Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG12:19
Sequence Length
1087 nt
GC Content
0.5474
CUUUCUCCCCGCCGCAUUCCCGGUGUCGACUUACUAGCUGCAAGCCUCUGCCUGCCUUCCUGCGCGCCGUUCCCCGCUAGUCGCUGCUGCUGGCGCGCACUCGCCGGGUUUUUCCUCCCACGGCCUCGAGAUGGUGGUGAAUGUGGCACGGAGGAGCCGGGCCUUCCAACCCGGUGGGCCCGAGCUCCGAAAGGCCCCCUCGGCAGUGAGAGGGGCGGGAGCCCGCGGGGGCCGCGCCCUUCUCUCGCUUCGGACUGCGCAACGCUGCGCUCUGGGCUGACAGGUGAGUGUUGCAGGCAGGCGGCCGGGUUUACGGAAGGGGUGGGGGUUUGGGAACCGGUCUCCUGGGGGAUGCGGGGAUGAAUCCCUGGGCCUGAAGUGUCUUAAUUCAGGGGGAGGCCGCAUGCUGGUGUCAGGAUGGCCUCCAGUUGAAUCUGUGACAUUUACCAGCUAGGUGAUUUUGGGACUGGUGACUACGCGCGAGACCUCUGGAGGUCGCCCUGGUAGACACGGUUUUCAGAAGGACGGGUUUUAGGCAUUCAGACCCUUGCGUGCAUCCCAGCUUGUUGCUUUCAGCCUCGCUAAGUGACUAAGCGACCUUCAGGAAGUAACUUAAUCGGUCUAAACCUCUUACCUGUAAUAGGCGGAUAAAACGGUCCCAUCAAGACUGAGAAAAAGCACACCAGCUAUUGGCACAGCGUGGGCAGUGGGGCCUACAGGAUGACUGACUUAGUCUACAGAGAUCCCGGCGUACUUAAGCAGAUGAAGACUCUUAAGAUGACAGAAGGUGAUUUUUCUGGUGAUCGAGGACUUCCGGGGUAAUGACAGUGAUGAAAUGCAGGGGACCUGGUUGCCCCCAAGUUUCCUGGCAGUGUGUGAUACUGAGGAGAUUCAUGUUACAUGUAAAGCUGUCCUCAUUUGUGACUAUGGACCUAUGGAGUUGGGACAAUCUCUAUGGGAAGCAGAAGGCAAGGACCCCGGUCAUUUUAGGUAGAAACAACAGCAUGCUAAUGCAAAAAAUUAUGCAGUGUGCUACUGAACUUCAGAGGUGAUCAAUAAAAGAAGAAUAAAAAGACUAAUAAAAGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-412.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -432.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 375.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((.(.((((.((((......))))......((((((((((((((((((((((.(((.((((.((((((.(((..((((..((((......))))(((........))).))))..)))..)))))).)))))))))).)))((((((((((((.((.....)).))))))).))))).....(((.....))).(.((((((((((.(.((((....))))).)))))))))).)((........))((((((((.(((.(((......))))))))))))))))))))))))..))))))..))))).))))))).(((((((((((((((.....(((.(.((((((....)))))).)))).(((((((...((((((..(((((((..((.(((....))).)))))))))..))))))....)))))))(((((...(((((((((.(((((.(((......))).))...))).)))))))))))))))))).))))))))))).....(((((((.((((.((((.(((((((((.((((.(.(((((((((((..(((...)))))))))).)))).(((((..((((((.......((((((...(((......((((.....))))......(((((.......)))))(((((((...((((.(((........)))((((((......)))))).((((..(((..........)))..))))...(((.((((((.((.......)))))))))))......)))).))))))))))))))))..))))))))))).......).))))..)))))))))..)))).))))....((((((((..((((((...))))))))))))))(((((((((..................)))))).)))..((((((((((((...))).)))))))))..((.....)).))))))).(((((((((..(.((...((..((((((((...(((........)))))))))))..))..)).).)))))))))......)))))......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{((({((((((({{,,{(({((({,.,.,...,..||,|.{{{{{{((((((((((,,,(((((((((,,,.{,((.,.,,|,.||,|,,)))))}}}..,|||(((.....,..,||{|,||{.,,,..,))),)}),,,},|||..},,((((((((((((.((.....)).))))))).)))))...,||||,,,,|}|}|{{((((((((((.(.((((....))))).)))))))))).}||,.,,,...}}((((((((.(((.(((......))))))))))))))))))))))))|,)))},}.}))}|)|))|||||{(((((((((((((((,({{{((({(.(((({,,,,,|}|}}|,||||,{({((((...((((({..(((((((,.{(.(((....))).)))))))))..}))))),||,|}}}|||(((((...(((((((((.(((((.(((......))).))...))).)))))))))))))))))),)))}}))))},,|||||||||||}||{|,|||{.|||{{{{{{,||||}}.((({(((((((..(({...))}})))))).}))).{{{{,..|||{||..|,,.,{{{(({,..}||.,,,,|{{{,..,}})}||||.....{||||,,,,.,|||||{{....{{{...,|,}}}.,,,}}.}})}||||||.,}},})))}}|,||,,|,|||.|,|}}}|,.{{{{{{((((,,({{.((((({.{{.......}}))}}}|||,,{{{{{||.,,,))))))),,}))}})),)))))))))))...,.,,|,}}}}..}}})))))),|)|)}.)}}}.,,,,|{{||||..((((((,,,|||}|||}}}}}))|||||||||},,,,,})))}}}},.,,|||}}}.}|}..((((((((({({...}}).)))))))))..{|.....)).,}}}}})}(((((((({.{{.{{...{{..(((((((,..{(((........)))))))))))..}}..}}}).)))))))))......,}}}}.........,{,......}},.
Back