((........(((((.......))))).......))....)))))...))).))))))).)))))((((((((((((.(.(((..((((((.((((.((((((((((.(((((....)))))...((..((((.(((.(((((...((((((((.(((((.(..(((.((((((((..(((((((......((((((((.(((.......))).))))))))....)))).)))((((((((..((((((((.(((((((((((((((((((((((((.......)))))))(((((((((...((((.((((((...........((((..((....)).))))...........)))))).)))))))).))))).)))))))))))((..((((.((.......)).))))..))...))).))).).))))))))((....))(((.((((.((((((.((((((.(((...))))))))).(((....))))))))))))).)))....)))))))).((((.....((((((((((((.....((((...)))))))))))))))).....))))....((((..((((..(((.((((((((....)))))).)).))).)))))))).))))))))..)))........).)))))..((((((.(((((((...))))))).))))))))))))))(((((((.((....((.((..((((.((((.(.((...(((((((((..((((((.(((.((((((.....((((.(((((........((.((((((((((.........))))))..)))).))..((((((((((..........))))...))))))(((((((.......(((.((......)).))))))))))...................((((((((...))))))))..))))).))))...)))))))))...)))))))))).)))))..)).).))))..))))..)).))..)).))))))).........((((((((((((......(((....)))......)))))))..............((((((.((.(((((....))))).)).)))))).(((((..........)))))((((((...)))))))))))))))).)))))))..)))))))))))...(((..((((....))))...)))((((((((......)))))))).......(((((((..((......))..))).))))).))))..))))))..))).).))))).((((((((...))))).)))(((((((((((..................)))))).)))))((((((((((((...))).)))))))))..((.....)).))).))))(((((((((..(.((...((..((((((((...(((........)))))))))))..))..)).).))))))))).......))))....................

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((.(.((((....))))).))))))))..,.,((((..(((((.(,{(((((.(((...(((((....((........(((((.......))))).......))....)))))...))).))))))).)))))(((((((.((({,{,(((|.{,{||||,,{,,.(((((((((.{(((,...,|}}}},,.,{..((((.(((.(((((,..{(((((((,(((((,{,,(((.((((((((..(((((((...{,.((((((((.(({.......))).))))))))}...)))).)))((((((({||{(((((({.{((((({|||{{{((({{{((((((.......))))))},{{((((({,..{{((|{((({{,,,,.,{{.{,({({,,((,{,.}|,||||,,.........}}))))}}}}}}))}.}}))),)))}))))))){{,,{{((.{{,.,,,,,)}.}}}}..},...))).})).).)))))},}||,}}})|(((.((((.((((({.((((((.(((...))))))))).{{{....}},}))))))))).))),...}))))))).((((.....(((((((((({{...,{((((...)))))))))))))))).}...))))....((((.,(({{..(((.((((((((....))))))},).))),))}})))).))))))))..}}}...,....}.))}}}..((((((.(((((({...})))))).))))))}||}|}||(((((((,((,...((.((..((((.((((,(,((.,.{{{{|||||.,||{{{{.{{,,((((({.,...((((.{{{((,{{{.,,.((.((((((((((.,......,))))))..)))).)}..{||||||||{.....,.,,.}})},,,|||||}|{{|||||{{{{.{{,{..,.....})),})})))}}},.................|,((((((({...|))))))),,|||||.}})},,,}}}}}}||},..}}}}}))))).)))))}.)).).))),},)))),.)).)),.,}})))}}}),,.......{(((((((((((......(((....)))......)))))))).............((((((.((.(((((....))))).)).)))))).{((((..,.......))))|((((((...))))))}}}})))))).)}})))}..,}))))))))}...(((..((((....)))).},)))((((((((......)))))))).,,,}}}|||{|||,.||}}}||||||||||,,|||{{|,,,}}))))}},}))}}}})}}),.,{||||||,..)}}}},.,,{{(({({{{{{.,,...},....,,,,,.)))))).)})},((((((((({({...}}).)))))))))..||,.,.,)).))).))))(((((((({.{{.{{...((..(((((((,..,(((........)))))))))))..))..}}}).))))))))).......}}})....................