Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG16:37
Sequence Length
3616 nt
GC Content
0.4513
CUUUUCGAGGUCGGCCGCGUGGCUGGAAGACAUGGCCACUCCAGUCGGUGUUGAGCACGGCGAGCAGUCUCAGGCCUUUAGUGAUGAUGGUAAGGCUGCCUGGGUGGGAAAACGGGGUCUUCCUUGACACGACACUAACAUACUUGGCUUCCCUUCCUCAGAGACGAAGUGGUGACGAUAAUCUCGGUUUCUCCCUCAUAGGGUGGUUAGGAGGGUUAAAAGUACUGGAUGAGAAAAUGCUUUCCAAACGUUGAGAAAAUGUUACUAUGUGAAGGGAGAGAGCUCAAGCCCGUCCUCGGCGUCAUAGGGCCGGCUUCUGCGGGGGAGAGCGCCUAACAACCUGGGCAGCCCCGUGCGCCUCCGCCGCGCGUGUGCUGAGCGUCAUGCCCAGGGGUCUUCGGUGCCCGCGCACGGGCAGACUCUGACGAUGGUGGUUCUUAAUUCAGCAUCAGGAGUGUUAACGUGUGAAGACGUGAUUCCGCUUGGAGUGUCUUGAGGACGGCCCCAAUCGGUAGUUCAUAUUUAGCUUUACAGAUAGGAGUCAAUAGGAUUGUAAACUUCUGGAAAGCCGUAGUUUUAACAACGAGCCUUUUUUCCUCCCCCAGAGGCCUUUCUUUGUUUGGCAUCUGCAGAGACGGUGAAAAGCAGAGCUCCAGGUUGAAGGAUCAGAGUAAUAGAUGGAGCCCUUAACAUGAGUAAGAGUGGGUGCAGGCAGGGCCUGAGUGGUCACUAGAAAUGAGAAAGCACAGUUGGUGCCAUCACAUACAUUCACCUCCUGCUUUAUUCUGAAGUUCAAGUAUGAGAAUACGUGUUGACAUACAAGCCAGCUAUGGUAAGAAAUUACUCAAAAUUCAGAAUGCUAAUUAUUUUAAUGAUAAAAAUGAGUAGCGUCUUUGCCCGUGUGAUUUGGGGCCACUAGGUGUCAUUGUAACCAGCGUGGAUCCUCGUUAGGGCAUGCAGGGAUGAAAGAGACAUGGCAAAUGAAUUUUGGAUCGCUAGGAUUUAGGAAUCUUUGUUAUUGGCUGAGCUGAGGAUGAUUUAAAGUUAUCCCUGUCUGAAAUGGUAUCUUUUGUGAGGAGGUCUGACUUGCUGAGGCUCAGCUGUUUAAUACAAAUCUGGAGAAUAAACCUUAAGGUGGUUUCUGUUAGAAUGAAGCCUGUUAUCCUUCUCUUUUAGAUUAAAGGUGGUGGCUGUGGCCUUGAAAACAGUCAUGUGAAAACUCAUCACCUUAAGGUGUUAAGUGUAAGGAUCUUCAUGAUGAAAUUUCUGUAAAUGGUGCAGUCAGCCUCAGUUUCCAAAGCCGGAAAAGGAUCCUCUAGUAGCCACGGUGUGGCAGCUGCUCUGAACCAGGACCUGGACCCGGACCCAAAGUGCCAUGUCUUUAAUGUUAGCUCCCAGCGAUGCCAGAUGGGAUCAGCACAGCCCUGCCUCUGCUGCUAAUUGUUCCUCUAAAGUAAUCGCCAUGCGUUCUUUGGGCUUCAUCUUUAAAGGAAUGAAGCAACUGAGAUUAUUCUGGAAAACCUUUUGGCAGUUAGUGAAAUUAGAGUACAACUAAGAACAUUUUCAGACCUCCACUGUGGAUGACCUGGGUAUAAUCUCACAAAUCGAUGGGACUGCAAGGAUUGUAAACUGAAAUGAACAUGAUUAUACUCUGUUGGAAGAGCCUAAGAGGAAACUGAUGCCAUGAGUUUCAGAGAGUAAUGCUUAACCCCAGUUACACAGGAUGCCGUCUUGUGUUUCCUCUUGUUUAGUUACCCACUACAGUGAUUUUGUGAUCUGCUAAUGGGUUGCCACCCACAACCAUUGCUUUAGCACUUUUACUUCAAAUCAAUGAAGGAUUGAUAAAAGUUCUCCUGGUGUCUCCGCAGAGUGCCUUCCAGGAACAGAUCUUUGCAUAGAAUAUCAGUGGUUUCCUUUUUUGUUUCAAAUAGUGGUCAGAAAAUACCCAGUGUUGACUCACCAAGGCAAUCAGCUUCCUUUUUCCCUUUUUUUGUUUUUUUUUUAACAUUUUAUAUUUUUGCUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUUUGAGACGGAGUUCCACUCUGUCGCCAGGCUGGAGUGAAGUGGUACAAUCUUGGCUCACUGCAACCUCCACCUCCCGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGGCUCAGCCUCCUGAGUGCUGGGACUACAGGCGCGUACCUUCUUUAGUAGAGACUGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGAUGGUCUCUAUCUCCUGACCUUGUGAUCUGCCUGCCUCAGCUUCCCAAAGUGCUGAGAUGACAGGUGUGAGCCAUCAGACCCAGCAUUUUUUUUUUUAAUUUAAAUUUAAAUUUUUUUUCAUUUUUUUGAGAGGUUUUUUUUGUUUUGUUUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUUUUGAGACAGUCUUGCUCUGUCACCCAGGCUGGGAGUGCAGUGGCAUGAUCUCUGCAACCUCUACCUCCCAGGUUCAAGCAAUUCUUGUGCCUCAGCCUCCCAAGUAACUGGGACUACAGGUGCACGCUACCACACCUGGCUGAUUUUUUUUGUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCAACCAUGUUGCCCAGGUUGGUCUCAAACUCCUGAGCUCAGGCAAUCCACCCGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUAGGAUUACAGGUGUGAGCCACCACACCCAGCUAUUUUUUCUUUCGUUUUUUAAUUUUAAAGUUGGGGGGGGGUCUCAAUUUGUUACCCUGGCUGGUCUCGAACUCCCGGACUUAAGCGAUCCUCUGGCUCCAAGCCCACUACCAGUCUCAGGUUUCUUUACUAAAAGAUCACUACCUUUUUUUCUCUUAUCUGCUGCCAUGUGAGAUGUGGCUUUCACCUUCCGCCAUGAUUGUGAGGCCUUCCCAGCCAUGUAGAACUGUAAGUCCAAUAAACCUCUUUUGUAAAUUAAAAAAAAAAAAUCACUAUUUAAGAUACUAGGAUGGAUUGUGACUGUUGAGGAGUACUUACAUAUCCUACAUUUGACUACAUUAUUUCCAAACCAAGUAUUCCAUCCAAAGGAACAUACUGCUAUCAUAGAGACCAAGGAGGGACUGUUUAAGGUUGCCAAGGUGAAGCGAGCUGAGAGGCUUUGUCCUCGUGCCAGUAACUCUGAAAUCUCUCUUAAUUCCUGCUGUCCAGGCAGCAGAAUGCCAUGGUUUCCCCAAGUAGGUAGCUGCUUUAGCAGUUAAAGCCCAAAUGUCUGUUCUGUUGAUCAGAGGUCUCUGAAUUUCUGAAGUGGUGUUUCGUUUCUGGUGACUGAGUUAAUCCUUUACAAUCCCUCUUGUAAAGUGUGCUAAUAGAAAGAAUCCACCUUUCAAAGCUGCAGAACCAGACCGUGCCCUAAAUUGACCAACGUAACUGAUGUGCCUCAGGAAGUCUCUUGCCAGCUGUCCCUGUGAAGACCCCCCUCCUCCCCCCCAGCUGCUGCCUUGCACACUGAAGCAUCUCAGACUGUGCAAAGCCGUGUAGUCAUCAAGACAGUAAAUCCCAGGGCUUGGUUAAGUGCUGUGUGAUAACUUGUUUGGAUGAGACUUAACUUAAAACCACUUACAAUAAACUUGGGAAACUACCGUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1069.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1142.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 1337.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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