Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

SNHG12:8

Sequence Length

751 nt

GC Content

0.5419

CCGGUGUCGACUUACUAGCUGCAAGCCUCUGCCUGCCUUCCUGCGCGCCGUUCCCCGCUAGUCGCUGCUGCUGGCGCGCACUCGCCGGGUUUUUCCUCCCACGGCCUCGAGAUGGUGGUGAAUGUGGCACGGAGGAGCCGGGCCUUCCAACCCGGUGGGCCCGAGCUCCGAAAGGCCCCCUCGGCAGUGAGAGGGGCGGGAGCCCGCGGGGGCCGCGCCCUUCUCUCGCUUCGGACUGCGCAACGCUGCGCUCUGGGCUGACAGAUGAAGACUCUUAAGAUGACAGAAGGUGAUUUUUCUGGUGAUCGAGGACUUCCGGGGUAAUGACAGUGAUGAAAUGCAGGGGACCUGGUAGGUUUCUUUUGGAGACUAACUGGGGGCUGCCUGGUGGGACAGAACAGCAUGUUUCCAAGGGCUGUGGCUGGUCAUAGCCAUGGGAUCUCCAACUGCAUGCAAGAGCAACCUGGAAAGACUUUGACAGCGCAGGUUGCCCCCAAGUUUCCUGGCAGUGUGUGAUACUGAGGAGGUGAGCUUGUUUCUGGAGCUGUGCUUUAAGAUUCAUGUUACAUGUAAAGCUGUCCUCAUUUGUGACUAUGGACCUAUGGAGUUGGGACAAUCUCUAUGGGAAGCAGAAGGCAAGGACCCCGGUCAUUUUAGGUAGAAACAACAGCAUGCUAAUGCAAAAAAUUAUGCAGUGUGCUACUGAACUUCAGAGGUGAUCAAUAAAAGAAGAAUAAAAAGACUAAUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-279.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -292.84

Frequency: 0.0000

Diversity: 232.59

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.(((..(((.((..((((.....((((((((((.....(((.(((..(((((((..(((((((...(((((.((((.((((((((........)))...(((.......)))))))).)))))).))).((((((((((((.((.....)).))))))).))))).....(((((.((((.(((((((((((((.(.((((....))))).)))))..))))))))))))...(((((....)))))((((......)))).((((..((((..(((.((((((((....)))))).)).))).)))))))).))))).....))))))).....)).)))))((((((.(((((((...))))))).))))))))))))..)))))).))))...(((((((((((..(((((((......))))))).))))).........))))))....((((((((.................))))))))...((((((((((..((((((...))))))...))).)))))))..((((((((...))))).)))(((((((((((..................)))))).)))))((((((((((((...))).)))))))))..))))..)).)))))).))))(((((((..(.((...((..((((((((...(((........)))))))))))..))..)).).)))))))................................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{((,(((..({{.({.{((({..{{{{{{(((((((((((((((((((((((((((,.{(((((((({{,,((((......))))((({{,,{{,.,{(((.(((.......))).)))...|,||,..,,.((((((((((((.((.....)).))))))).))))),,,}})))},..|||}|||((((((((((.(.((((....))))).)))))))))),|{{|{({{{..(((((....)))))||||,,,...}}}}.,,,,.,{(,,..(((.((((((((....))))))},).)))})))))),,))))).,,,}.},))).,....}))})))),{{{|||})}||||,...(((((({...(((((((.((((({{{{{.{{|....{{,|||{((((..((((((({....,))))))).))))}..,{{,..,||,}}}....|||.,{||,,.....,,},.,.}}.))))).)))))))))))))).,|||||{{|||})))}),|{|||{,||||||,.{{{{||{|,..))))}..,.{{{{{{{{{{|,,....,..,.,.,,},.}))))).)))),((((((((({({...}}).)))))))))..})))}}))}}})})),))||(((((((.{{.{{...({..(((((((,..,(((........)))))))))))..))..}},).)))))))}}..............................