Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

SNHG12:28

Sequence Length

759 nt

GC Content

0.4414

GCCCUUAUCGAAGCUGCAGCUGCUUCCGCAUAGCUGCUGUGGUCAAAAAGGAGCCCAGAGUGACAGUUUUCCUUGACGGUCGCCGUUCUGUUUGUUGUAACUGAUCUGCAACAUUUUGGGAAAAUACAGUUCCAUUGUACCUGCCACCUUUCAGCUGUAGCCAGAGACCUUUAUCAAAAUGGGCUUGUUUCCACAGAACAGCAGAACGGUUGGGGGUUUGCAUGUACAGUUAACCAGCAUAAGACUCGUACUGGGAAAAUCCAGCUGGGAUGUGACACAGCUUAACUGAUAGCUUAAGGCAUCAGUAUUGGGACCAAAGGCUGGUCAGAUUUGUAUCAUUCUGAGGACCAAAUGAUGGGAACAAUAAAAUUGUUCAUGACAGUUGUUCUCAUUUUGCUGUCCAGAUGAAGACUCUUAAGAUGACAGAAGGUGAUUUUUCUGGUGAUCGAGGACUUCCGGGGUAAUGACAGUGAUGAAAUGCAGGGGACCUGGUUGCCCCCAAGUUUCCUGGCAGUGUGUGAUACUGAGGAGGUGAGCUUGUUUCUGGAGCUGUGCUUUAAGAUUCAUGUUACAUGUAAAGCUGUCCUCAUUUGUGACUAUGGACCUAUGGAGUUGGGACAAUCUCUAUGGGAAGCAGAAGGCAAGGACCCCGGUCAUUUUAGGUAGAAACAACAGCAUGCUAAUGCAAAAAAUUAUGCAGUGUGCUACUGAACUUCAGAGGUGAUCAAUAAAAGAAGAAUAAAAAGACUAAUAAAAGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-218.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -235

Frequency: 0.0000

Diversity: 211.38

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((......((((((((.(((.......))).))))))))....)))).(((.((((((((.....(((((.......(((.((((((((((((((.......))))))........(((.((((((((((....((..((((((((((((((((.(((((((..(((((((....(((((..((......((((((((....((((((((..(((.((.((((((((...........)))).)))))).)))..))))))))((((.((((.((((((.((((((.(((...))))))))).(((....))))))))))))).)))).(((((((.((.....))))))))).(((((((...)))))))......))))))))......)).)))))))))))).))))...(((.((((((((....)))))).)).)))..((....))..)))....)))))..)))....((((((((.(((......))).)))))))).((((((...))))))..)))))).))..))...)))))))))).)))....(((((((((((..................)))))).)))))((((((((((((...))).))))))))))))))))))))))))).....)))))))).))).........((((((((...(((........))))))))))).((((...)))).........................................

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{((((...{,.((((((((.(((.......))).)))))))),...}))).|{(.((((((((.,...{{{{{|,,,,,,(((.((((((((((((((.......)))))),.,,{{{{{,..{(((({((({..,.((..{((((({((({(((((.{{{,({({{{{,,,{{....,}}||,,||||}....},)}))),||}{|||{|{{,,{{{,{{.((((((((..,,,,.,,,,|}||,}}}|||,}}}..)))))}}}{(((.((((.((((((.((((((.(((...))))))))).{((....))})))))))))).)))},,.{({{,{{{.((((.,,..((((((((((({...,|((({...}))))))))))))))),},,,)))),))})}||.|{({{..(((.((((((((....))))))},).))),))}|||||{,,((({,{.{{{,,..,....,,(((((({(.{{{....,,))).)))))))),)}.,,}}}.)))))},))))))),)),,))..,)))))))))),,,,....{((((((((((.,.............,,.)))))).))))}((((((((({({...})).)))))))))}))))))))))}}})),,...)))))))).))}.....,,..((((((({..{(((........))))))))))).,||..,||},},,}}........................,{{......,},.