Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG15:8
Sequence Length
803 nt
GC Content
0.5467
GCGCGGCGUCAGUCUUGGCUGGCAGACCUGUACUCCGUACUCCGUACUUCGUAGUCGCAGCGGCGCGGUCUUCGGCAGUCUAGUCAUCCACCGCCAUCCUGGGCCCCACGUGUUGCCUGACCAUUCCUGAGCCCAGGUGGGAGCCGUGGCUGAGGUGACGGUCUCAAAGUGGAAGAGCUUACUGUCACAGCAACUCCUUUGCAAGAUGCCCCGGCCAGGAAUAGUUGCUGAACACCCCAGGCCUGCUGAGGUCCCUCCUUGAGUCUCAUGUUCAAGCAGUCUUUGUCCAUGAAACUGGGAGGCGACCGUGUUAGCUGCCAGUUCCUGACAGCCACCUCUCACCAGUGGCUUCACUCUGUGUCCCUGACCCAGCACAUGGCACAAGAGUGCCUGCCAUCCGUCAGUGUUUCUACAGCAGCAAUCCCAAGAUGCUGGAGCUAGAGGGGACCUGACCUGAGAGAAGAUACCUUCAGUGGCUGCCAGGCUGUUCCUUGGAACCUGUGCAGGGAUGAGGCCUGCCUGUGUUAAUACACCUAGUGAGGAGUGGAGCUGAAUUUGAAUGCAAGCCUUGGCACCUUAAUUGAGCAAGUUUGAAACCUCGCUUGUUGCCCUUCUGGAAGGAGUCAGGAAUUUCCAGUUCUGGGCCUGGGCUGUGGGUCUGGCAGACAGACCUCUGGCCCUAGGUUUGGGUGCCAGGUUCUCUGCUUCCAGAAUGAGAAGCUUUGCUGUGCACCAGGACCUGGGCCCUUCUGGUAUCUCCUGAAUGAAAAACAAGGGAUAUUUAAUAAAUAUGGAUUUAAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-303 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -317.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 138.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((.(((.((((.(((((((..((((((((((((((...)))).........((((((((((((((...((((((..((((.(((((..(((.((((((((....(((.........)))....).))))))))))(((((((.((....)).)))).)))...))))).)).)).)))))).(((((((((((..((..(.....)..)).))))...))))))).........(((((....)))))((((((..(((.(((((..((((.....))))..))))).))))))))).))))))))).)))))(((..((((.(((((((.(((((...(((((..(((((((((.((.((........)).))))).))))))...)))))..(((((.((((((.((((((((.((....))))))...))).).))))))))))).)))))((((....)))).))))))).)))))))......)))....)))))))..))(((....)))((((....))))))))).)))).))).)))).((((((((.(((((((.(((.((..(((((.(.(((((.....(((.((((.((.((.....)))).)))).))))))))))))))..))))).)))))..(((((((.....)))))))..(((((.((((((.((((((((.......(((((((...)).)))))....))).))))).))))))))))).....((((((.(((............))))))))).........)).)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((.(((.((((.((((((({.((((((({{{{{((,.{|,||..,}.}}}.(((((,((((((((...((((((..{(((.(((((..(((.(((((((,....(((,{....,},})}....).))))))))))(((((((.((....)).)))).)))...))))).)).)}.)))))).(((((((((((..((..(.....}..)).))),..})))))))...,,,.,,({{{{.,,,})))}((((((..(((.(((((..((((.....))))..))))).))))))))).))))))))}.)))))(((..((((.((((((({(((((...(((((..(((((((((,({.((........}}.)))))}})))))...)))))..(((((.((((((,(,,(((({,((....)))))))..),),),))})))))))).)))))|{{(....}})).))))))).))))))).,{,,{|}|....})}))))},,,|||.}}})),((((....))))}}))).)))).))).)))).((((((((.({.,({{,{||.,,......,{((((((..(....},.))))))).{((({..,.,}}}.,{(((((..,.((((....(((((,((((({.(((((((.....))))))).}))))).((((({.((((((((.,.....((((((,...,).)))))...,))).))))).})))))))))))..)))).|..)))))}........}))))}|||{{,....,,,,)).)))))))).
Back