Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

SNHG12:6

Sequence Length

739 nt

GC Content

0.5413

CCCGGUGUCGACUUACUAGCUGCAAGCCUCUGCCUGCCUUCCUGCGCGCCGUUCCCCGCUAGUCGCUGCUGCUGGCGCGCACUCGCCGGGUUUUUCCUCCCACGGCCUCGAGAUGGUGGUGAAUGUGGCACGGAGGAGCCGGGCCUUCCAACCCGGUGGGCCCGAGCUCCGAAAGGCCCCCUCGGCAGUGAGAGGGGCGGGAGCCCGCGGGGGCCGCGCCCUUCUCUCGCUUCGGACUGCGCAACGCUGCGCUCUGGGCUGACAGGCGGAUAAAACGGUCCCAUCAAGACUGAGAAAAAGCACACCAGCUAUUGGCACAGCGUGGGCAGUGGGGCCUACAGGAUGACUGACUUAGUCUACAGAGAUCCCGGCGUACUUAAGCAGAUGAAGACUCUUAAGAUGACAGAAGGUGAUUUUUCUGGUGAUCGAGGACUUCCGGGGUAAUGACAGUGAUGAAAUGCAGGGGACCUGGUUGCCCCCAAGUUUCCUGGCAGUGUGUGAUACUGAGGAGGUGAGCUUGUUUCUGGAGCUGUGCUUUAAGAUUCAUGUUACAUGUAAAGCUGUCCUCAUUUGUGACUAUGGACCUAUGGAGUUGGGACAAUCUCUAUGGGAAGCAGAAGGCAAGGACCCCGGUCAUUUUAGGUAGAAACAACAGCAUGCUAAUGCAAAAAAUUAUGCAGUGUGCUACUGAACUUCAGAGGUGAUCAAUAAAAGAAGAAUAAAAAGACUAAUAAAAGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-272 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -285.9

Frequency: 0.0000

Diversity: 190.5

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((((......))))...((...(((((((.((((((...(((((((((......((.(((....))))))))))))))..((((((((((((((((((((.(((.......))).)))..........))))))(((((((((.((.....)).))))))).))(((...(((((((.((((.(((((((((((((.(.((((....))))).)))))..))))))))))))(((((.((.(((((.(((...(((((....((........(((((.......))))).......))....)))))...))).))))))).))))))))))))...))).(((((...)))))....)))).)))))))..((((((.((.......))))))))....(((((((....)))))))(((((((.((((((((..((((.(.(((.........((((((((((.(((......))).))))))).)))...))).)))))..))))))...((((((((((((((...)))).....(((((((((((..................)))))).)))))((((((((((((...))).)))))))))...))))).)))))...)))))))))...))))))...((..((((((((...(((........)))))))))))..)).....)))))))...))................................

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,({,{{{..{{{.,{.,,{{...((((((({(((((({,.(((((((((,...,.((.,.,.}}.}|,},})))))))}..(((((((,{((((({{((((,(((.,.....))),)))..,|,}}...))}||((((((((((.((.....)).))))))).)))||...(((((((.{(((.(((((((((((((.(.((((....))))).))))),.))))))))))))(((((.(,{(((((.(((...(((((....((........(((((.......))))).......))....)))))...))).))))))).))))))))))))...|},.((((|...}})))..,.}))).)))))))..,,,,,(|((,,{{.{,|||||,,|{{.{(((((((....)))))))|}.})},}}||||{{{||((({,{.{((.,.......{{((((((((.(((......))).)))))))},)},|||}}.}))))|.}})))},{{({(|..{{{{||||,..))))},.,,,|||{||||||,,,..,},.}}}.}}}},)))}}}.}}},.((((((((({({...}}).)))))))))..,}})}))))},}}}},}}}}||||{{,,}|}||...{{..(((((((,..{(((........)))))))))))..}}..,,,)}))))),,.}....................{{,......,,,.