Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG15:9
Sequence Length
731 nt
GC Content
0.5445
GGCGUCAGUCUUGGCUGGCAGACCUGUACUCCGUACUCCGUACUUCGUAGUCGCAGCGGCGCGGUCUUCGGCAGUCUAGUCAUCCACCGCCAUCCUGGGCCCCACGUGUUGCCUGACCAUUCCUGAGCCCAGGUGGGAGCCGUGGCUGAGGUGACGGUCUCAAAGUGGAAGAGCUUACUGUCACAGCAACUCCUUUGCAAGAUGCCCCGUGUCCAUGAAACUGGGAGGCGACCGUGUUAGCUGCCAGUUCCUGACAGCCACCUCUCACCAGUGGCUUCACUCUGUGUCCCUGACCCAGCACAUGGCACAAGAGUGCCUGCCAUCCGUCAGUGUUUCUACAGCAGCAAUCCCAAGAUGCUGGAGCUAGAGGGGACCUGACCUGAGAGAAGAUACCUUCAGUGGCUGCCAGGCUGUUCCUUGGAACCUGUGCAGGGAUGAGGCCUGCCUGUGUUAAUACACCUAGUGAGGAGUGGAGCUGAAUUUGAAUGCAAGCCUUGGCACCUUAAUUGAGCAAGUUUGAAACCUCGCUUGUUGCCCUUCUGGAAGGAGUCAGGAAUUUCCAGUUCUGGGCCUGGGCUGUGGGUCUGGCAGACAGACCUCUGGCCCUAGGUUUGGGUGCCAGGUUCUCUGCUUCCAGAAUGAGAAGCUUUGCUGUGCACCAGGACCUGGGCCCUUCUGGUAUCUCCUGAAUGAAAAACAAGGGAUAUUUAAUAAAUAUGGAUUUAAAUAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-272.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -285.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 133.9
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((....((((.(((......((((((..(((((.((((........((((((((((((((...((((((..((((.(((((..(((.((((((((....(((.........)))....).))))))))))(((((((.((....)).)))).)))...))))).)).)).))))))...((((.....)))).....(((((..((.......))..)).)))))))))))).)))))(((...))).(((((((.(((((...(((((..(((((((((.((.((........)).))))).))))))...)))))..(((((.((((((.((((((((.((....))))))...))).).))))))))))).)))))((((....)))).))))))).((((((..((((((.(.....).))))))...))))))...((((....))))..)))).))))))))).))........))).))))))))).)).......(((((((..(....)..))))))).(((((..........((((((....((((....((((((((((((.(((((((.....))))))).)))))).((((((.((((((((.......(((((((...)).)))))....))).))))).))))))))))))..))))....)))))).........)))))((((((((...........)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,{((({,,,,{(((,(((..{,,,((((((,.((({(.{(({..,.,,..(((((,((((((((...((((((..{(((.(((((..(((.(((((((,....(((,{....,},})}....).))))))))))(((((((.((....)).)))).)))...))))).)).)}.))))))...((((.....)))).....(((((,,{(,......})..)).))))))))))),.)))))(((..,|||.((((((({(((((...(((((..(((((((((,({.((........}}.)))))}})))))...)))))..(((((.((((((,(,,(((({,((....)))))))..),),),))})))))))).)))))|{{(....}})).))))))).||||||,.((((((.|.....}.))))))..,))}))),,.((((....))))..)))},)))})))}),}..,,,,|..|}|.}}}}}}})).}}.......(((((((..(....}..))))))).(((({.,........((((((..,.((((....((((({((((((.(((((((.....))))))).}))))),((((({.((((((((.,.....((((((,...,).)))))...,))).))))).})))))))))))..)))).,..))))))........,)))))(((((({{.......,.,,))))))}}.
Back