Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG12:22
Sequence Length
1103 nt
GC Content
0.5458
CUUUCUCCCCGCCGCAUUCCCGGUGUCGACUUACUAGCUGCAAGCCUCUGCCUGCCUUCCUGCGCGCCGUUCCCCGCUAGUCGCUGCUGCUGGCGCGCACUCGCCGGGUUUUUCCUCCCACGGCCUCGAGAUGGUGGUGAAUGUGGCACGGAGGAGCCGGGCCUUCCAACCCGGUGGGCCCGAGCUCCGAAAGGCCCCCUCGGCAGUGAGAGGGGCGGGAGCCCGCGGGGGCCGCGCCCUUCUCUCGCUUCGGACUGCGCAACGCUGCGCUCUGGGCUGACAGGUGAGUGUUGCAGGCAGGCGGCCGGGUUUACGGAAGGGGUGGGGGUUUGGGAACCGGUCUCCUGGGGGAUGCGGGGAUGAAUCCCUGGGCCUGAAGUGUCUUAAUUCAGGGGGAGGCCGCAUGCUGGUGUCAGGAUGGCCUCCAGUUGAAUCUGUGACAUUUACCAGCUAGGUGAUUUUGGGACUGGUGACUACGCGCGAGACCUCUGGAGGUCGCCCUGGUAGACACGGUUUUCAGAAGGACGGGUUUUAGGCAUUCAGACCCUUGCGUGCAUCCCAGCUUGUUGCUUUCAGCCUCGCUAAGUGACUAAGCGACCUUCAGGAAGUAACUUAAUCGGUCUAAACCUCUUACCUGUAAUAGGCGGAUAAAACGGUCCCAUCAAGACUGAGAAAAAGCACACCAGCUAUUGGCACAGCGUGGGCAGUGGGGCCUACAGGAUGACUGACUUAGUCUACAGAGAUCCCGGCGUACUUAAGCAGGUAGUAAUGAUGGACAGAUGAAGACUCUUAAGAUGACAGAAGGUGAUUUUUCUGGUGAUCGAGGACUUCCGGGGUAAUGACAGUGAUGAAAUGCAGGGGACCUGGUUGCCCCCAAGUUUCCUGGCAGUGUGUGAUACUGAGGAGAUUCAUGUUACAUGUAAAGCUGUCCUCAUUUGUGACUAUGGACCUAUGGAGUUGGGACAAUCUCUAUGGGAAGCAGAAGGCAAGGACCCCGGUCAUUUUAGGUAGAAACAACAGCAUGCUAAUGCAAAAAAUUAUGCAGUGUGCUACUGAACUUCAGAGGUGAUCAAUAAAAGAAGAAUAAAAAGACUAAUAAAAGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-417.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -438.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 305.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((.(.((((.((((......))))......((((((((((((((((((((((.(((.((((.((((((.(((..((((..((((......))))(((........))).))))..)))..)))))).)))))))))).)))((((((((((((.((.....)).))))))).))))).....(((.....))).(.((((((((((.(.((((....))))).)))))))))).)((........))((((((((.(((.(((......))))))))))))))))))))))))..))))))..))))).))))))).(((((((((((((((.....(((.(.((((((....)))))).)))).(((((((...((((((..(((((((..((.(((....))).)))))))))..))))))....)))))))(((((...(((((((((.(((((.(((......))).))...))).)))))))))))))))))).))))))))))).....(((((((.((((.((((.(((((((((.((((.(.(((((((((((..(((...)))))))))).)))).(((((..((((((..(((.(((.(((((......((((((((..((.((.(.......((((((((((.(.(((.(..(((((......))).))..).)))).))....))))))))....((((..(((..........)))..))))).)).)).....))))))))......))))).))).))).(((....(((.((((((((....)))))).)).)))))).))))))))))).......).))))..)))))))))..)))).))))....((((((((..((((((...))))))))))))))(((((((((..................)))))).)))..((((((((((((...))).)))))))))..((.....)).))))))).(((((((((..(.((...((..((((((((...(((........)))))))))))..))..)).).)))))))))......))))).....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{((({(((({((,,.,,(({(({{....,,,.,..||,|.{{{{{{((((((((((,,,(((((((((,,,.{,((,,.,,|,.||{|,,||||}}}|..,|||(((....,,..,||{{,||{.,,....))),)}),,,|,|||..},,((((((((((((.((.....)).))))))).))))),..,}|||,.,,,)}}|{,((((((((((.(.((((....))))).)))))))))).}||,..,,...}}((((((((.(((.(((......)))))))))))))))))))))))),,)))}}}.}))}})}))}}|||{(((((((((((((((,{{,,(((,(.(((({,.,.,}))))},}|||,{((((((.,.((((((..(((((((,.,(.(((....))).)))))))))..)))))).||.)))))}|(((((...(((((((((.(((((.(((......))).))...))).)))))))))))))))))).)))))))))},,{{{|{{|{{{|,((((.|(((.(((((((((.((((,|.(((((((((((..(((...)))))))))).)))).(((({..((((((..(({.(((.(((((......((((((((..{(,(({(.......(((({{,{,.,{,(({,{..,.{((....,.}}}.,,.,}.,})}{||{|{.,}}}})))},|.{{,{,.||{.,.,,}}},.,,}.,))))},}).)}.}...))))))))......))))).))).}))..{({{..(((.((((((((....))))))},).)))}))}))))))})))).......,.))))..)))))))))..)))).))))....{(((((((..((((((...)))))))))))))}{{{{{{{||,,.,,},}}}}}}},,,,|||},}.,||..((((((((({({...}}).)))))))))..{|,....)),}}}}}})}(((((((((.{(.{{...((..(((((((,..{(((........)))))))))))..))..))}).)))))))))......,}}}}.....................
Back