Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG16:13
Sequence Length
3607 nt
GC Content
0.4513
GUCGGCCGCGUGGCUGGAAGACAUGGCCACUCCAGUCGGUGUUGAGCACGGCGAGCAGUCUCAGGCCUUUAGUGAUGAUGGUAAGGCUGCCUGGGUGGGAAAACGGGGUCUUCCUUGACACGACACUAACAUACUUGGCUUCCCUUCCUCAGAGACGAAGUGGUGACGAUAAUCUCGGUUUCUCCCUCAUAGGGUGGUUAGGAGGGUUAAAAGUACUGGAUGAGAAAAUGCUUUCCAAACGUUGAGAAAAUGUUACUAUGUGAAGGGAGAGAGCUCAAGCCCGUCCUCGGCGUCAUAGGGCCGGCUUCUGCGGGGGAGAGCGCCUAACAACCUGGGCAGCCCCGUGCGCCUCCGCCGCGCGUGUGCUGAGCGUCAUGCCCAGGGGUCUUCGGUGCCCGCGCACGGGCAGACUCUGACGAUGGUGGUUCUUAAUUCAGCAUCAGGAGUGUUAACGUGUGAAGACGUGAUUCCGCUUGGAGUGUCUUGAGGACGGCCCCAAUCGGUAGUUCAUAUUUAGCUUUACAGAUAGGAGUCAAUAGGAUUGUAAACUUCUGGAAAGCCGUAGUUUUAACAACGAGCCUUUUUUCCUCCCCCAGAGGCCUUUCUUUGUUUGGCAUCUGCAGAGACGGUGAAAAGCAGAGCUCCAGGUUGAAGGAUCAGAGUAAUAGAUGGAGCCCUUAACAUGAGUAAGAGUGGGUGCAGGCAGGGCCUGAGUGGUCACUAGAAAUGAGAAAGCACAGUUGGUGCCAUCACAUACAUUCACCUCCUGCUUUAUUCUGAAGUUCAAGUAUGAGAAUACGUGUUGACAUACAAGCCAGCUAUGGUAAGAAAUUACUCAAAAUUCAGAAUGCUAAUUAUUUUAAUGAUAAAAAUGAGUAGCGUCUUUGCCCGUGUGAUUUGGGGCCACUAGGUGUCAUUGUAACCAGCGUGGAUCCUCGUUAGGGCAUGCAGGGAUGAAAGAGACAUGGCAAAUGAAUUUUGGAUCGCUAGGAUUUAGGAAUCUUUGUUAUUGGCUGAGCUGAGGAUGAUUUAAAGUUAUCCCUGUCUGAAAUGGUAUCUUUUGUGAGGAGGUCUGACUUGCUGAGGCUCAGCUGUUUAAUACAAAUCUGGAGAAUAAACCUUAAGGUGGUUUCUGUUAGAAUGAAGCCUGUUAUCCUUCUCUUUUAGAUUAAAGGUGGUGGCUGUGGCCUUGAAAACAGUCAUGUGAAAACUCAUCACCUUAAGGUGUUAAGUGUAAGGAUCUUCAUGAUGAAAUUUCUGUAAAUGGUGCAGUCAGCCUCAGUUUCCAAAGCCGGAAAAGGAUCCUCUAGUAGCCACGGUGUGGCAGCUGCUCUGAACCAGGACCUGGACCCGGACCCAAAGUGCCAUGUCUUUAAUGUUAGCUCCCAGCGAUGCCAGAUGGGAUCAGCACAGCCCUGCCUCUGCUGCUAAUUGUUCCUCUAAAGUAAUCGCCAUGCGUUCUUUGGGCUUCAUCUUUAAAGGAAUGAAGCAACUGAGAUUAUUCUGGAAAACCUUUUGGCAGUUAGUGAAAUUAGAGUACAACUAAGAACAUUUUCAGACCUCCACUGUGGAUGACCUGGGUAUAAUCUCACAAAUCGAUGGGACUGCAAGGAUUGUAAACUGAAAUGAACAUGAUUAUACUCUGUUGGAAGAGCCUAAGAGGAAACUGAUGCCAUGAGUUUCAGAGAGUAAUGCUUAACCCCAGUUACACAGGAUGCCGUCUUGUGUUUCCUCUUGUUUAGUUACCCACUACAGUGAUUUUGUGAUCUGCUAAUGGGUUGCCACCCACAACCAUUGCUUUAGCACUUUUACUUCAAAUCAAUGAAGGAUUGAUAAAAGUUCUCCUGGUGUCUCCGCAGAGUGCCUUCCAGGAACAGAUCUUUGCAUAGAAUAUCAGUGGUUUCCUUUUUUGUUUCAAAUAGUGGUCAGAAAAUACCCAGUGUUGACUCACCAAGGCAAUCAGCUUCCUUUUUCCCUUUUUUUGUUUUUUUUUUAACAUUUUAUAUUUUUGCUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUUUGAGACGGAGUUCCACUCUGUCGCCAGGCUGGAGUGAAGUGGUACAAUCUUGGCUCACUGCAACCUCCACCUCCCGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGGCUCAGCCUCCUGAGUGCUGGGACUACAGGCGCGUACCUUCUUUAGUAGAGACUGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGAUGGUCUCUAUCUCCUGACCUUGUGAUCUGCCUGCCUCAGCUUCCCAAAGUGCUGAGAUGACAGGUGUGAGCCAUCAGACCCAGCAUUUUUUUUUUUAAUUUAAAUUUAAAUUUUUUUUCAUUUUUUUGAGAGGUUUUUUUUGUUUUGUUUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUUUUGAGACAGUCUUGCUCUGUCACCCAGGCUGGGAGUGCAGUGGCAUGAUCUCUGCAACCUCUACCUCCCAGGUUCAAGCAAUUCUUGUGCCUCAGCCUCCCAAGUAACUGGGACUACAGGUGCACGCUACCACACCUGGCUGAUUUUUUUUGUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCAACCAUGUUGCCCAGGUUGGUCUCAAACUCCUGAGCUCAGGCAAUCCACCCGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUAGGAUUACAGGUGUGAGCCACCACACCCAGCUAUUUUUUCUUUCGUUUUUUAAUUUUAAAGUUGGGGGGGGGUCUCAAUUUGUUACCCUGGCUGGUCUCGAACUCCCGGACUUAAGCGAUCCUCUGGCUCCAAGCCCACUACCAGUCUCAGGUUUCUUUACUAAAAGAUCACUACCUUUUUUUCUCUUAUCUGCUGCCAUGUGAGAUGUGGCUUUCACCUUCCGCCAUGAUUGUGAGGCCUUCCCAGCCAUGUAGAACUGUAAGUCCAAUAAACCUCUUUUGUAAAUUAAAAAAAAAAAAUCACUAUUUAAGAUACUAGGAUGGAUUGUGACUGUUGAGGAGUACUUACAUAUCCUACAUUUGACUACAUUAUUUCCAAACCAAGUAUUCCAUCCAAAGGAACAUACUGCUAUCAUAGAGACCAAGGAGGGACUGUUUAAGGUUGCCAAGGUGAAGCGAGCUGAGAGGCUUUGUCCUCGUGCCAGUAACUCUGAAAUCUCUCUUAAUUCCUGCUGUCCAGGCAGCAGAAUGCCAUGGUUUCCCCAAGUAGGUAGCUGCUUUAGCAGUUAAAGCCCAAAUGUCUGUUCUGUUGAUCAGAGGUCUCUGAAUUUCUGAAGUGGUGUUUCGUUUCUGGUGACUGAGUUAAUCCUUUACAAUCCCUCUUGUAAAGUGUGCUAAUAGAAAGAAUCCACCUUUCAAAGCUGCAGAACCAGACCGUGCCCUAAAUUGACCAACGUAACUGAUGUGCCUCAGGAAGUCUCUUGCCAGCUGUCCCUGUGAAGACCCCCCUCCUCCCCCCCAGCUGCUGCCUUGCACACUGAAGCAUCUCAGACUGUGCAAAGCCGUGUAGUCAUCAAGACAGUAAAUCCCAGGGCUUGGUUAAGUGCUGUGUGAUAACUUGUUUGGAUGAGACUUAACUUAAAACCACUUACAAUAAACUUGGGAAACUACCGUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1066.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1139.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 1338.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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